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Biomarqueurs prédictifs de la réponse aux inhibiteurs de point de contrôle dans le cancer du sein triple négatif : une plateforme multiomique (PORTRAIT)

20 juin 2023 mis à jour par: Vall d'Hebron Institute of Oncology

Identification de biomarqueurs prédictifs de la réponse à la chimiothérapie et aux inhibiteurs de points de contrôle immunitaires dans le cancer du sein triple négatif précoce : une plateforme multiomique intégrative

Les patientes atteintes d'un cancer du sein triple négatif de stade II-III (TNBC) candidates à une chimiothérapie néoadjuvante (NACT) +/- inhibiteur de point de contrôle immunitaire (ICI) seront incluses. Plusieurs échantillons de différents tissus seront analysés à travers différents omiques pour établir des biomarqueurs prédictifs de réponse au traitement. Plusieurs algorithmes seront ensuite utilisés pour rechercher un algorithme prédictif intégratif qui intègre des entrées multiparamètres afin de développer un outil clinique pour aider les cliniciens dans le processus de prise de décision de traitement dans le TNBC.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

La combinaison de pembrolizumab, un inhibiteur de point de contrôle immunitaire (ICI), avec une chimiothérapie néoadjuvante (NACT) augmente la réponse pathologique complète (pCR) et la survie sans événement (EFS) chez les patientes atteintes d'un cancer du sein triple négatif précoce (eTNBC). Cependant, tous les patients ne bénéficient pas de la même manière d'un traitement qui peut avoir des événements indésirables (EI) pertinents.

Objectifs : (1) Établir des biomarqueurs prédictifs de la réponse à NACT + ICI dans eTNBC en corrélant les données provenant de différentes couches d'omiques réalisées dans différents tissus, ainsi que l'imagerie, avec pCR, EFS et la survie globale (OS). (2) Intégrer les données générées à partir de (1) et les données cliniques, et explorer des modèles prédictifs multivariés de réponse à NACT + ICI.

Méthodes : Les patients avec des candidats TNBC de stade II-III pour recevoir NACT +/- ICI seront inclus. Échantillons collectés et type d'analyse : (1) Tissu tumoral (de base et de la maladie résiduelle après NACT) : séquençage du génome entier (WGS) et RNA-Seq seront effectués (plate-forme de séquençage Hartwig et pipeline analytique), phénotypage immunitaire tissulaire (PD- lymphocytes infiltrant L1, T et B, entre autres) et analyse du microbiome (ARNr 16S) ; (2) Sang (avant et pendant NACT) : analyse de l'ADN tumoral circulant (ctDNA) (panel de gènes ciblés et WGS peu profond), séquençage et analyse du répertoire T-cell receptor beta (TCR-β) (kit ImmunoSeq hsTCRβ et immunoSEQ), et phénotypage des cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC); (3) Selles et salive (avant et pendant NACT) : analyse du microbiome (ARNr 16S) ; (4) Imagerie IRM du sein (avant et après NACT) : analyse radiomique. Plusieurs algorithmes, notamment l'apprentissage par noyau multiple, l'analyse factorielle multi-omique (MOFA) et la méthode d'intégration fonctionnelle des données spatiales et temporelles omiques (MEFISTO), seront ensuite utilisés pour rechercher un algorithme prédictif intégratif qui intègre des entrées multiparamètres. L'objectif est de fournir des estimations plus personnalisées de l'efficacité du traitement et du risque de rechute.

Résultat attendu : Développer un outil clinique pour aider les cliniciens dans le processus de prise de décision de traitement dans l'eTNBC, afin de maximiser les avantages et la qualité de vie du patient, tout en minimisant les EI et le fardeau financier pour le système de santé.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

100

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

      • Barcelona, Espagne, 08035
        • Recrutement
        • Vall d'Hebron Institute of Oncology
        • Contact:
          • Mafalda Oliveira, MD PhD
          • Numéro de téléphone: +34932543450
          • E-mail: moliveira@vhio.net

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Les patients avec des candidats TNBC de stade II-III pour recevoir NACT +/- ICI seront inclus

La description

Critère d'intégration:

  • TNBC histologiquement documenté (état négatif du récepteur 2 du facteur de croissance épidermique humain [HER2], du récepteur des œstrogènes [ER] et du récepteur de la progestérone [PgR])
  • Stade 2 - 3 défini par les critères de stadification de l'American Joint Committee of Cancer (AJCC) 8e édition pour le cancer du sein tel qu'évalué par l'investigateur sur la base d'une évaluation radiologique et/ou clinique
  • Le patient est un candidat pour recevoir NACT avec ou sans ICI tel qu'évalué par l'investigateur
  • Le patient a ≥ 18 ans au moment du consentement à participer à cet essai

Critère d'exclusion:

  • Maladie métastatique à l'imagerie (stade 4)

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Cohorte A
Pembrolizumab + chimiothérapie néoadjuvante
Le séquençage du génome entier (WGS) sera effectué dans le tissu tumoral à partir de la ligne de base et de la maladie résiduelle après la chimiothérapie néoadjuvante (NACT), le cas échéant.
Autres noms:
  • WGS
Le séquençage de l'ARN sera effectué dans le tissu tumoral à partir de la ligne de base et de la maladie résiduelle après NACT (le cas échéant).
L'analyse du microbiome sera effectuée dans les selles et la salive avant, pendant la NACT et à la fin du traitement systémique adjuvant si un traitement systémique adjuvant est cliniquement indiqué.
L'analyse de l'ADNc sera effectuée dans le plasma avant et pendant la NACT.
Le séquençage du répertoire TCR-β sera effectué dans le plasma avant et pendant la NACT.
Le phénotypage des PBMC sera effectué dans le plasma avant et pendant la NACT.
Le pembrolizumab sera administré en association avec le NACT standard.
Le NACT standard sera donné.
Autres noms:
  • Carboplatine, taxane, anthracycline, cyclophosphamide
Cohorte B
Chimiothérapie néoadjuvante
Le séquençage du génome entier (WGS) sera effectué dans le tissu tumoral à partir de la ligne de base et de la maladie résiduelle après la chimiothérapie néoadjuvante (NACT), le cas échéant.
Autres noms:
  • WGS
Le séquençage de l'ARN sera effectué dans le tissu tumoral à partir de la ligne de base et de la maladie résiduelle après NACT (le cas échéant).
L'analyse du microbiome sera effectuée dans les selles et la salive avant, pendant la NACT et à la fin du traitement systémique adjuvant si un traitement systémique adjuvant est cliniquement indiqué.
L'analyse de l'ADNc sera effectuée dans le plasma avant et pendant la NACT.
Le séquençage du répertoire TCR-β sera effectué dans le plasma avant et pendant la NACT.
Le phénotypage des PBMC sera effectué dans le plasma avant et pendant la NACT.
Le NACT standard sera donné.
Autres noms:
  • Carboplatine, taxane, anthracycline, cyclophosphamide

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Taux de réponse pathologique complète (pCR) à la chirurgie définitive
Délai: après traitement néoadjuvant et chirurgie, jusqu'à environ 27-30 semaines
Le taux (exprimé en pourcentage) de patientes avec une pCR lors de la chirurgie définitive en utilisant la définition de ypT0/Tis ypN0 (c. critères de mise en scène
après traitement néoadjuvant et chirurgie, jusqu'à environ 27-30 semaines
Survie sans événement (EFS)
Délai: Jusqu'à environ 60 mois
La SSE est définie comme le temps écoulé entre le début du traitement néoadjuvant et l'un des événements suivants : progression de la maladie qui exclut la chirurgie, récidive locale ou à distance, deuxième cancer primitif (sein ou autres cancers) ou décès quelle qu'en soit la cause
Jusqu'à environ 60 mois
Survie globale (SG)
Délai: Jusqu'à environ 60 mois
La SG est définie comme le temps écoulé entre le début du traitement néoadjuvant et le décès quelle qu'en soit la cause
Jusqu'à environ 60 mois
Identification de biomarqueurs pour prédire les résultats cliniques (pCR à la chirurgie définitive, EFS, OS).
Délai: Une fois toutes les données analysées, jusqu'à environ 60 mois

Les données cliniques (pCR à la chirurgie définitive, EFS, OS) seront intégrées aux résultats de la plateforme multiomique et des modèles prédictifs multivariés de réponse à la chimiothérapie néoadjuvante (NACT) + inhibiteur de point de contrôle immunitaire (ICI) seront explorés. Précisément, la plateforme multiomique analysera :

  1. Séquençage de l'ARN de la tumeur initiale et de la maladie résiduelle (si présente)
  2. analyse du microbiome de la salive et des matières fécales,
  3. analyse de l'ADN tumoral circulant (ctDNA) (panel de gènes ciblés et WGS superficiel),
  4. Phénotypage immunitaire tissulaire,
  5. Séquençage et analyse du répertoire du récepteur bêta des cellules T (TCR-β) à l'aide du kit ImmunoSeq hsTCRβ et immunoSEQ,
  6. Imagerie IRM mammaire (avant et après NACT),

Plusieurs algorithmes, notamment l'apprentissage par noyau multiple, l'analyse factorielle multi-omique (MOFA) et la méthode d'intégration fonctionnelle des données spatiales et temporelles omiques (MEFISTO), seront ensuite utilisés pour rechercher un algorithme prédictif intégratif qui intègre des entrées multiparamètres.

Une fois toutes les données analysées, jusqu'à environ 60 mois

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

13 janvier 2023

Achèvement primaire (Estimé)

1 décembre 2026

Achèvement de l'étude (Estimé)

1 décembre 2029

Dates d'inscription aux études

Première soumission

8 mai 2023

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

20 juin 2023

Première publication (Réel)

23 juin 2023

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

23 juin 2023

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

20 juin 2023

Dernière vérification

1 juin 2023

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

INDÉCIS

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Oui

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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