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肺炎の診断のためのメタゲノムNGSのランダム化試験

2023年8月8日 更新者:National Taiwan University Hospital

肺炎の管理にメタゲノム次世代シーケンスを組み込むことが診断効率と転帰に及ぼす影響:ランダム化比較試験

このランダム化比較試験では、原因病原体同定の効率と正確さ、効果的な抗菌療法を受けた参加者の割合、入院期間、死亡率について、肺炎の管理にmNGSを組み込むことの有効性を評価することを目的としています。

調査の概要

詳細な説明

これは、非盲検、無作為化、多施設共同の第2相研究であり、肺炎の原因病原体、適切な抗菌療法および患者を特定する確定診断を達成する精度と効率に関して、重症肺炎の管理にmNGSを組み込むことの有効性を評価するものです。結果。 肺炎の診断には、肺炎の放射線学的証拠と、次の臨床基準のうち少なくとも 2 つが必要です:新たな咳または悪化した咳、新たなまたは悪化した痰の喀出、新たなまたは悪化の呼吸困難、喀血、胸膜炎性胸痛、発熱(38.0℃以上) )。 重度の肺炎は、経口気管挿管と機械的換気補助を必要とする低酸素血症を伴う肺炎として定義されます。

募集時に適格な対象者また​​は法的保護者からの書面によるインフォームドコンセントが必要です。 インフォームドコンセントを完了した後、被験者はウェブベースのランダム化システムを介して1:1の割り当て比でランダム化され、病原体検出のための培養および血清学に基づく精密検査を使用した標準治療(SOC)を受けるか、APGseqを使用した追加のmNGS法によるSOCを受けることになります。 ® (Asia Pathogenomics、台湾、新北市) を使用して病原体検出を行います。 肺炎の治療は、2018年に発行された台湾の肺炎管理ガイドラインに従って推奨されています。 無作為化後、対象者は死亡、退院、または無作為化後28日のいずれか早い方まで追跡調査される。 総研究期間は、最初の被験者の登録から最終分析まで 2 年間と予想されます。

研究の種類

介入

入学 (推定)

120

段階

  • 適用できない

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究連絡先

  • 名前:Sheng-Yuan Ruan, MD
  • 電話番号:886-2-23123456
  • メールsyruan@ntu.edu.tw

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

  • 大人
  • 高齢者

健康ボランティアの受け入れ

いいえ

説明

包含基準:

  1. 肺炎の診断を受けてICUに入院している(X線検査基準と臨床基準の両方を満たしている)
  2. 18歳以上の成人
  3. 経口気管挿管済み
  4. 24 時間未満の ICU 入院
  5. ICU 入院時の APACHE II スコア <35

除外基準:

  1. 平均余命は4週間未満
  2. 延命治療を差し控えるという既存の指令がある場合
  3. ICU入院時に下気道サンプルを提供する意思がない、または提供できない患者
  4. 以前の精密検査により、肺炎の指標となるイベントの原因となり得る特定の病原体が同定されている
  5. スクリーニングの前に病原体検出のためにマルチプレックス PCR または NGS 検査が行われています

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか?

デザインの詳細

  • 主な目的:診断
  • 割り当て:ランダム化
  • 介入モデル:並列代入
  • マスキング:なし(オープンラベル)

武器と介入

参加者グループ / アーム
介入・治療
アクティブコンパレータ:標準治療グループ
気管内吸引液、血液サンプル、尿サンプル、および鼻咽頭ぬぐい液は、ICU 入院後できるだけ早く患者から採取されました。 標準的な技術を使用して、血液サンプルと気管内吸引液の細菌培養を実施しました。 尿抗原検出は、L. pneumophila および S. pneumoniae の検出のために実行されました。 インフルエンザA型およびB型ウイルスおよびSARS-CoV-2ウイルスを検出するために、鼻咽頭ぬぐい液に対してPCRアッセイが実施されました。 真菌またはマイコバクテリアの検出、および病原体検出に FilmArray システムなどのマルチプレックス PCR を使用するかどうかは、医師の裁量で決定されました。
気管内吸引液、血液サンプル、尿サンプル、および鼻咽頭ぬぐい液は、ICU 入院後できるだけ早く患者から採取されました。 標準的な技術を使用して、血液サンプルと気管内吸引液の細菌培養を実施しました。 尿抗原検出は、L. pneumophila および S. pneumoniae の検出のために実行されました。 インフルエンザA型およびB型ウイルスおよびSARS-CoV-2ウイルスを検出するために、鼻咽頭ぬぐい液に対してPCRアッセイが実施されました。 真菌またはマイコバクテリアの検出、および病原体検出に FilmArray システムなどのマルチプレックス PCR を使用するかどうかは、医師の裁量で決定されました。
実験的:mNGSグループ
MNGSグループに割り当てられた被験者は、標準治療グループで使用されるプロトコルに従った病因精密検査と、標準精密検査と同時に採取されたミニ気管支肺胞洗浄液2検体と血液サンプル1検体に対する追加のmNGS検査を受けます。
病原体同定のためのメタゲノム NGS 検査は、APGseq ® (Asia Pathogenomics、台湾新北市) を使用して、気道および血液検体に対して行われます。 mNGS 検査用のサンプル前処理は次のとおりです。5 ~ 10 mL の全血を 1,600 g、4℃で 10 分間遠心分離して血漿を分離しました。 血漿サンプルは、次の DNA または RNA 抽出のために 2 mL の滅菌チューブに移されました。 一般に、DNA 抽出には 300ul の血漿サンプルが使用されました。 サンプルからの全ゲノム DNA は、カラムベースの方法 (例: QIAamp DNA マイクロバイオーム キット、DNA 抽出用 Qiagen。または QIAamp Viral RNA Mini Kit、RNA 抽出用の Qiagen)、メーカーの操作マニュアルに従ってください。 SuperScript II Reverse Transcription Kit (Invitrogen) を使用して、RNA を逆転写し、二本鎖相補 DNA (ds cDNA) に合成しました。

この研究は何を測定していますか?

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
修正された治療意図(mITT)分析で確定診断が得られるまでの時間。
時間枠:7日
肺炎の原因病原体を正確に特定するという観点から、確定診断に達する累積確率。修正された治療意図 (mITT) 分析において 7 日間の時間枠でカプラン マイヤー法によって推定されます。
7日

二次結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
治療意図分析で確定診断を達成するまでの時間。
時間枠:7日
標準的な ITT 分析と比較して、研究の主要エンドポイントに対する mITT 分析の堅牢性をテストします。 (感度分析)
7日
72 時間目までの 2 つのグループ間の病原体検出率。
時間枠:72時間
MITT分析における無作為化後72時間までに、肺炎の原因病原体について正確に診断された参加者の割合。
72時間
研究終了までの 2 つのグループ間の病原体検出率。
時間枠:28日
MITT分析における無作為化後28日までに肺炎の原因病原体について正確に診断された参加者の割合。
28日
適切な抗生物質処方に対する mNGS の影響。
時間枠:72時間
MITT分析における無作為化後72時間までに効果的な抗菌療法を受けた参加者の割合。
72時間
MITT分析における28日死亡率。
時間枠:28日
MITT コホートを使用した 28 日生存率のカプラン マイヤー曲線。 ログランク検定は、統計的有意性を検定するために使用されます。
28日
ITT分析における28日死亡率(全コホート)。
時間枠:28日
総コホートを使用した 28 日生存率のカプラン マイヤー曲線。 ログランク検定は、統計的有意性を検定するために使用されます。
28日
呼吸器および死亡率に対する mNGS の影響。
時間枠:28日
MITT コホートを使用した無作為化後の 28 日間の人工呼吸器なし生存率のカプラン マイヤー曲線。 ログランク検定は、統計的有意性を検定するために使用されます。
28日
ICU滞在期間に対するmNGSの影響
時間枠:ICU退院または28日
Fine-Gray モデルを使用したランダム化後の 28 日後の生存 ICU 退院曲線。 死亡は競合リスクとして扱われます。
ICU退院または28日

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

捜査官

  • 主任研究者:Sheng-Yuan Ruan, MD、National Taiwan University Hospital

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (推定)

2023年8月1日

一次修了 (推定)

2025年5月31日

研究の完了 (推定)

2025年7月31日

試験登録日

最初に提出

2023年7月30日

QC基準を満たした最初の提出物

2023年7月30日

最初の投稿 (実際)

2023年8月7日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2023年8月14日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2023年8月8日

最終確認日

2023年7月1日

詳しくは

本研究に関する用語

その他の研究ID番号

  • 202305104RINB

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。

肺炎の標準精密検査の臨床試験

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