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Un ensayo aleatorizado de NGS metagenómico para el diagnóstico de neumonía

16 de noviembre de 2025 actualizado por: National Taiwan University Hospital

Impacto de la incorporación de la secuenciación metagenómica de última generación en el tratamiento de la neumonía sobre la eficiencia diagnóstica y los resultados: un ensayo controlado aleatorizado

En este ensayo controlado aleatorizado, nuestro objetivo es evaluar la eficacia de incorporar mNGS en el tratamiento de la neumonía sobre la eficiencia y la precisión de la identificación del patógeno causal, la proporción de participantes con una terapia antimicrobiana eficaz, la duración de la hospitalización y la mortalidad.

Descripción general del estudio

Descripción detallada

Este es un estudio de fase 2 multicéntrico, aleatorizado, de etiqueta abierta que evaluará la eficacia de incorporar mNGS en el tratamiento de la neumonía grave en cuanto a la precisión y la eficiencia para lograr un diagnóstico definitivo de identificación de los patógenos causantes de la neumonía, la terapia antimicrobiana adecuada y el paciente. resultados. El diagnóstico de neumonía requiere evidencia radiológica de neumonía y al menos dos de los siguientes criterios clínicos: tos nueva o que empeora, expectoración de esputo nueva o que empeora, disnea nueva o que empeora, hemoptisis, dolor torácico pleurítico y fiebre (≥38,0 °C). ). La neumonía grave se define como neumonía con hipoxemia que requiere intubación orotraqueal y soporte de ventilación mecánica.

Se necesita el consentimiento informado por escrito de los sujetos elegibles o de su tutor legal en el momento del reclutamiento. Después de completar el consentimiento informado, los sujetos se aleatorizarán con una proporción de asignación de 1:1 a través de un sistema de aleatorización basado en la web para recibir el estándar de atención (SOC) mediante un análisis basado en cultivo y serología para la detección de patógenos o SOC con un método mNGS adicional mediante APGseq. ® (Asia Pathogenómica, New Taipei City, Taiwán) para la detección de patógenos. El tratamiento para la neumonía se sugiere siguiendo las Directrices de Taiwán para el Manejo de la Neumonía publicadas en 2018. Después de la aleatorización, se seguirá a los sujetos hasta la muerte, el alta del hospital o 28 días después de la aleatorización, lo que ocurra primero. Se espera que la duración total del estudio sea de dos años desde el primer sujeto inscrito hasta el análisis final.

Tipo de estudio

Intervencionista

Inscripción (Actual)

114

Fase

  • No aplica

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

      • Taipei, Taiwán
        • National Taiwan University Hospital

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

No

Descripción

Criterios de inclusión:

  1. Presentarse a la UCI con un diagnóstico de neumonía (cumplido con los criterios radiográficos y clínicos)
  2. Adultos ≥18 años
  3. Intubado orotraquealmente
  4. Ingreso en UCI por < 24 horas
  5. Puntuación APACHE II < 35 al ingreso en UCI

Criterio de exclusión:

  1. Esperanza de vida inferior a 4 semanas
  2. Con una directiva existente para retener el tratamiento de soporte vital
  3. Pacientes que no desean o no pueden proporcionar una muestra del tracto respiratorio inferior al ingreso en la UCI
  4. El estudio previo ha identificado patógenos específicos que pueden explicar el evento índice de neumonía.
  5. Se han realizado pruebas de PCR multiplex o NGS para la detección de patógenos antes de la detección.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Propósito principal: Diagnóstico
  • Asignación: Aleatorizado
  • Modelo Intervencionista: Asignación paralela
  • Enmascaramiento: Ninguno (etiqueta abierta)

Armas e Intervenciones

Grupo de participantes/brazo
Intervención / Tratamiento
Comparador activo: Grupo de atención estándar
Se obtuvieron aspirados endotraqueales, muestras de sangre, muestras de orina y frotis nasofaríngeos de los pacientes lo antes posible después de la admisión en la UCI. Se realizó cultivo bacteriano, con el uso de técnicas estándar, en muestras de sangre y aspirados endotraqueales. La detección de antígenos en orina se realizó para la detección de L. pneumophila y S. pneumoniae. Se realizó un ensayo de PCR en hisopos nasofaríngeos para la detección de virus de influenza A y B y virus SARS-CoV-2. Las detecciones de hongos o micobacterias, y el uso de PCR multiplex para la detección de patógenos, como el sistema FilmArray, se determinaron a discreción de los médicos.
Se obtuvieron aspirados endotraqueales, muestras de sangre, muestras de orina y frotis nasofaríngeos de los pacientes lo antes posible después de la admisión en la UCI. Se realizó cultivo bacteriano, con el uso de técnicas estándar, en muestras de sangre y aspirados endotraqueales. La detección de antígenos en orina se realizó para la detección de L. pneumophila y S. pneumoniae. Se realizó un ensayo de PCR en hisopos nasofaríngeos para la detección de virus de influenza A y B y virus SARS-CoV-2. Las detecciones de hongos o micobacterias, y el uso de PCR multiplex para la detección de patógenos, como el sistema FilmArray, se determinaron a discreción de los médicos.
Experimental: grupo mNGS
Los sujetos asignados al grupo mNGS recibirán un estudio de etiología siguiendo el protocolo utilizado en el grupo de atención estándar y pruebas adicionales de mNGS para dos muestras de minilavado broncoalveolar y una muestra de muestras de sangre recuperadas al mismo tiempo que el estudio estándar.
Las pruebas NGS metagenómicas para la identificación de patógenos se realizarán para muestras de sangre y vías respiratorias utilizando APGseq ® (Asia Pathogenómica, Nueva Ciudad de Taipei, Taiwán). La preparación de la muestra para la prueba de mNGS fue la siguiente: se centrifugaron de 5 a 10 ml de sangre completa a 1600 g durante 10 min a 4 °C para separar el plasma. Las muestras de plasma se transfirieron a tubos estériles de 2 mL para la siguiente extracción de ADN o ARN. En general, se utilizaron 300 ul de muestra de plasma para la extracción de ADN. El ADN genómico total de las muestras se extrajo utilizando el método basado en columnas (p. QIAamp DNA Microbiome Kit, Qiagen para extracción de ADN; o QIAamp Viral RNA Mini Kit, Qiagen para extracción de ARN, respectivamente), siguiendo el manual de instrucciones del fabricante. El ARN se transcribió inversamente y se sintetizó en ADN complementario de doble cadena (ADNc ds) con el kit de transcripción inversa SuperScript II (Invitrogen).

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Tiempo para lograr un diagnóstico definitivo en el análisis modificado por intención de tratar (mITT).
Periodo de tiempo: 7 días
Probabilidad acumulada de lograr un diagnóstico definitivo en términos de identificar con precisión los patógenos causantes de la neumonía, estimada por el método de Kaplan-Meier en un marco de tiempo de 7 días en un análisis por intención de tratar modificado (mITT).
7 días

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Tiempo para lograr un diagnóstico definitivo en el análisis por intención de tratar.
Periodo de tiempo: 7 días
Probar la solidez del análisis mITT para el criterio principal de valoración del estudio en comparación con el análisis ITT estándar. (Análisis de sensibilidad)
7 días
Tasa de detección de patógenos entre dos grupos a las 72 horas.
Periodo de tiempo: 72 horas
Proporción de participantes con un diagnóstico preciso de los patógenos causantes de la neumonía a las 72 horas después de la aleatorización en el análisis mITT.
72 horas
Tasa de detección de patógenos entre dos grupos al final del estudio.
Periodo de tiempo: 28 días
Proporción de participantes con un diagnóstico preciso de los patógenos causantes de la neumonía el día 28 después de la aleatorización en el análisis mITT.
28 días
Impacto de mNGS en la prescripción adecuada de antibióticos.
Periodo de tiempo: 72 horas
Proporción de participantes con terapia antimicrobiana efectiva a las 72 horas después de la aleatorización en el análisis mITT.
72 horas
Mortalidad a los 28 días en análisis mITT.
Periodo de tiempo: 28 días
Curvas de Kaplan-Meier de supervivencia a los 28 días utilizando la cohorte mITT. Las pruebas de rango logarítmico se utilizan para probar la significación estadística.
28 días
Mortalidad a los 28 días en el análisis ITT (cohorte total).
Periodo de tiempo: 28 días
Curvas de Kaplan-Meier de supervivencia a 28 días usando cohorte total. Las pruebas de rango logarítmico se utilizan para probar la significación estadística.
28 días
Impacto de mNGS en la duración de la estancia en la UCI
Periodo de tiempo: Alta UCI o 28 días
Curvas de egreso vivo de la UCI a los 28 días de la aleatorización mediante el modelo Fine-Gray. La muerte será tratada como un riesgo competitivo.
Alta UCI o 28 días
Impacto del mNGS en los resultados respiratorios y de mortalidad.
Periodo de tiempo: 28 días
Días libres de ventilador en 28 días utilizando la cohorte mITT. Se utiliza la prueba de suma de rangos de Wilcoxon para evaluar la significancia estadística.
28 días

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Investigadores

  • Investigador principal: Sheng-Yuan Ruan, MD, National Taiwan University Hospital

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

7 de agosto de 2023

Finalización primaria (Actual)

20 de mayo de 2025

Finalización del estudio (Estimado)

30 de noviembre de 2025

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

30 de julio de 2023

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

30 de julio de 2023

Publicado por primera vez (Actual)

7 de agosto de 2023

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

19 de noviembre de 2025

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

16 de noviembre de 2025

Última verificación

1 de noviembre de 2025

Más información

Términos relacionados con este estudio

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

NO

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

producto fabricado y exportado desde los EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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