宏基因组 NGS 诊断肺炎的随机试验
2025年11月16日 更新者：National Taiwan University Hospital
将宏基因组下一代测序纳入肺炎治疗对诊断效率和结果的影响：随机对照试验
在这项随机对照试验中，我们的目的是评估将 mNGS 纳入肺炎管理中对致病病原体识别的效率和准确性、接受有效抗菌治疗的参与者比例、住院时间和死亡率的效果。
研究概览
详细说明
这是一项开放标签、随机、多中心、2 期研究，将评估将 mNGS 纳入重症肺炎管理中的功效，以实现明确诊断、确定肺炎病原体、适当的抗菌治疗和患者的准确性和效率。结果。 肺炎的诊断需要有肺炎的放射学证据，并且至少满足以下临床标准中的两项：新发或加重的咳嗽、新发或加重的咳痰、新发或加重的呼吸困难、咯血、胸膜炎性胸痛和发热（≥38.0°C） ）。 重症肺炎被定义为伴有低氧血症的肺炎，需要经口气管插管和机械通气支持。
招募时需要获得符合条件的受试者或其法定监护人的书面知情同意书。 完成知情同意后，受试者将通过基于网络的随机化系统以 1:1 的分配比例进行随机分配，以接受标准护理 (SOC)，使用基于培养和血清学的病原体检测检查或 SOC 以及使用 APGseq 的附加 mNGS 方法®（Asia Pathogenomics，台湾新北市）用于病原体检测。 肺炎的治疗建议遵循2018年发布的台湾肺炎管理指南。 随机分组后，将对受试者进行随访直至死亡、出院或随机分组后 28 天，以先到者为准。 从第一个受试者入组到最终分析，总研究持续时间预计为两年。
研究类型
介入性
注册 (实际的)
114
阶段
- 不适用
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
-
-
-
Taipei、台湾
- National Taiwan University Hospital
-
-
参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
不
描述
纳入标准：
- 向 ICU 提出肺炎诊断（符合放射学和临床标准）
- 年龄≥18岁的成年人
- 经口气管插管
- 入住 ICU 时间<24 小时
- 入住 ICU 时 APACHE II 评分 <35
排除标准：
- 预期寿命低于 4 周
- 现有指令禁止维持生命治疗
- 患者不愿意或无法在入住 ICU 时提供下呼吸道样本
- 之前的检查已确定了可以解释肺炎指数事件的特定病原体
- 筛选前已进行多重 PCR 或 NGS 检测以进行病原体检测
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
- 主要用途：诊断
- 分配：随机化
- 介入模型：并行分配
- 屏蔽：无（打开标签）
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
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有源比较器：标准护理组
患者入ICU后尽快采集气管内抽吸物、血样、尿样和鼻咽拭子。
使用标准技术对血液样本和气管内抽吸物进行细菌培养。
尿抗原检测用于检测嗜肺军团菌和肺炎链球菌。
对鼻咽拭子进行 PCR 检测，检测甲型和乙型流感病毒以及 SARS-CoV-2 病毒。
真菌或分枝杆菌检测，以及是否使用多重 PCR 进行病原体检测（例如 FilmArray 系统）由医生自行决定。
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患者入ICU后尽快采集气管内抽吸物、血样、尿样和鼻咽拭子。
使用标准技术对血液样本和气管内抽吸物进行细菌培养。
尿抗原检测用于检测嗜肺军团菌和肺炎链球菌。
对鼻咽拭子进行 PCR 检测，检测甲型和乙型流感病毒以及 SARS-CoV-2 病毒。
真菌或分枝杆菌检测，以及是否使用多重 PCR 进行病原体检测（例如 FilmArray 系统）由医生自行决定。
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实验性的：下一代测序组
分配到 mNGS 组的受试者将按照标准护理组中使用的方案接受病因学检查，并对标准检查同时采集的两份微型支气管肺泡灌洗液样本和一份血液样本样本进行额外的 mNGS 测试。
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将使用 APGseq ®（亚洲病原组学，台湾新北市）对气道和血液样本进行用于病原体鉴定的宏基因组 NGS 测试。
mNGS 测试的样品制备如下：将 5-10 mL 全血在 4°C 下以 1,600g 离心 10 分钟以分离血浆。
将血浆样品转移至 2 mL 无菌管中用于后续 DNA 或 RNA 提取。
一般情况下，300ul血浆样本用于DNA提取。
使用基于柱的方法（例如，
QIAamp DNA 微生物组试剂盒，Qiagen，用于 DNA 提取；或 QIAamp Viral RNA Mini Kit，分别用于 RNA 提取的 Qiagen），遵循制造商的操作手册。
使用SuperScript II逆转录试剂盒(Invitrogen)将RNA逆转录并合成为双链互补DNA(ds cDNA)。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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在改良意向治疗 (mITT) 分析中实现明确诊断的时间。
大体时间：7天
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在准确识别肺炎致病病原体方面实现明确诊断的累积概率，通过 Kaplan-Meier 方法在改良意向治疗 (mITT) 分析中在 7 天的时间范围内估计。
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7天
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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在意向治疗分析中实现明确诊断的时间。
大体时间：7天
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测试主要研究终点的 mITT 分析与标准 ITT 分析相比的稳健性。
（敏感性分析）
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7天
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第 72 小时两组之间的病原体检出率。
大体时间：72小时
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MITT 分析中随机分组后 72 小时内准确诊断出肺炎病原体的参与者比例。
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72小时
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研究结束时两组之间的病原体检出率。
大体时间：28天
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MITT 分析中随机分组后第 28 天准确诊断肺炎病原体的参与者比例。
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28天
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MNGS 对适当抗生素处方的影响。
大体时间：72小时
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MITT 分析中随机分组后第 72 小时接受有效抗菌治疗的参与者比例。
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72小时
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MITT 分析中的 28 天死亡率。
大体时间：28天
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使用 mITT 队列绘制 28 天生存率的 Kaplan-Meier 曲线。
对数秩检验用于检验统计显着性。
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28天
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ITT 分析中的 28 天死亡率（总队列）。
大体时间：28天
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使用总队列的 28 天生存 Kaplan-Meier 曲线。
对数秩检验用于检验统计显着性。
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28天
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MNGS 对 ICU 住院时间的影响
大体时间：ICU出院或28天
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使用 Fine-Gray 模型随机化后 28 天内 ICU 存活出院曲线。
死亡将被视为一种竞争风险。
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ICU出院或28天
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mNGS对呼吸及死亡率结局的影响。
大体时间：28天
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使用mITT队列的28天内无呼吸机天数。
采用Wilcoxon秩和检验进行统计学显著性检验。
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28天
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
调查人员
- 首席研究员：Sheng-Yuan Ruan, MD、National Taiwan University Hospital
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2023年8月7日
初级完成 (实际的)
2025年5月20日
研究完成 (估计的)
2025年11月30日
研究注册日期
首次提交
2023年7月30日
首先提交符合 QC 标准的
2023年7月30日
首次发布 (实际的)
2023年8月7日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2025年11月19日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2025年11月16日
最后验证
2025年11月1日
更多信息
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