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检测患有脑肿瘤的儿童、青少年和年轻人的脑脊液中的无细胞肿瘤 DNA

2024年4月3日 更新者:Pediatric Brain Tumor Consortium

适用于患有原发性脑肿瘤的儿科、青少年和青年患者的脑脊液无细胞肿瘤 DNA (CSF cfDNA) 液体活检

最新的技术进步已允许检测游离 DNA (cfDNA)。 cfDNA 是肿瘤 DNA,可以在大脑和脊髓周围的液体(称为脑脊液或 CSF)以及脑肿瘤患者的血液中找到。 血液和脑脊液中 cfDNA 的检测被称为“液体活检”,并且是非侵入性的,这意味着它不需要对肿瘤组织进行手术或活检。 针对其他癌症类型的多项研究表明,cfDNA 可用于诊断、监测疾病对治疗的反应以及了解脑肿瘤随时间推移发生的基因变化。 研究医生希望通过研究儿童脑肿瘤患者的这些测试,他们将能够使用液体活检来代替对患者风险更大的测试,例如手术。

本研究未提供治疗。 作为常规护理一部分采集脑脊液样本的患者将被要求为本研究提供额外样本。 研究医生将为本研究额外收集至少一管 CSF(约 1 茶匙或 5 mL)。 如果患者医生认为安全,最多可以收集 2 管脑脊液(约 4 茶匙或最多 20 毫升)。 脑脊液将通过留置导管装置或通过插入患者脊柱下部的针(称为脊椎穿刺或腰椎穿刺)收集。

研究开始时将采集一次所需的血液样本(约 1/2 茶匙或 2 3 毫升)。 该样本将用于帮助确定脑脊液中发现的变化。 作为常规护理的一部分,将从患者的中心静脉导管或手臂采集血液。

如果有的话,将收集在脑脊液收集后 8 周内获得的可选肿瘤组织。 将比较导致肿瘤形成和生长的组织 DNA 变化与脑脊液 cfDNA 之间的相似性。 这将有助于了解是否可以使用脑脊液代替肿瘤组织进行诊断。 多达 300 人将参与这项研究。

这项研究将使用基因测试来识别脑脊液中基因的变化。 体细胞突变(仅在肿瘤中发现的突变)的报告将成为医疗记录的一部分。 cfDNA 测序的结果将与患者分享。 研究医生将讨论结果对患者以及患者的诊断和治疗意味着什么。 不会报告任何种系测序结果,并且这些结果不会透露给患者、患者的临床医生或记录在患者的病历中。 这项研究可能会对患者进行长达 5 年的监测。

研究概览

详细说明

这是一项针对患有原发性脑肿瘤的儿童和年轻人的多中心研究。 所有 21 岁的儿童和青少年/青年 (AYA) 患者均符合资格。 < 40 岁的 AYA 患者符合原发性脑肿瘤实体的资格,该实体在儿童中比成人更常见。 多达 300 人将参与这项研究。

儿童中枢神经系统 (CNS) 肿瘤代表多种疾病,并且仍然是儿童和青少年癌症相关死亡的主要原因。 过去几年,儿童中枢神经系统肿瘤的诊断和病理分类发生了巨大的转变。 分子生物标志物现已纳入治疗决策和临床试验设计。 因此,对疾病进行纵向分子监测的需求变得越来越明显。 获取儿科中枢神经系统恶性肿瘤的解剖学挑战,加上分子亚分类和分子靶向治疗的发展,导致迫切需要开发一种非侵入性方法来重复采样这些肿瘤。 这将能够:1)诊断手术无法触及的肿瘤; 2) 纵向监测肿瘤的分子变化,包括进展和/或复发时; 3) 开发非侵入性方法来监测治疗反应。 最新的技术进步使得能够检测无细胞肿瘤 DNA (cfDNA),即通过称为“液体活检”的过程流入脑肿瘤患者脑脊液 (CSF) 和血液中的肿瘤 DNA 小片段。

基于成人神经胶质瘤患者成功的初步研究,这项由小儿脑肿瘤联盟 (PBTC) 赞助的项目将尝试将 CSF cfDNA 液体活检整合到整个 PBTC 的小儿脑肿瘤患者的临床护理中,以增强肿瘤诊断/分子亚分类和指导治疗决策。 这将通过集中收集和处理来自 PBTC 成员站点的各种儿童 CNS 肿瘤患者的 CSF cfDNA 样本来实现。 主要目标是研究匹配对中 CSF cfDNA 改变和肿瘤 DNA 改变之间的一致性,以了解:1) 匹配样本之间的一致性; 2)不同肿瘤类型随时间发生的基因组进化。 此外,本研究的次要目标和探索性目标旨在汇总各种类型儿科原发性脑肿瘤的数据,以了解不同疾病类型和疾病不同阶段的 CSF cfDNA 分子分析的成功率,并阐明CSF cfDNA 分析在指导临床决策中的作用。

本研究的主要目的是评估 8 周内收集的样本中肿瘤组织与脑脊液无细胞 DNA (CSF cfDNA) 中检测到的突变的一致性;确定克隆突变是否可能在样本类型之间共享。

作为常规护理一部分采集脑脊液样本的患者将被要求为本研究提供额外样本。 研究医生将为本研究额外收集至少一管 CSF(约 1 茶匙或 5 mL)。 如果患者的医生认为安全,最多可以收集 2 管 CSF(约 4 茶匙或最多 20 mL)。 研究开始时将采集一次所需的血液样本(约 1/2 茶匙或 2 3 毫升)。 如果有的话,将收集在脑脊液收集后 8 周内获得的可选肿瘤组织。 本研究未提供治疗。

研究类型

观察性的

注册 (估计的)

300

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习联系方式

研究联系人备份

学习地点

    • New York
      • New York、New York、美国、10065
        • Memorial Sloan Kettering Cancer Center
    • Pennsylvania
      • Pittsburgh、Pennsylvania、美国、15224
        • Children's Hospital of Pittsburgh of UPMC

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

  • 孩子
  • 成人

接受健康志愿者

取样方法

非概率样本

研究人群

患者将从儿科脑肿瘤联盟站点报名并就诊,并满足参与资格标准。

描述

纳入标准:

所有患者必须有原发性脑肿瘤的已知或疑似诊断(基于病理学或影像学)。 所有年龄< 21 岁的儿童和青少年/青年 (AYA) 患者均符合资格。

< 40 岁的 AYA 患者符合原发性脑肿瘤实体的资格,该实体在儿童中比成人更常见。 这包括:

  • 髓母细胞瘤
  • 非髓母细胞瘤胚胎性脑肿瘤
  • 非典型畸胎瘤样横纹肌样瘤(ATRT)
  • 室管膜瘤
  • 中枢神经系统生殖细胞肿瘤
  • 弥漫性中线神经胶质瘤,H3K27M 改变
  • 弥漫性半球神经胶质瘤,H3 G34 突变
  • 松果体母细胞瘤
  • 弥漫性软脑膜胶质神经元肿瘤
  • 弥漫性脑干胶质瘤
  • 毛细胞性星形细胞瘤
  • 脉络丛癌

符合资格的患者将根据诊断进行分层,如下所示:

  • 第 1 层:髓母细胞瘤
  • 第 2 层:高级别胶质瘤(IDH 野生型)和 DIPG

    o DIPG 患者必须满足 DIPG 诊断的临床和影像学要求。 新诊断的弥漫性内源性脑桥胶质瘤 (DIPG) 患者,定义为脑桥中心为弥漫性受累且 2/5 或更多脑桥的肿瘤,无需组织学证实即可入组。 不符合这些标准或不被认为是典型的内在脑桥神经胶质瘤的脑干肿瘤患者只有在肿瘤经过活检并被证明是间变性星形细胞瘤、多形性胶质母细胞瘤、胶质肉瘤、间变性混合性胶质瘤或纤维性星形细胞瘤。

  • 第 3 层:低级别胶质瘤(IDH 野生型)
  • 第 4 层:弥漫性软脑膜胶质神经元肿瘤
  • 第 5 层:松果体母细胞瘤
  • 第 6 层:所有其他符合条件的肿瘤类型
  • 疾病状况:参与者在任何疾病阶段都有资格参加。
  • 年龄:所有年龄< 21 岁的儿童和青少年/青年 (AYA) 患者均符合资格。 < 40 岁的 AYA 患者符合原发性脑肿瘤实体的资格,该实体在儿童中比成人更常见
  • 脑脊液 (CSF) 采集:患者必须具有至少一项 CSF(腰椎、脑池或脑室)采集的临床指征,或 CSF 采样可行且无风险或风险极小的临床情况(例如,内镜下第三脑室造口术、脑室外引流) )。
  • 知情同意:患者或家长/监护人能够理解该同意,并愿意根据机构指南签署书面知情同意文件。

排除标准:不适用(纳入标准很全面)。

-

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

队列和干预

团体/队列
第 1 层:髓母细胞瘤
第 1 组的参与者必须诊断为髓母细胞瘤。 所有 21 岁以下的儿童和青少年/青年 (AYA) 患者均符合资格。 < 40 岁的 AYA 患者符合原发性脑肿瘤实体的资格,该实体在儿童中比成人更常见。
第 2 层:高级别胶质瘤(IDH 野生型)或弥漫性内源性脑桥胶质瘤
第 2 组的参与者必须诊断为高级别胶质瘤(IDH 野生型)或弥漫性内源性桥脑胶质瘤 (DIPG)。 所有 21 岁以下的儿童和青少年/青年 (AYA) 患者均符合资格。 < 40 岁的 AYA 患者符合原发性脑肿瘤实体的资格,该实体在儿童中比成人更常见。 DIPG 患者必须满足 DIPG 诊断的临床和影像学要求。 新诊断的 DIPG 患者(定义为脑桥震中且弥漫性累及 2/5 或更多脑桥的肿瘤)无需组织学证实即可入组。 不符合这些标准或不被认为是典型的内在脑桥神经胶质瘤的脑干肿瘤患者只有在肿瘤经过活检并被证明是间变性星形细胞瘤、多形性胶质母细胞瘤、神经胶质肉瘤、间变性混合神经胶质瘤或纤维性星形细胞瘤。
第 3 层:低级别胶质瘤(IDH 野生型)
第 3 组的参与者必须诊断为低度恶性胶质瘤(IDH 野生型)。 所有年龄< 21 岁的儿童和青少年/青年 (AYA) 患者均符合资格。 < 40 岁的 AYA 患者符合原发性脑肿瘤实体的资格,该实体在儿童中比成人更常见。
第 4 层:弥漫性软脑膜胶质神经元肿瘤
第 4 组的参与者必须诊断为弥漫性软脑膜胶质神经元肿瘤。 所有年龄< 21 岁的儿童和青少年/青年 (AYA) 患者均符合资格。 < 40 岁的 AYA 患者符合原发性脑肿瘤实体的资格,该实体在儿童中比成人更常见。
第 5 层:松果体母细胞瘤
第 5 组的参与者必须诊断为松果体母细胞瘤。 所有年龄< 21 岁的儿童和青少年/青年 (AYA) 患者均符合资格。 < 40 岁的 AYA 患者符合原发性脑肿瘤实体的资格,该实体在儿童中比成人更常见。
第 6 层:所有其他符合条件的原发性脑肿瘤类型
第 6 组的参与者必须诊断出所有其他符合条件的原发性脑肿瘤类型。 所有年龄< 21 岁的儿童和青少年/青年 (AYA) 患者均符合资格。 < 40 岁的 AYA 患者符合原发性脑肿瘤实体的资格,该实体在儿童中比成人更常见。

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
肿瘤组织与脑脊液中突变的一致性
大体时间:3个月
在具有配对样本的特定组织学中,估计 8 周内收集的样本中肿瘤组织与脑脊液无细胞 DNA (CSF cfDNA) 中检测到的突变的一致性。
3个月

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
估计与各种疾病状态相关的不同类型儿科 CNS 肿瘤中 CSF cfDNA 的检测频率。
大体时间:3个月
患者体内匹配的脑脊液和组织样本将针对每个致癌改变进行总结,并分为阳性与阴性。
3个月
跟踪并估计 CSF cfDNA 水平与不同疾病类型的临床和影像标准确定的疾病反应之间的相关性。
大体时间:3个月
CfDNA 数量与标准临床和影像疾病反应之间的关联将通过 Wilcoxon 秩和或 Spearman 相关性进行评估。
3个月

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 学习椅:Alexandra Miller, MD, PhD、Memorial Sloan Kettering Cancer Center

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2023年7月12日

初级完成 (估计的)

2027年7月12日

研究完成 (估计的)

2028年7月12日

研究注册日期

首次提交

2023年6月28日

首先提交符合 QC 标准的

2023年6月28日

首次发布 (实际的)

2023年7月7日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2024年4月5日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2024年4月3日

最后验证

2024年4月1日

更多信息

与本研究相关的术语

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

是的

IPD 计划说明

儿科脑肿瘤联盟 (PBTC) 确保将 PBTC 样本生成的高维分子数据提交给 NIH 基因型和表型数据库 (dbGaP) 或其他 NIH 指定的数据存储库。 PBTC 需要向其他研究人员提供数据以用于研究项目。 要求从已发表的 PBTC 研究中获取数据的研究者将提交一份提案,描述需要提供数据的研究、所请求的数据以及该项目及其附属机构的研究者名单,以及研究者的简历,供 PBTC 指导委员会审查。 一旦获得批准,提出请求的研究者将被要求在发布去识别化数据之前完成数据传输协议。 通常只有在主要研究手稿发表后才会考虑数据请求,但如果主要研究数据发表长时间延迟,可能会出现例外情况。

IPD 共享时间框架

发布后 6 个月,结束期限可能长达 10 年。

IPD 共享支持信息类型

  • 研究方案
  • 国际碳纤维联合会
  • 企业社会责任

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

研究美国 FDA 监管的设备产品

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