Um estudo randomizado de metagenômica NGS para diagnóstico de pneumonia
8 de agosto de 2023 atualizado por: National Taiwan University Hospital
Impacto da Incorporação do Sequenciamento Metagenómico de Próxima Geração no Tratamento da Pneumonia na Eficiência e nos Resultados do Diagnóstico: Um Estudo Controlado Randomizado
Neste estudo controlado randomizado, pretendemos avaliar a eficácia da incorporação do mNGS no tratamento da pneumonia na eficiência e precisão da identificação do patógeno causador, proporção de participantes com terapia antimicrobiana eficaz, duração da hospitalização e mortalidade.
Visão geral do estudo
Status
Ainda não está recrutando
Condições
Descrição detalhada
Este é um estudo aberto, randomizado, multicêntrico, de fase 2 que avaliará a eficácia da incorporação de mNGS no manejo de pneumonia grave na precisão e eficiência de obtenção de diagnóstico definitivo de identificação de patógenos causadores de pneumonia, terapia antimicrobiana apropriada e paciente resultados. O diagnóstico de pneumonia requer evidência radiológica de pneumonia e pelo menos dois dos seguintes critérios clínicos: tosse nova ou piora, expectoração nova ou piora de expectoração, dispneia nova ou piora, hemoptise, dor torácica pleurítica e febre (≥38,0°C ). A pneumonia grave é definida como pneumonia com hipoxemia que requer intubação orotraqueal e suporte de ventilação mecânica.
O consentimento informado por escrito é necessário dos sujeitos elegíveis ou de seu responsável legal no momento do recrutamento. Depois de preencher o consentimento informado, os indivíduos serão randomizados com uma proporção de alocação de 1:1 por meio de um sistema de randomização baseado na web para receber o padrão de atendimento (SOC) usando cultura e avaliação sorológica para detecção de patógenos ou SOC com método mNGS adicional usando APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan) para detecção de patógenos. O tratamento para pneumonia é sugerido seguindo as Diretrizes de Taiwan para o Tratamento da Pneumonia publicadas em 2018. Após a randomização, os indivíduos serão acompanhados até a morte, alta hospitalar ou 28 dias após a randomização, o que ocorrer primeiro. Espera-se que a duração total do estudo seja de dois anos desde o primeiro sujeito inscrito até a análise final.
Tipo de estudo
Intervencional
Inscrição (Estimado)
120
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.
Contato de estudo
- Nome: Sheng-Yuan Ruan, MD
- Número de telefone: 886-2-23123456
- E-mail: syruan@ntu.edu.tw
Critérios de participação
Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Não
Descrição
Critério de inclusão:
- Chegando à UTI com diagnóstico de pneumonia (preenchido com critérios radiográficos e clínicos)
- Adultos com idade ≥18 anos
- Entubado orotraquealmente
- Admissão na UTI por <24 horas
- Escore APACHE II <35 na admissão na UTI
Critério de exclusão:
- Expectativa de vida abaixo de 4 semanas
- Com uma diretiva existente para suspender o tratamento de suporte à vida
- Pacientes que não desejam ou não podem fornecer uma amostra do trato respiratório inferior na admissão na UTI
- O trabalho anterior identificou patógenos específicos que podem ser responsáveis pelo evento índice de pneumonia
- O teste Multiplex PCR ou NGS foi feito para detecção de patógenos antes da triagem
Plano de estudo
Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Diagnóstico
- Alocação: Randomizado
- Modelo Intervencional: Atribuição Paralela
- Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)
Armas e Intervenções
Grupo de Participantes / Braço |
Intervenção / Tratamento |
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Comparador Ativo: Grupo de atendimento padrão
Aspirados endotraqueais, amostras de sangue, amostras de urina e swabs nasofaríngeos foram obtidos dos pacientes o mais rápido possível após a admissão na UTI.
A cultura bacteriana foi realizada, com o uso de técnicas padrão, em amostras de sangue e aspirados endotraqueais.
A detecção de antígeno na urina foi realizada para detecção de L. pneumophila e S. pneumoniae.
Um ensaio de PCR foi realizado em zaragatoas nasofaríngeas para a detecção dos vírus influenza A e B e vírus SARS-CoV-2.
Detecções de fungos ou micobactérias e o uso de PCR multiplex para detecção de patógenos, como o sistema FilmArray, foram determinados a critério dos médicos.
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Aspirados endotraqueais, amostras de sangue, amostras de urina e swabs nasofaríngeos foram obtidos dos pacientes o mais rápido possível após a admissão na UTI.
A cultura bacteriana foi realizada, com o uso de técnicas padrão, em amostras de sangue e aspirados endotraqueais.
A detecção de antígeno na urina foi realizada para detecção de L. pneumophila e S. pneumoniae.
Um ensaio de PCR foi realizado em zaragatoas nasofaríngeas para a detecção dos vírus influenza A e B e vírus SARS-CoV-2.
Detecções de fungos ou micobactérias e o uso de PCR multiplex para detecção de patógenos, como o sistema FilmArray, foram determinados a critério dos médicos.
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Experimental: grupo mNGS
Indivíduos designados para o grupo mNGS receberão avaliação etiologia seguida do protocolo usado no grupo de tratamento padrão e teste mNGS adicional para duas amostras de minilavado broncoalveolar e uma amostra de amostras de sangue coletadas ao mesmo tempo da investigação padrão.
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O teste metagenômico NGS para identificação de patógenos será feito para amostras de sangue e vias aéreas usando APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan).
A preparação da amostra para o teste mNGS foi a seguinte: 5-10 mL de sangue total foram centrifugados a 1.600g por 10 min a 4°C para separar o plasma.
As amostras de plasma foram transferidas para tubos estéreis de 2 mL para a seguinte extração de DNA ou RNA.
Em geral, 300ul de amostra de plasma foram usados para extração de DNA.
O DNA genômico total das amostras foi extraído usando o método baseado em coluna (por exemplo,
Kit QIAamp DNA Microbiome, Qiagen para extração de DNA; ou QIAamp Viral RNA Mini Kit, Qiagen para extração de RNA, respectivamente), seguindo o manual operacional do fabricante.
O RNA foi transcrito reversamente e sintetizado em DNA complementar de fita dupla (ds cDNA) com o Kit de Transcrição Reversa SuperScript II (Invitrogen).
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Tempo para alcançar o diagnóstico definitivo na análise modificada de intenção de tratar (mITT).
Prazo: 7 dias
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Probabilidade cumulativa de alcançar o diagnóstico definitivo em termos de identificação precisa dos patógenos causadores da pneumonia, estimada pelo método Kaplan-Meier em um período de tempo de 7 dias na análise de intenção de tratar modificada (mITT).
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7 dias
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Tempo para alcançar o diagnóstico definitivo na análise de intenção de tratar.
Prazo: 7 dias
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Para testar a robustez da análise mITT para o endpoint primário do estudo em comparação com a análise ITT padrão.
(Análise sensitiva)
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7 dias
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Taxa de detecção de patógenos entre dois grupos na 72ª hora.
Prazo: 72 horas
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Proporção de participantes com diagnóstico preciso para os patógenos causadores de pneumonia até 72 horas após a randomização na análise mITT.
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72 horas
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Taxa de detecção de patógenos entre dois grupos até o final do estudo.
Prazo: 28 dias
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Proporção de participantes com diagnóstico preciso para os patógenos causadores de pneumonia no dia 28 após a randomização na análise mITT.
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28 dias
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Impacto do mNGS na prescrição apropriada de antibióticos.
Prazo: 72 horas
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Proporção de participantes em terapia antimicrobiana eficaz na 72ª hora após a randomização na análise mITT.
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72 horas
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Mortalidade em 28 dias na análise mITT.
Prazo: 28 dias
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Curvas de Kaplan-Meier de sobrevida de 28 dias usando coorte mITT.
Os testes de log-rank são usados para testar a significância estatística.
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28 dias
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Mortalidade em 28 dias na análise ITT (coorte total).
Prazo: 28 dias
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Curvas de Kaplan-Meier de sobrevida de 28 dias usando coorte total.
Os testes de log-rank são usados para testar a significância estatística.
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28 dias
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Impacto do mNGS no desfecho respiratório e mortalidade.
Prazo: 28 dias
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Curvas de Kaplan-Meier de sobrevida livre de ventilação em 28 dias após randomização usando coorte mITT.
Os testes de log-rank são usados para testar a significância estatística.
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28 dias
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Impacto do mNGS no tempo de permanência na UTI
Prazo: Alta da UTI ou 28 dias
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Curvas de alta da UTI com vida em 28 dias após randomização usando o modelo Fine-Gray.
A morte será tratada como um risco competitivo.
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Alta da UTI ou 28 dias
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Colaboradores e Investigadores
É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.
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Investigadores
- Investigador principal: Sheng-Yuan Ruan, MD, National Taiwan University Hospital
Datas de registro do estudo
Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Estimado)
1 de agosto de 2023
Conclusão Primária (Estimado)
31 de maio de 2025
Conclusão do estudo (Estimado)
31 de julho de 2025
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
30 de julho de 2023
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
30 de julho de 2023
Primeira postagem (Real)
7 de agosto de 2023
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
14 de agosto de 2023
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
8 de agosto de 2023
Última verificação
1 de julho de 2023
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 202305104RINB
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
NÃO
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Não
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
Não
Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .