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Uno studio randomizzato di NGS metagenomico per la diagnosi di polmonite

16 novembre 2025 aggiornato da: National Taiwan University Hospital

Impatto dell'incorporazione del sequenziamento metagenomico di nuova generazione nella gestione della polmonite sull'efficienza diagnostica e sui risultati: uno studio controllato randomizzato

In questo studio controllato randomizzato, miriamo a valutare l'efficacia dell'incorporazione di mNGS nella gestione della polmonite sull'efficienza e l'accuratezza dell'identificazione del patogeno causale, la percentuale di partecipanti con terapia antimicrobica efficace, la durata del ricovero e la mortalità.

Panoramica dello studio

Stato

Attivo, non reclutante

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

Questo è uno studio in aperto, randomizzato, multicentrico, di fase 2 che valuterà l'efficacia dell'incorporazione di mNGS nella gestione della polmonite grave sull'accuratezza e l'efficienza del raggiungimento di una diagnosi definitiva dell'identificazione dei patogeni causali della polmonite, della terapia antimicrobica appropriata e del paziente risultati. La diagnosi di polmonite richiede evidenza radiologica di polmonite e almeno due dei seguenti criteri clinici: tosse nuova o in peggioramento, espettorazione dell'espettorato nuova o in peggioramento, dispnea nuova o in peggioramento, emottisi, dolore toracico pleurico e febbre (≥38,0°C) ). La polmonite grave è definita come polmonite con ipossiemia che richiede l'intubazione orotracheale e il supporto della ventilazione meccanica.

È necessario il consenso informato scritto dei soggetti idonei o del loro tutore legale al momento dell'assunzione. Dopo aver completato il consenso informato, i soggetti saranno randomizzati con un rapporto di allocazione 1: 1 tramite un sistema di randomizzazione basato sul web per ricevere lo standard di cura (SOC) utilizzando un work-up basato su coltura e sierologia per il rilevamento di agenti patogeni o SOC con metodo mNGS aggiuntivo utilizzando APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan) per il rilevamento dei patogeni. Il trattamento per la polmonite è suggerito seguendo le linee guida di Taiwan per la gestione della polmonite pubblicate nel 2018. Dopo la randomizzazione, i soggetti saranno seguiti fino alla morte, alla dimissione dall'ospedale o 28 giorni dopo la randomizzazione, a seconda di quale evento si verifichi per primo. La durata totale dello studio dovrebbe essere di due anni dal primo soggetto arruolato all'analisi finale.

Tipo di studio

Interventistico

Iscrizione (Effettivo)

114

Fase

  • Non applicabile

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

  • Taiwan
      • Taipei, Taiwan
        • National Taiwan University Hospital

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Descrizione

Criterio di inclusione:

  1. Presentarsi in terapia intensiva con una diagnosi di polmonite (soddisfatta sia con criteri radiografici che clinici)
  2. Adulti di età ≥18 anni
  3. Intubato orotrachealmente
  4. Ricovero in terapia intensiva per <24 ore
  5. Punteggio APACHE II <35 al ricovero in terapia intensiva

Criteri di esclusione:

  1. Aspettativa di vita inferiore a 4 settimane
  2. Con una direttiva esistente per sospendere le cure di sostentamento vitale
  3. Pazienti non disposti o in grado di fornire un campione del tratto respiratorio inferiore al momento del ricovero in terapia intensiva
  4. Il lavoro precedente ha identificato agenti patogeni specifici che possono spiegare l'evento indice di polmonite
  5. Il test Multiplex PCR o NGS è stato eseguito per il rilevamento dei patogeni prima dello screening

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Scopo principale: Diagnostico
  • Assegnazione: Randomizzato
  • Modello interventistico: Assegnazione parallela
  • Mascheramento: Nessuno (etichetta aperta)

Armi e interventi

Gruppo di partecipanti / Arm
Intervento / Trattamento
Comparatore attivo: Gruppo di cure standard
Aspirati endotracheali, campioni di sangue, campioni di urina e tamponi nasofaringei sono stati ottenuti dai pazienti il ​​prima possibile dopo il ricovero in terapia intensiva. La coltura batterica è stata eseguita, con l'utilizzo di tecniche standard, su campioni di sangue e aspirati endotracheali. Il rilevamento dell'antigene urinario è stato eseguito per il rilevamento di L. pneumophila e S. pneumoniae. È stato eseguito un test PCR su tamponi nasofaringei per il rilevamento dei virus dell'influenza A e B e dei virus SARS-CoV-2. I rilevamenti di funghi o micobatteri e l'opportunità di utilizzare la PCR multiplex per il rilevamento di agenti patogeni, come il sistema FilmArray, sono stati determinati a discrezione dei medici.
Test diagnostico: Procedura standard per la polmonite
Aspirati endotracheali, campioni di sangue, campioni di urina e tamponi nasofaringei sono stati ottenuti dai pazienti il ​​prima possibile dopo il ricovero in terapia intensiva. La coltura batterica è stata eseguita, con l'utilizzo di tecniche standard, su campioni di sangue e aspirati endotracheali. Il rilevamento dell'antigene urinario è stato eseguito per il rilevamento di L. pneumophila e S. pneumoniae. È stato eseguito un test PCR su tamponi nasofaringei per il rilevamento dei virus dell'influenza A e B e dei virus SARS-CoV-2. I rilevamenti di funghi o micobatteri e l'opportunità di utilizzare la PCR multiplex per il rilevamento di agenti patogeni, come il sistema FilmArray, sono stati determinati a discrezione dei medici.
Sperimentale: gruppo mNGS
I soggetti assegnati al gruppo mNGS riceveranno l'analisi dell'eziologia seguendo il protocollo utilizzato nel gruppo di cura standard e test mNGS aggiuntivi per due campioni di lavaggio mini-broncoalveolare e un campione di campioni di sangue recuperati contemporaneamente all'elaborazione standard.
Test diagnostico: Sequenziamento metagenomico di nuova generazione
Il test NGS metagenomico per l'identificazione del patogeno verrà eseguito per campioni di sangue e vie aeree utilizzando APGseq ® (Asia Pathogenomics, New Taipei City, Taiwan). La preparazione del campione per il test mNGS è stata la seguente: 5-10 mL di sangue intero sono stati centrifugati a 1.600 g per 10 minuti a 4°C per separare il plasma. I campioni di plasma sono stati trasferiti in provette sterili da 2 mL per la successiva estrazione di DNA o RNA. In generale, per l'estrazione del DNA sono stati utilizzati 300 ul di campione di plasma. Il DNA genomico totale dai campioni è stato estratto utilizzando il metodo basato su colonna (ad es. QIAamp DNA Microbiome Kit, Qiagen per l'estrazione del DNA; o QIAamp Viral RNA Mini Kit, Qiagen per l'estrazione dell'RNA, rispettivamente), seguendo il manuale operativo del produttore. L'RNA è stato retrotrascritto e sintetizzato in DNA complementare a doppio filamento (ds cDNA) con il kit di trascrizione inversa SuperScript II (Invitrogen).

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Tempo per ottenere una diagnosi definitiva nell'analisi per intenzione modificata (mITT) modificata.
Lasso di tempo: 7 giorni
Probabilità cumulativa di ottenere una diagnosi definitiva in termini di identificazione accurata dei patogeni causali della polmonite, stimata con il metodo Kaplan-Meier in un lasso di tempo di 7 giorni nell'analisi per intenzione modificata (mITT) modificata.
7 giorni

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
È ora di ottenere una diagnosi definitiva nell'analisi per intenzione di trattare.
Lasso di tempo: 7 giorni
Testare la robustezza dell'analisi mITT per l'endpoint primario dello studio rispetto all'analisi ITT standard. (Analisi di sensibilità)
7 giorni
Tasso di rilevamento di agenti patogeni tra due gruppi entro la 72a ora.
Lasso di tempo: 72 ore
Proporzione di partecipanti con diagnosi accurata per i patogeni causali della polmonite entro la 72a ora dopo la randomizzazione nell'analisi mITT.
72 ore
Tasso di rilevamento di agenti patogeni tra due gruppi entro la fine dello studio.
Lasso di tempo: 28 giorni
Proporzione di partecipanti con diagnosi accurata per i patogeni causali della polmonite entro il giorno 28 dopo la randomizzazione nell'analisi mITT.
28 giorni
Impatto di mNGS su un'appropriata prescrizione di antibiotici.
Lasso di tempo: 72 ore
Proporzione di partecipanti in terapia antimicrobica efficace entro la 72a ora dopo la randomizzazione nell'analisi mITT.
72 ore
Mortalità a 28 giorni nell'analisi mITT.
Lasso di tempo: 28 giorni
Curve di Kaplan-Meier della sopravvivenza a 28 giorni utilizzando la coorte mITT. I test log-rank vengono utilizzati per testare la significatività statistica.
28 giorni
Mortalità a 28 giorni nell'analisi ITT (coorte totale).
Lasso di tempo: 28 giorni
Curve di Kaplan-Meier della sopravvivenza a 28 giorni utilizzando la coorte totale. I test log-rank vengono utilizzati per testare la significatività statistica.
28 giorni
Impatto di mNGS sulla durata della degenza in terapia intensiva
Lasso di tempo: Dimissione in terapia intensiva o 28 giorni
Curve di dimissione in terapia intensiva viva in 28 giorni dopo la randomizzazione utilizzando il modello Fine-Gray. La morte verrà trattata come un rischio concorrente.
Dimissione in terapia intensiva o 28 giorni
Impatto del mNGS sugli esiti respiratori e sulla mortalità.
Lasso di tempo: 28 giorni
Giorni senza ventilatore in 28 giorni utilizzando la coorte mITT. Il test di Wilcoxon per la somma dei ranghi viene utilizzato per testare la significatività statistica.
28 giorni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

National Taiwan University Hospital

Collaboratori

Far Eastern Memorial Hospital
National Taiwan University Hospital Hsin-Chu Branch

Investigatori

  • Investigatore principale: Sheng-Yuan Ruan, MD, National Taiwan University Hospital

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

7 agosto 2023

Completamento primario (Effettivo)

20 maggio 2025

Completamento dello studio (Stimato)

30 novembre 2025

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

30 luglio 2023

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

30 luglio 2023

Primo Inserito (Effettivo)

7 agosto 2023

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

19 novembre 2025

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

16 novembre 2025

Ultimo verificato

1 novembre 2025

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 202305104RINB

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

prodotto fabbricato ed esportato dagli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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