Tato stránka byla automaticky přeložena a přesnost překladu není zaručena. Podívejte se prosím na anglická verze pro zdrojový text.

Randomizovaná studie metagenomického NGS pro diagnostiku pneumonie

16. listopadu 2025 aktualizováno: National Taiwan University Hospital

Dopad začlenění metagenomického sekvenování nové generace do léčby pneumonie na diagnostickou účinnost a výsledky: Randomizovaná kontrolovaná studie

V této randomizované kontrolované studii se zaměřujeme na vyhodnocení účinnosti začlenění mNGS do léčby pneumonie na účinnost a přesnost identifikace kauzálního patogenu, podíl účastníků s účinnou antimikrobiální terapií, délku hospitalizace a mortalitu.

Přehled studie

Detailní popis

Toto je otevřená, randomizovaná, multicentrická studie fáze 2, která vyhodnotí účinnost začlenění mNGS do léčby těžké pneumonie na přesnost a efektivitu dosažení definitivní diagnózy identifikace kauzativních patogenů pneumonie, vhodné antimikrobiální terapie a pacienta. výsledky. Diagnóza pneumonie vyžaduje rentgenový průkaz pneumonie a alespoň dvě z následujících klinických kritérií: nový nebo zhoršující se kašel, nové nebo zhoršující se vykašlávání sputa, nová nebo zhoršující se dušnost, hemoptýza, pleurická bolest na hrudi a horečka (≥38,0 °C ). Těžká pneumonie je definována jako pneumonie s hypoxémií vyžadující orotracheální intubaci a mechanickou ventilační podporu.

V době náboru je nutný písemný informovaný souhlas oprávněných subjektů nebo jejich zákonného zástupce. Po dokončení informovaného souhlasu budou subjekty randomizovány s poměrem přidělování 1:1 prostřednictvím webového randomizačního systému, aby obdrželi standardní péči (SOC) pomocí kultivačního a sérologického zpracování pro detekci patogenů nebo SOC s další metodou mNGS pomocí APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan) pro detekci patogenů. Léčba pneumonie je navržena podle tchajwanských pokynů pro léčbu pneumonie zveřejněných v roce 2018. Po randomizaci budou subjekty sledovány až do smrti, propuštění z nemocnice nebo 28 dnů po randomizaci, podle toho, co nastane dříve. Očekává se, že celková délka studia bude dva roky od prvního zapsaného předmětu do závěrečné analýzy.

Typ studie

Intervenční

Zápis (Aktuální)

114

Fáze

  • Nelze použít

Kontakty a umístění

Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.

Studijní místa

      • Taipei, Tchaj-wan
        • National Taiwan University Hospital

Kritéria účasti

Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.

Kritéria způsobilosti

Věk způsobilý ke studiu

  • Dospělý
  • Starší dospělý

Přijímá zdravé dobrovolníky

Ne

Popis

Kritéria pro zařazení:

  1. Dostavit se na JIP s diagnózou pneumonie (splněno jak rentgenovými, tak klinickými kritérii)
  2. Dospělí ve věku ≥ 18 let
  3. Orotracheálně intubováno
  4. Příjem na JIP na <24 hodin
  5. Skóre APACHE II <35 při přijetí na JIP

Kritéria vyloučení:

  1. Očekávaná délka života pod 4 týdny
  2. Se stávající směrnicí o odepření léčby udržující život
  3. Pacienti, kteří nejsou ochotni nebo schopni poskytnout vzorek z dolních cest dýchacích při příjmu na JIP
  4. Předchozí studie identifikovaly specifické patogeny, které mohou být příčinou indexu pneumonie
  5. Pro detekci patogenů před screeningem bylo provedeno multiplexní testování PCR nebo NGS

Studijní plán

Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.

Jak je studie koncipována?

Detaily designu

  • Primární účel: Diagnostický
  • Přidělení: Randomizované
  • Intervenční model: Paralelní přiřazení
  • Maskování: Žádné (otevřený štítek)

Zbraně a zásahy

Skupina účastníků / Arm
Intervence / Léčba
Aktivní komparátor: Skupina standardní péče
Endotracheální aspiráty, krevní vzorky, vzorky moči a výtěry z nosohltanu byly pacientům odebrány co nejdříve po přijetí na JIP. Bakteriální kultivace byla provedena za použití standardních technik na krevních vzorcích a endotracheálních aspirátech. Pro detekci L. pneumophila a S. pneumoniae byla provedena detekce antigenu v moči. Na výtěrech z nosohltanu byl proveden test PCR pro detekci virů chřipky A a B a virů SARS-CoV-2. Detekce plísní nebo mykobakterií a zda použít multiplexní PCR pro detekci patogenů, jako je systém FilmArray, byly stanoveny podle uvážení lékařů.
Endotracheální aspiráty, krevní vzorky, vzorky moči a výtěry z nosohltanu byly pacientům odebrány co nejdříve po přijetí na JIP. Bakteriální kultivace byla provedena za použití standardních technik na krevních vzorcích a endotracheálních aspirátech. Pro detekci L. pneumophila a S. pneumoniae byla provedena detekce antigenu v moči. Na výtěrech z nosohltanu byl proveden test PCR pro detekci virů chřipky A a B a virů SARS-CoV-2. Detekce plísní nebo mykobakterií a zda použít multiplexní PCR pro detekci patogenů, jako je systém FilmArray, byly stanoveny podle uvážení lékařů.
Experimentální: skupina mNGS
Subjektům zařazeným do skupiny mNGS bude provedeno etiologické vyšetření podle protokolu používaného ve skupině standardní péče a další vyšetření mNGS pro dva vzorky minibronchoalveolární laváže a jeden vzorek vzorků krve odebraných ve stejnou dobu standardního vyšetření.
Metagenomické testování NGS pro identifikaci patogenu bude provedeno pro vzorky dýchacích cest a krve pomocí APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan). Příprava vzorku pro testování mNGS byla následující: 5-10 ml plné krve bylo centrifugováno při 1600 g po dobu 10 minut při 4 °C, aby se oddělila plazma. Vzorky plazmy byly přeneseny do 2ml sterilních zkumavek pro následující extrakci DNA nebo RNA. Obecně bylo pro extrakci DNA použito 300 ul vzorku plazmy. Celková genomová DNA ze vzorků byla extrahována pomocí kolonové metody (např. QIAamp DNA Microbiome Kit, Qiagen pro extrakci DNA; nebo QIAamp Viral RNA Mini Kit, Qiagen pro extrakci RNA, v daném pořadí), podle provozní příručky výrobce. RNA byla reverzně transkribována a syntetizována na dvouvláknovou komplementární DNA (ds cDNA) pomocí SuperScript II Reverse Transscription Kit (Invitrogen).

Co je měření studie?

Primární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Čas k dosažení definitivní diagnózy v analýze modifikovaného záměru léčby (mITT).
Časové okno: 7 dní
Kumulativní pravděpodobnost dosažení definitivní diagnózy ve smyslu přesné identifikace kauzativních patogenů pneumonie, odhadnutá Kaplan-Meierovou metodou v časovém rámci 7 dnů v modifikované analýze záměrné léčby (mITT).
7 dní

Sekundární výstupní opatření

Měření výsledku
Popis opatření
Časové okno
Čas k dosažení definitivní diagnózy v analýze záměru léčby.
Časové okno: 7 dní
Testovat robustnost analýzy mITT pro primární cíl studie ve srovnání se standardní analýzou ITT. (Analýza citlivosti)
7 dní
Míra detekce patogenu mezi dvěma skupinami do 72. hodiny.
Časové okno: 72 hodin
Podíl účastníků s přesnou diagnózou pro kauzativní patogeny pneumonie do 72. hodiny po randomizaci v mITT analýze.
72 hodin
Míra detekce patogenu mezi dvěma skupinami na konci studie.
Časové okno: 28 dní
Podíl účastníků s přesnou diagnózou pro kauzativní patogeny pneumonie do 28. dne po randomizaci v mITT analýze.
28 dní
Vliv mNGS na předepisování vhodných antibiotik.
Časové okno: 72 hodin
Podíl účastníků na účinné antimikrobiální léčbě do 72. hodiny po randomizaci v mITT analýze.
72 hodin
28denní mortalita v mITT analýze.
Časové okno: 28 dní
Kaplan-Meierovy křivky 28denního přežití s ​​použitím kohorty mITT. Log-rank testy se používají k testování statistické významnosti.
28 dní
28denní mortalita v ITT analýze (celková kohorta).
Časové okno: 28 dní
Kaplan-Meierovy křivky 28denního přežití s ​​použitím celkové kohorty. Log-rank testy se používají k testování statistické významnosti.
28 dní
Vliv mNGS na délku pobytu na JIP
Časové okno: Propuštění z JIP nebo 28 dní
Křivky živého vybití JIP za 28 dní po randomizaci pomocí modelu Fine-Gray. Smrt bude považována za konkurenční riziko.
Propuštění z JIP nebo 28 dní
Vliv mNGS na respirační výsledky a mortalitu.
Časové okno: 28 dní
Dny bez ventilátoru během 28 dnů s využitím kohorty mITT. K testování statistické významnosti je použit Wilcoxonův pořadový test součtů.
28 dní

Spolupracovníci a vyšetřovatelé

Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.

Vyšetřovatelé

  • Vrchní vyšetřovatel: Sheng-Yuan Ruan, MD, National Taiwan University Hospital

Termíny studijních záznamů

Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.

Hlavní termíny studia

Začátek studia (Aktuální)

7. srpna 2023

Primární dokončení (Aktuální)

20. května 2025

Dokončení studie (Odhadovaný)

30. listopadu 2025

Termíny zápisu do studia

První předloženo

30. července 2023

První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality

30. července 2023

První zveřejněno (Aktuální)

7. srpna 2023

Aktualizace studijních záznamů

Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)

19. listopadu 2025

Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality

16. listopadu 2025

Naposledy ověřeno

1. listopadu 2025

Více informací

Termíny související s touto studií

Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)

Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?

NE

Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty

Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA

Ne

Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA

Ne

produkt vyrobený a vyvážený z USA

Ne

Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .

Klinické studie na Standardní vyšetření na zápal plic

Předplatit