Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

En randomiserad studie av metagenomisk NGS för diagnos av lunginflammation

16 november 2025 uppdaterad av: National Taiwan University Hospital

Effekten av att införliva metagenomisk nästa generations sekvensering i hanteringen av lunginflammation på diagnostisk effektivitet och resultat: en randomiserad kontrollerad studie

I denna randomiserade kontrollerade studie syftar vi till att utvärdera effektiviteten av att införliva mNGS i hanteringen av lunginflammation på effektivitet och noggrannhet av kausativ patogen identifiering, andelen deltagare med effektiv antimikrobiell terapi, längd på sjukhusvistelse och dödlighet.

Studieöversikt

Detaljerad beskrivning

Detta är en öppen, randomiserad, multicenter, fas 2-studie som kommer att utvärdera effektiviteten av att införliva mNGS i hanteringen av svår lunginflammation på noggrannhet och effektivitet för att uppnå en bestämd diagnos för att identifiera orsakande patogener till lunginflammation, lämplig antimikrobiell terapi och patient. resultat. Diagnosen lunginflammation kräver radiologiska bevis på lunginflammation och minst två av följande kliniska kriterier: ny eller förvärrad hosta, ny eller försämrad upphostning av sputum, ny eller förvärrad dyspné, hemoptys, pleuritisk bröstsmärta och feber (≥38,0°C) ). Allvarlig lunginflammation definieras som lunginflammation med hypoxemi som kräver orotrakeal intubation och mekaniskt ventilationsstöd.

Skriftligt informerat samtycke krävs från de kvalificerade försökspersonerna eller från deras vårdnadshavare vid tidpunkten för rekryteringen. Efter att ha fyllt i informerat samtycke kommer försökspersoner att randomiseras med ett tilldelningsförhållande på 1:1 via ett webbaserat randomiseringssystem för att få standardvård (SOC) med användning av kultur- och serologibaserad upparbetning för patogendetektion eller SOC med ytterligare mNGS-metod med APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan) för patogendetektion. Behandlingen av lunginflammation föreslås enligt Taiwans riktlinjer för hantering av lunginflammation som publicerades 2018. Efter randomisering kommer försökspersonerna att följas fram till döden, utskrivna från sjukhuset eller 28 dagar efter randomiseringen beroende på vad som kommer först. Den totala studietiden förväntas vara två år från det första ämnet registreras till den slutliga analysen.

Studietyp

Interventionell

Inskrivning (Faktisk)

114

Fas

  • Inte tillämpbar

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

      • Taipei, Taiwan
        • National Taiwan University Hospital

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

  • Vuxen
  • Äldre vuxen

Tar emot friska volontärer

Nej

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  1. Presentera till ICU med en diagnos av lunginflammation (uppfylld med både radiografiska och kliniska kriterier)
  2. Vuxna i åldern ≥18 år
  3. Orotrakealt intuberad
  4. Inläggning på intensivvårdsavdelning <24 timmar
  5. APACHE II-poäng <35 på intensivvårdsinläggning

Exklusions kriterier:

  1. Förväntad livslängd under 4 veckor
  2. Med ett befintligt direktiv att avstå från livsuppehållande behandling
  3. Patienter som inte vill eller kan ge ett prov från de nedre luftvägarna vid intensivvårdsinläggning
  4. Tidigare upparbetning har identifierat specifika patogener som kan förklara indexhändelsen av lunginflammation
  5. Multiplex PCR- eller NGS-testning har gjorts för att upptäcka patogener före screening

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Primärt syfte: Diagnostisk
  • Tilldelning: Randomiserad
  • Interventionsmodell: Parallellt uppdrag
  • Maskning: Ingen (Open Label)

Vapen och interventioner

Deltagargrupp / Arm
Intervention / Behandling
Aktiv komparator: Standardvårdsgrupp
Endotrakeala aspirater, blodprover, urinprover och nasofarynxprover erhölls från patienterna så snart som möjligt efter intensivvårdsinläggning. Bakterieodling utfördes, med användning av standardtekniker, på blodprover och endotrakeala aspirater. Urinantigendetektering utfördes för detektion av L. pneumophila och S. pneumoniae. En PCR-analys utfördes på nasofaryngeala pinnprover för detektering av influensa A- och B-virus och SARS-CoV-2-virus. Svamp- eller mykobakteriella detektioner och huruvida multiplex PCR skulle användas för patogendetektering, såsom FilmArray-systemet, bestämdes efter läkarnas gottfinnande.
Endotrakeala aspirater, blodprover, urinprover och nasofarynxprover erhölls från patienterna så snart som möjligt efter intensivvårdsinläggning. Bakterieodling utfördes, med användning av standardtekniker, på blodprover och endotrakeala aspirater. Urinantigendetektering utfördes för detektion av L. pneumophila och S. pneumoniae. En PCR-analys utfördes på nasofaryngeala pinnprover för detektering av influensa A- och B-virus och SARS-CoV-2-virus. Svamp- eller mykobakteriella detektioner och huruvida multiplex PCR skulle användas för patogendetektering, såsom FilmArray-systemet, bestämdes efter läkarnas gottfinnande.
Experimentell: mNGS-grupp
Försökspersoner som tilldelats mNGS-gruppen kommer att få etiologisk bearbetning enligt det protokoll som används i standardvårdsgruppen och ytterligare mNGS-testning för två prover av mini-bronkoalveolär sköljning och ett prov av blodprov som hämtas samtidigt med standardupparbetningen.
Metagenomisk NGS-testning för patogenidentifiering kommer att göras för luftvägs- och blodprover med APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan). Provberedningen för mNGS-testning var som följer: 5-10 ml helblod centrifugerades vid 1 600 g under 10 minuter vid 4°C för att separera plasman. Plasmaprover överfördes till 2 ml sterila rör för följande DNA- eller RNA-extraktion. I allmänhet användes 300 ul plasmaprov för DNA-extraktion. Totalt genomiskt DNA från prover extraherades med användning av den kolonnbaserade metoden (t.ex. QIAamp DNA Microbiome Kit, Qiagen för DNA-extraktion; eller QIAamp Viral RNA Mini Kit, Qiagen för RNA-extraktion, respektive), enligt tillverkarens bruksanvisning. RNA:t omvänt transkriberades och syntetiserades till dubbelsträngat komplementärt DNA (ds cDNA) med SuperScript II Reverse Transcription Kit (Invitrogen).

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Dags att uppnå en säker diagnos i modifierad intention-to-treat (mITT) analys.
Tidsram: 7 dagar
Kumulativ sannolikhet för att uppnå en säker diagnos i termer av exakt identifiering av orsakande patogener till lunginflammation, uppskattad med Kaplan-Meier-metoden inom en tidsram av 7 dagar i modifierad intention-to-treat (mITT) analys.
7 dagar

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Dags att uppnå en säker diagnos i intention-to-treat-analys.
Tidsram: 7 dagar
För att testa robustheten hos mITT-analys för den primära studiens effektmått jämfört med standard ITT-analys. (Känslighetsanalys)
7 dagar
Patogendetekteringshastighet mellan två grupper vid den 72:e timmen.
Tidsram: 72 timmar
Andel deltagare med exakt diagnos för de orsakande patogenerna av lunginflammation senast den 72:e timmen efter randomisering i mITT-analys.
72 timmar
Patogendetekteringshastighet mellan två grupper vid slutet av studien.
Tidsram: 28 dagar
Andel deltagare med exakt diagnos för de orsakande patogenerna av lunginflammation senast dag 28 efter randomisering i mITT-analys.
28 dagar
Inverkan av mNGS på lämplig antibiotikarecept.
Tidsram: 72 timmar
Andel deltagare på effektiv antimikrobiell terapi senast den 72:e timmen efter randomisering i mITT-analys.
72 timmar
28-dagars mortalitet i mITT-analys.
Tidsram: 28 dagar
Kaplan-Meier-kurvor för 28-dagars överlevnad med hjälp av mITT-kohort. Log-rank tester används för att testa statistisk signifikans.
28 dagar
28-dagars mortalitet i ITT-analys (total kohort).
Tidsram: 28 dagar
Kaplan-Meier-kurvor för 28-dagars överlevnad med hjälp av total kohort. Log-rank tester används för att testa statistisk signifikans.
28 dagar
Inverkan av mNGS på längden av ICU-vistelse
Tidsram: ICU-utskrivning eller 28 dagar
Kurvor av levande ICU-urladdning inom 28 dagar efter randomisering med Fine-Gray-modellen. Döden kommer att behandlas som en konkurrerande risk.
ICU-utskrivning eller 28 dagar
Effekten av mNGS på respiratoriska utfall och dödlighet.
Tidsram: 28 dagar
Antal dagar utan ventilator under 28 dagar baserat på mITT-kohorten. Wilcoxon rangsummetest används för att testa statistisk signifikans.
28 dagar

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Utredare

  • Huvudutredare: Sheng-Yuan Ruan, MD, National Taiwan University Hospital

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

7 augusti 2023

Primärt slutförande (Faktisk)

20 maj 2025

Avslutad studie (Beräknad)

30 november 2025

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

30 juli 2023

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

30 juli 2023

Första postat (Faktisk)

7 augusti 2023

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

19 november 2025

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

16 november 2025

Senast verifierad

1 november 2025

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Plan för individuella deltagardata (IPD)

Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?

NEJ

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera