Рандомизированное исследование метагеномного NGS для диагностики пневмонии
16 ноября 2025 г. обновлено: National Taiwan University Hospital
Влияние включения метагеномного секвенирования нового поколения в лечение пневмонии на эффективность диагностики и исходы: рандомизированное контролируемое исследование
В этом рандомизированном контролируемом исследовании мы стремимся оценить эффективность включения mNGS в лечение пневмонии с точки зрения эффективности и точности идентификации возбудителя, доли участников с эффективной антимикробной терапией, продолжительности госпитализации и смертности.
Обзор исследования
Статус
Активный, не рекрутирующий
Подробное описание
Это открытое, рандомизированное, многоцентровое исследование 2 фазы, в котором будет оцениваться эффективность включения mNGS в лечение тяжелой пневмонии с точки зрения точности и эффективности достижения определенного диагноза выявления возбудителей пневмонии, соответствующей антимикробной терапии и состояния пациента. результаты. Диагноз пневмонии требует рентгенологического подтверждения пневмонии и по крайней мере двух из следующих клинических критериев: новый или усиливающийся кашель, новое или усиливающееся отхаркивание мокроты, новая или усиливающаяся одышка, кровохарканье, плевритная боль в груди и лихорадка (≥38,0 °C). ). Тяжелая пневмония определяется как пневмония с гипоксемией, требующая оротрахеальной интубации и искусственной вентиляции легких.
Письменное информированное согласие необходимо от подходящих субъектов или от их законного опекуна во время вербовки. После получения информированного согласия субъекты будут рандомизированы с коэффициентом распределения 1: 1 через веб-систему рандомизации для получения стандарта медицинской помощи (SOC) с использованием культурального и серологического исследования для обнаружения патогенов или SOC с дополнительным методом mNGS с использованием APGseq. ® (Asia Pathogenomics, Нью-Тайбэй, Тайвань) для обнаружения патогенов. Лечение пневмонии предлагается в соответствии с Тайваньскими рекомендациями по лечению пневмонии, опубликованными в 2018 году. После рандомизации субъекты будут наблюдаться до смерти, выписки из больницы или через 28 дней после рандомизации, в зависимости от того, что наступит раньше. Ожидается, что общая продолжительность исследования составит два года с момента регистрации первого субъекта до окончательного анализа.
Тип исследования
Интервенционный
Регистрация (Действительный)
114
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
-
Taipei, Тайвань
- National Taiwan University Hospital
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Описание
Критерии включения:
- Поступление в отделение интенсивной терапии с диагнозом пневмония (соответствует как рентгенологическим, так и клиническим критериям)
- Взрослые в возрасте ≥18 лет
- Оротрахеально интубированный
- Госпитализация в отделение интенсивной терапии <24 часов
- Оценка по шкале APACHE II <35 при поступлении в отделение интенсивной терапии
Критерий исключения:
- Ожидаемая продолжительность жизни менее 4 недель
- С существующей директивой об отказе от поддерживающего жизнь лечения
- Пациенты, которые не желают или не могут предоставить образец из нижних дыхательных путей при поступлении в отделение интенсивной терапии
- Предыдущее обследование выявило специфические патогены, которые могут быть причиной индексного события пневмонии.
- Для обнаружения патогенов перед скринингом было проведено мультиплексное ПЦР или NGS-тестирование.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Диагностика
- Распределение: Рандомизированный
- Интервенционная модель: Параллельное назначение
- Маскировка: Нет (открытая этикетка)
Оружие и интервенции
Группа участников / Армия |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Активный компаратор: Стандартная группа ухода
Эндотрахеальные аспираты, образцы крови, мочи и мазки из носоглотки были получены у пациентов как можно скорее после поступления в ОИТ.
Бактериальный посев проводили с использованием стандартных методик образцов крови и эндотрахеальных аспиратов.
Детекцию антигена мочи проводили для выявления L. pneumophila и S. pneumoniae.
ПЦР-анализ был проведен на мазках из носоглотки для обнаружения вирусов гриппа А и В и вирусов SARS-CoV-2.
Обнаружение грибков или микобактерий, а также использование мультиплексной ПЦР для обнаружения патогенов, таких как система FilmArray, определялись по усмотрению врачей.
|
Эндотрахеальные аспираты, образцы крови, мочи и мазки из носоглотки были получены у пациентов как можно скорее после поступления в ОИТ.
Бактериальный посев проводили с использованием стандартных методик образцов крови и эндотрахеальных аспиратов.
Детекцию антигена мочи проводили для выявления L. pneumophila и S. pneumoniae.
ПЦР-анализ был проведен на мазках из носоглотки для обнаружения вирусов гриппа А и В и вирусов SARS-CoV-2.
Обнаружение грибков или микобактерий, а также использование мультиплексной ПЦР для обнаружения патогенов, таких как система FilmArray, определялись по усмотрению врачей.
|
|
Экспериментальный: группа mNGS
Субъекты, отнесенные к группе mNGS, пройдут этиологическую обработку в соответствии с протоколом, используемым в группе стандартной помощи, и дополнительное тестирование mNGS для двух образцов мини-бронхоальвеолярного лаважа и одного образца образцов крови, полученных одновременно со стандартным исследованием.
|
Метагеномное NGS-тестирование для идентификации патогенов будет проводиться для образцов дыхательных путей и крови с использованием APGseq ® (Asia Pathogenomics, Нью-Тайбэй, Тайвань).
Подготовка проб для тестирования mNGS заключалась в следующем: 5–10 мл цельной крови центрифугировали при 1600g в течение 10 мин при 4°C для отделения плазмы.
Образцы плазмы переносили в стерильные пробирки объемом 2 мл для последующего выделения ДНК или РНК.
Обычно для выделения ДНК использовали 300 мкл образца плазмы.
Общую геномную ДНК из образцов экстрагировали с использованием колоночного метода (например,
QIAamp DNA Microbiome Kit, Qiagen для выделения ДНК; или QIAamp Viral RNA Mini Kit, Qiagen для выделения РНК соответственно), следуя руководству по эксплуатации производителя.
РНК подвергали обратной транскрипции и синтезировали в двухцепочечную комплементарную ДНК (дц кДНК) с помощью набора для обратной транскрипции SuperScript II (Invitrogen).
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Время до установления точного диагноза в модифицированном анализе намерения лечить (mITT).
Временное ограничение: 7 дней
|
Кумулятивная вероятность достижения определенного диагноза с точки зрения точного выявления возбудителей пневмонии, оцененная методом Каплана-Мейера в течение 7 дней в модифицированном анализе намерения лечить (mITT).
|
7 дней
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Время достижения определенного диагноза в анализе намерения лечить.
Временное ограничение: 7 дней
|
Проверить надежность анализа mITT для первичной конечной точки исследования по сравнению со стандартным анализом ITT.
(Анализ чувствительности)
|
7 дней
|
|
Частота обнаружения возбудителя между двумя группами к 72-му часу.
Временное ограничение: 72 часа
|
Доля участников с точным диагнозом возбудителя пневмонии к 72-му часу после рандомизации в анализе mITT.
|
72 часа
|
|
Частота обнаружения патогенов между двумя группами к концу исследования.
Временное ограничение: 28 дней
|
Доля участников с точным диагнозом возбудителя пневмонии на 28-й день после рандомизации в анализе mITT.
|
28 дней
|
|
Влияние mNGS на правильное назначение антибиотиков.
Временное ограничение: 72 часа
|
Доля участников, получающих эффективную противомикробную терапию к 72-му часу после рандомизации в анализе mITT.
|
72 часа
|
|
28-дневная смертность в анализе mITT.
Временное ограничение: 28 дней
|
Кривые Каплана-Мейера 28-дневной выживаемости с использованием когорты mITT.
Тесты логарифмического ранга используются для проверки статистической значимости.
|
28 дней
|
|
28-дневная смертность в анализе ITT (общая когорта).
Временное ограничение: 28 дней
|
Кривые Каплана-Мейера 28-дневной выживаемости с использованием общей когорты.
Тесты логарифмического ранга используются для проверки статистической значимости.
|
28 дней
|
|
Влияние mNGS на продолжительность пребывания в отделении интенсивной терапии
Временное ограничение: Выписка из реанимации или 28 дней
|
Кривые выписки живых из отделения интенсивной терапии через 28 дней после рандомизации с использованием модели Fine-Gray.
Смерть будет рассматриваться как конкурирующий риск.
|
Выписка из реанимации или 28 дней
|
|
Влияние mNGS на респираторные исходы и смертность.
Временное ограничение: 28 дней
|
Свободные от ИВЛ дни за 28 дней с использованием когорты mITT.
Для проверки статистической значимости используется критерий Уилкоксона.
|
28 дней
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Следователи
- Главный следователь: Sheng-Yuan Ruan, MD, National Taiwan University Hospital
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
7 августа 2023 г.
Первичное завершение (Действительный)
20 мая 2025 г.
Завершение исследования (Оцененный)
30 ноября 2025 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
30 июля 2023 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
30 июля 2023 г.
Первый опубликованный (Действительный)
7 августа 2023 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
19 ноября 2025 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
16 ноября 2025 г.
Последняя проверка
1 ноября 2025 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 202305104RINB
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕТ
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
продукт, произведенный в США и экспортированный из США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .