Metagenomisen NGS:n satunnaistutkimus keuhkokuumeen diagnosoimiseksi
sunnuntai 16. marraskuuta 2025 päivittänyt: National Taiwan University Hospital
Metagenomisen seuraavan sukupolven sekvensoinnin ottaminen mukaan keuhkokuumeen hoitoon diagnostiikan tehokkuuteen ja tuloksiin: satunnaistettu kontrolloitu tutkimus
Tässä satunnaistetussa kontrolloidussa tutkimuksessa pyrimme arvioimaan mNGS:n sisällyttämisen keuhkokuumeen hoitoon tehokkuutta ja tarkkuutta aiheuttavan patogeenin tunnistamisen, tehokkaan antimikrobisen hoidon saaneiden osallistujien osuuden, sairaalahoidon pituuden ja kuolleisuuden suhteen.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Aktiivinen, ei rekrytointi
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämä on avoin, satunnaistettu, monikeskus, vaiheen 2 tutkimus, jossa arvioidaan mNGS:n sisällyttämisen tehokkuutta vaikean keuhkokuumeen hoitoon keuhkokuumeen aiheuttavien patogeenien tunnistamisen tarkkuuden ja tehokkuuden suhteen, asianmukainen antimikrobinen hoito ja potilas. tuloksia. Keuhkokuumeen diagnoosi edellyttää keuhkokuumeen radiologista näyttöä ja vähintään kahta seuraavista kliinisistä kriteereistä: uusi tai paheneva yskä, uusi tai paheneva ysköksen eritys, uusi tai paheneva hengenahdistus, verenvuoto, keuhkopussin rintakipu ja kuume (≥38,0 °C) ). Vaikea keuhkokuume määritellään keuhkokuumeeksi, johon liittyy hypoksemia ja joka vaatii orotrakeaalista intubaatiota ja mekaanisen ventilaation tukea.
Rekrytointihetkellä tarvitaan kirjallinen tietoinen suostumus kelpoisilta koehenkilöiltä tai heidän lailliselta huoltajaltaan. Tietoon perustuvan suostumuksen saatuaan koehenkilöt satunnaistetaan jakosuhteella 1:1 verkkopohjaisen satunnaistusjärjestelmän kautta, jotta he saavat standardin hoitoa (SOC) käyttäen viljelyyn ja serologiaan perustuvaa käsittelyä patogeenien havaitsemiseen tai SOC:tä lisämNGS-menetelmällä käyttämällä APGseqia. ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan) patogeenien havaitsemiseen. Keuhkokuumeen hoitoa ehdotetaan vuonna 2018 julkaistujen Taiwanin keuhkokuumeen hoitoohjeiden mukaisesti. Satunnaistamisen jälkeen koehenkilöitä seurataan kuolemaan asti, heidät kotiutetaan sairaalasta tai 28 päivää satunnaistamisen jälkeen sen mukaan, kumpi tulee ensin. Kokonaistutkimuksen keston odotetaan olevan kaksi vuotta ensimmäisestä ilmoittautuneesta tutkittavasta lopulliseen analyysiin.
Opintotyyppi
Interventio
Ilmoittautuminen (Todellinen)
114
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Taipei, Taiwan
- National Taiwan University Hospital
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Esiintyminen teho-osastolle keuhkokuumediagnoosin kanssa (täytetty sekä radiografisilla että kliinisillä kriteereillä)
- ≥18-vuotiaat aikuiset
- Orotrakeaalisesti intuboitu
- Tehohoitoon pääsy <24 tuntia
- APACHE II -pistemäärä <35 tehohoitoon pääsyssä
Poissulkemiskriteerit:
- Elinajanodote alle 4 viikkoa
- Olemassa oleva direktiivi kieltää elämää ylläpitävä hoito
- Potilaat, jotka eivät halua tai pysty antamaan alempien hengitysteiden näytettä teho-osastolle
- Aikaisemmissa tutkimuksissa on tunnistettu erityisiä patogeenejä, jotka voivat selittää keuhkokuumeen indeksitapahtuman
- Multiplex PCR tai NGS on tehty patogeenien havaitsemiseksi ennen seulontaa
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
- Jako: Satunnaistettu
- Inventiomalli: Rinnakkaistehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Active Comparator: Normaali hoitoryhmä
Endotrakeaaliset aspiraatit, verinäytteet, virtsanäytteet ja nenänielun pyyhkäisynäytteet otettiin potilailta mahdollisimman pian teho-osastolle saapumisen jälkeen.
Bakteeriviljely suoritettiin standarditekniikoita käyttäen verinäytteille ja endotrakeaalisille aspiraateille.
Virtsan antigeenin havaitseminen suoritettiin L. pneumophilan ja S. pneumoniaen havaitsemiseksi.
PCR-määritys suoritettiin nenänielun vanupuikolla influenssa A- ja B-virusten sekä SARS-CoV-2-virusten havaitsemiseksi.
Sieni- tai mykobakteerihavainnot ja moninkertaisen PCR:n käyttö patogeenien havaitsemiseen, kuten FilmArray-järjestelmään, päätettiin lääkärien harkinnan mukaan.
|
Endotrakeaaliset aspiraatit, verinäytteet, virtsanäytteet ja nenänielun pyyhkäisynäytteet otettiin potilailta mahdollisimman pian teho-osastolle saapumisen jälkeen.
Bakteeriviljely suoritettiin standarditekniikoita käyttäen verinäytteille ja endotrakeaalisille aspiraateille.
Virtsan antigeenin havaitseminen suoritettiin L. pneumophilan ja S. pneumoniaen havaitsemiseksi.
PCR-määritys suoritettiin nenänielun vanupuikolla influenssa A- ja B-virusten sekä SARS-CoV-2-virusten havaitsemiseksi.
Sieni- tai mykobakteerihavainnot ja moninkertaisen PCR:n käyttö patogeenien havaitsemiseen, kuten FilmArray-järjestelmään, päätettiin lääkärien harkinnan mukaan.
|
|
Kokeellinen: mNGS-ryhmä
MNGS-ryhmään määritetyt koehenkilöt saavat etiologiatutkimuksen standardin hoitoryhmässä käytetyn protokollan mukaisesti ja lisämNGS-testin kahdelle minibronkoalveolaarisen huuhtelun näytteelle ja yhdelle verinäytenäytteelle, jotka on otettu samaan aikaan standardin käsittelyn kanssa.
|
Metagenominen NGS-testaus patogeenien tunnistamiseksi tehdään hengitystie- ja verinäytteille käyttämällä APGseq ® -ohjelmaa (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan).
Näytteen valmistelu mNGS-testausta varten oli seuraava: 5-10 ml kokoverta sentrifugoitiin 1 600 g:ssä 10 minuuttia 4 °C:ssa plasman erottamiseksi.
Plasmanäytteet siirrettiin 2 ml:n steriileihin putkiin seuraavaa DNA- tai RNA-uuttoa varten.
Yleensä 300 ui plasmanäytettä käytettiin DNA-uuttoon.
Kokonaisgenominen DNA näytteistä uutettiin kolonnipohjaisella menetelmällä (esim.
QIAamp DNA Microbiome Kit, Qiagen DNA:n uuttamiseen; tai vastaavasti QIAamp Viral RNA Mini Kit, Qiagen RNA:n uuttamiseen) valmistajan käyttöohjeen mukaisesti.
RNA käänteiskopioitiin ja syntetisoitiin kaksijuosteiseksi komplementaariseksi DNA:ksi (ds cDNA) SuperScript II Reverse Transcription Kit -pakkauksella (Invitrogen).
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Aika varman diagnoosin saavuttamiseen modifioidussa hoitotarkoituksessa (mITT) -analyysissä.
Aikaikkuna: 7 päivää
|
Varman diagnoosin saavuttamisen kumulatiivinen todennäköisyys keuhkokuumeen aiheuttavien patogeenien tarkan tunnistamisen kannalta, arvioituna Kaplan-Meier-menetelmällä 7 päivän aikavälillä modifioidussa hoitotarkoituksessa (mITT) -analyysissä.
|
7 päivää
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Aika saada varma diagnoosi hoitotarkoitusanalyysissä.
Aikaikkuna: 7 päivää
|
Testaa mITT-analyysin luotettavuutta tutkimuksen ensisijaiselle päätepisteelle verrattuna standardi ITT-analyysiin.
(Herkkyysanalyysi)
|
7 päivää
|
|
Patogeenien havaitsemisnopeus kahden ryhmän välillä 72. tuntiin mennessä.
Aikaikkuna: 72 tuntia
|
Niiden osallistujien osuus, joilla oli tarkka diagnoosi keuhkokuumeen aiheuttajista patogeeneista 72. tuntiin mennessä satunnaistamisen jälkeen mITT-analyysissä.
|
72 tuntia
|
|
Patogeenien havaitsemisprosentti kahden ryhmän välillä tutkimuksen loppuun mennessä.
Aikaikkuna: 28 päivää
|
Niiden osallistujien osuus, joilla oli tarkka diagnoosi keuhkokuumeen aiheuttajista patogeeneista 28. päivään mennessä satunnaistamisen jälkeen mITT-analyysissä.
|
28 päivää
|
|
MNGS:n vaikutus asianmukaiseen antibioottireseptiin.
Aikaikkuna: 72 tuntia
|
Tehokasta mikrobihoitoa saaneiden osallistujien osuus 72. tuntiin satunnaistamisen jälkeen mITT-analyysissä.
|
72 tuntia
|
|
28 päivän kuolleisuus mITT-analyysissä.
Aikaikkuna: 28 päivää
|
Kaplan-Meier-käyrät 28 päivän eloonjäämisestä käyttämällä mITT-kohorttia.
Tilastollisen merkitsevyyden testaamiseen käytetään log-rank-testejä.
|
28 päivää
|
|
28 päivän kuolleisuus ITT-analyysissä (kokonaiskohortti).
Aikaikkuna: 28 päivää
|
Kaplan-Meier-käyrät 28 päivän eloonjäämisestä käyttäen kokonaiskohorttia.
Tilastollisen merkitsevyyden testaamiseen käytetään log-rank-testejä.
|
28 päivää
|
|
MNGS:n vaikutus tehohoitojakson pituuteen
Aikaikkuna: Tehoosaston kotiutus tai 28 päivää
|
Käyrät elävästä tehohoitoyksiköstä 28 päivän kuluessa satunnaistamisen jälkeen Fine-Gray-mallilla.
Kuolema käsitellään kilpailevana riskinä.
|
Tehoosaston kotiutus tai 28 päivää
|
|
mNGS:n vaikutus hengityselinten terveyteen ja kuolleisuuteen.
Aikaikkuna: 28 päivää
|
Ventilaattorivapaat päivät 28 vuorokauden aikana käyttäen mITT-kohorttia.
Wilcoxonin järjestyssummatestiä käytetään tilastollisen merkitsevyyden testaamiseen.
|
28 päivää
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Sheng-Yuan Ruan, MD, National Taiwan University Hospital
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Maanantai 7. elokuuta 2023
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Tiistai 20. toukokuuta 2025
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Sunnuntai 30. marraskuuta 2025
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Sunnuntai 30. heinäkuuta 2023
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Sunnuntai 30. heinäkuuta 2023
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Maanantai 7. elokuuta 2023
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Keskiviikko 19. marraskuuta 2025
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Sunnuntai 16. marraskuuta 2025
Viimeksi vahvistettu
Lauantai 1. marraskuuta 2025
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 202305104RINB
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Yhdysvalloissa valmistettu ja sieltä viety tuote
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .