Randomizowana próba metagenomicznego NGS w diagnostyce zapalenia płuc
16 listopada 2025 zaktualizowane przez: National Taiwan University Hospital
Wpływ włączenia sekwencjonowania metagenomicznego nowej generacji w leczeniu zapalenia płuc na skuteczność i wyniki diagnostyczne: randomizowana, kontrolowana próba
W tym randomizowanym kontrolowanym badaniu naszym celem jest ocena skuteczności włączenia mNGS w leczeniu zapalenia płuc pod względem skuteczności i dokładności identyfikacji patogenu sprawczego, odsetka uczestników ze skuteczną terapią przeciwdrobnoustrojową, długości hospitalizacji i śmiertelności.
Przegląd badań
Status
Aktywny, nie rekrutujący
Warunki
Szczegółowy opis
Jest to otwarte, randomizowane, wieloośrodkowe badanie fazy 2, które oceni skuteczność włączenia mNGS w leczeniu ciężkiego zapalenia płuc pod względem dokładności i skuteczności uzyskania ostatecznej diagnozy w celu identyfikacji patogenów powodujących zapalenie płuc, odpowiedniej terapii przeciwbakteryjnej i pacjenta wyniki. Rozpoznanie zapalenia płuc wymaga radiologicznego potwierdzenia zapalenia płuc i spełnienia co najmniej dwóch z następujących kryteriów klinicznych: nowy lub nasilony kaszel, nowy lub nasilony odkrztuszanie plwociny, nowy lub nasilony duszność, krwioplucie, opłucnowy ból w klatce piersiowej i gorączka (≥ 38,0°C). ). Ciężkie zapalenie płuc definiuje się jako zapalenie płuc z hipoksemią wymagające intubacji ustno-tchawiczej i wspomagania wentylacji mechanicznej.
Wymagana jest pisemna świadoma zgoda kwalifikujących się osób lub ich opiekunów prawnych w momencie rekrutacji. Po wyrażeniu świadomej zgody, uczestnicy zostaną losowo przydzieleni ze stosunkiem alokacji 1:1 za pośrednictwem internetowego systemu randomizacji, aby otrzymać standardową opiekę (SOC) przy użyciu hodowli i badań serologicznych w celu wykrycia patogenu lub SOC z dodatkową metodą mNGS przy użyciu APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Tajwan) do wykrywania patogenów. Leczenie zapalenia płuc jest sugerowane zgodnie z Tajwańskimi wytycznymi dotyczącymi postępowania w zapaleniu płuc opublikowanymi w 2018 r. Po randomizacji osoby będą obserwowane aż do śmierci, wypisu ze szpitala lub 28 dni po randomizacji, w zależności od tego, co nastąpi wcześniej. Oczekuje się, że całkowity czas trwania badania wyniesie dwa lata od pierwszego uczestnika do ostatecznej analizy.
Typ studiów
Interwencyjne
Zapisy (Rzeczywisty)
114
Faza
- Nie dotyczy
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Lokalizacje studiów
-
-
-
Taipei, Tajwan
- National Taiwan University Hospital
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Nie
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Przyjęcie na OIT z rozpoznaniem zapalenia płuc (spełnione zarówno kryteria radiologiczne, jak i kliniczne)
- Dorośli w wieku ≥18 lat
- Zaintubowany ustno-tchawiczo
- Przyjęcie na OIOM na <24 godziny
- Wynik APACHE II <35 przy przyjęciu na OIOM
Kryteria wyłączenia:
- Oczekiwana długość życia poniżej 4 tygodni
- Z istniejącą dyrektywą o wstrzymaniu leczenia podtrzymującego życie
- Pacjenci, którzy nie chcą lub nie są w stanie pobrać próbki z dolnych dróg oddechowych przy przyjęciu na OIOM
- Wcześniejsze prace pozwoliły zidentyfikować określone patogeny, które mogą odpowiadać za zdarzenie indeksowe zapalenia płuc
- Testy Multiplex PCR lub NGS zostały wykonane w celu wykrycia patogenu przed badaniem przesiewowym
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Główny cel: Diagnostyczny
- Przydział: Randomizowane
- Model interwencyjny: Przydział równoległy
- Maskowanie: Brak (otwarta etykieta)
Broń i interwencje
Grupa uczestników / Arm |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Aktywny komparator: Standardowa grupa opieki
Aspiraty z tchawicy, próbki krwi, próbki moczu i wymazy z nosogardzieli pobrano od pacjentów tak szybko, jak to możliwe po przyjęciu na OIOM.
Hodowlę bakterii przeprowadzono standardowymi technikami z próbek krwi i aspiratów z tchawicy.
Wykrywanie antygenu w moczu przeprowadzono w celu wykrycia L. pneumophila i S. pneumoniae.
Test PCR przeprowadzono na wymazach z jamy nosowo-gardłowej w celu wykrycia wirusów grypy A i B oraz wirusów SARS-CoV-2.
Wykrywanie grzybów lub mykobakterii oraz to, czy stosować multipleksową reakcję PCR do wykrywania patogenów, taką jak system FilmArray, określano według uznania lekarzy.
|
Aspiraty z tchawicy, próbki krwi, próbki moczu i wymazy z nosogardzieli pobrano od pacjentów tak szybko, jak to możliwe po przyjęciu na OIOM.
Hodowlę bakterii przeprowadzono standardowymi technikami z próbek krwi i aspiratów z tchawicy.
Wykrywanie antygenu w moczu przeprowadzono w celu wykrycia L. pneumophila i S. pneumoniae.
Test PCR przeprowadzono na wymazach z jamy nosowo-gardłowej w celu wykrycia wirusów grypy A i B oraz wirusów SARS-CoV-2.
Wykrywanie grzybów lub mykobakterii oraz to, czy stosować multipleksową reakcję PCR do wykrywania patogenów, taką jak system FilmArray, określano według uznania lekarzy.
|
|
Eksperymentalny: grupa mNGS
Osoby przydzielone do grupy mNGS zostaną poddane badaniu etiologicznemu zgodnie z protokołem stosowanym w grupie opieki standardowej oraz dodatkowym testom mNGS dla dwóch próbek popłuczyn mini-oskrzelowo-pęcherzykowych i jednej próbki próbek krwi pobranych w tym samym czasie standardowej obróbki.
|
Testy metagenomiczne NGS w celu identyfikacji patogenów zostaną przeprowadzone dla próbek dróg oddechowych i krwi przy użyciu APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Tajwan).
Przygotowanie próbki do badania mNGS było następujące: 5-10 ml krwi pełnej odwirowano przy 1600 g przez 10 minut w temperaturze 4°C w celu oddzielenia osocza.
Próbki osocza przenoszono do sterylnych probówek o pojemności 2 ml w celu dalszej ekstrakcji DNA lub RNA.
Na ogół do ekstrakcji DNA stosowano 300 ul próbki osocza.
Całkowity genomowy DNA z próbek ekstrahowano metodą kolumnową (np.
QIAamp DNA Microbiome Kit, Qiagen do ekstrakcji DNA; lub QIAamp Viral RNA Mini Kit, Qiagen do ekstrakcji RNA), zgodnie z instrukcją obsługi producenta.
RNA poddano odwrotnej transkrypcji i zsyntetyzowano do dwuniciowego komplementarnego DNA (ds cDNA) za pomocą zestawu SuperScript II Reverse Transcription Kit (Invitrogen).
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Czas do uzyskania ostatecznej diagnozy w zmodyfikowanej analizie zamiaru leczenia (mITT).
Ramy czasowe: 7 dni
|
Skumulowane prawdopodobieństwo uzyskania ostatecznego rozpoznania w zakresie dokładnej identyfikacji patogenów powodujących zapalenie płuc, oszacowane metodą Kaplana-Meiera w przedziale czasowym 7 dni w zmodyfikowanej analizie zamiaru leczenia (mITT).
|
7 dni
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Czas na postawienie ostatecznej diagnozy w analizie zamiaru leczenia.
Ramy czasowe: 7 dni
|
Aby przetestować solidność analizy mITT dla głównego punktu końcowego badania w porównaniu ze standardową analizą ITT.
(Analiza wrażliwości)
|
7 dni
|
|
Szybkość wykrywania patogenu między dwiema grupami do 72. godziny.
Ramy czasowe: 72 godziny
|
Odsetek uczestników z dokładną diagnozą patogenów wywołujących zapalenie płuc do 72 godziny po randomizacji w analizie mITT.
|
72 godziny
|
|
Wskaźnik wykrywalności patogenów między dwiema grupami do końca badania.
Ramy czasowe: 28 dni
|
Odsetek uczestników z dokładną diagnozą patogenów powodujących zapalenie płuc do dnia 28 po randomizacji w analizie mITT.
|
28 dni
|
|
Wpływ mNGS na właściwe przepisywanie antybiotyków.
Ramy czasowe: 72 godziny
|
Odsetek uczestników skutecznej terapii przeciwdrobnoustrojowej do 72 godziny po randomizacji w analizie mITT.
|
72 godziny
|
|
28-dniowa śmiertelność w analizie mITT.
Ramy czasowe: 28 dni
|
Krzywe Kaplana-Meiera 28-dniowego przeżycia przy użyciu kohorty mITT.
Testy log-rank służą do testowania istotności statystycznej.
|
28 dni
|
|
28-dniowa śmiertelność w analizie ITT (całkowita kohorta).
Ramy czasowe: 28 dni
|
Krzywe Kaplana-Meiera 28-dniowego przeżycia przy użyciu całej kohorty.
Testy log-rank służą do testowania istotności statystycznej.
|
28 dni
|
|
Wpływ mNGS na długość pobytu na OIT
Ramy czasowe: Wypis z OIOM lub 28 dni
|
Krzywe wypisu żywych z OIOM w 28 dni po randomizacji przy użyciu modelu Fine-Gray.
Śmierć będzie traktowana jako konkurencyjne ryzyko.
|
Wypis z OIOM lub 28 dni
|
|
Wpływ mNGS na wyniki oddechowe i śmiertelność.
Ramy czasowe: 28 dni
|
Dni bez wentylacji mechanicznej w ciągu 28 dni w kohorcie mITT.
Do testowania istotności statystycznej zastosowano test sumy rang Wilcoxona.
|
28 dni
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Śledczy
- Główny śledczy: Sheng-Yuan Ruan, MD, National Taiwan University Hospital
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
7 sierpnia 2023
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
20 maja 2025
Ukończenie studiów (Szacowany)
30 listopada 2025
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
30 lipca 2023
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
30 lipca 2023
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
7 sierpnia 2023
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
19 listopada 2025
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
16 listopada 2025
Ostatnia weryfikacja
1 listopada 2025
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 202305104RINB
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
NIE
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
produkt wyprodukowany i wyeksportowany z USA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .