Genetika a genomika aspirinem exacerbovaného respiračního onemocnění (AERD) (AERD)
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Typ studie
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
Colorado
-
Denver, Colorado, Spojené státy, 80206
- National Jewish Health
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Diagnostika astmatu lékařem
- Lékař diagnostika chronického onemocnění nosu s nosními polypy
- Citlivost na aspirin ověřena provokativní výzvou aspirinu na klinice
- Zdravý účastník kontroly
Kritéria vyloučení:
- Aktivní kouření
- Těhotenství
- Anamnéza více než nebo rovna 10 balíčkových let kouření
- Jakékoli významné komorbidní stavy, které by mohly neúmyslně narušit výsledky studie
- Stavy, které vyžadují návaly perorálních kortikosteroidů
- Další významná plicní onemocnění
- Jiné onemocnění podle názoru výzkumníka zakazuje účast ve studii
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Case-Control
- Časové perspektivy: Budoucí
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
|---|
|
Účastníci AERD
Účastníci s aspirinem zhoršili respirační onemocnění.
Dospělí s alergií na aspirin, nosními polypy a těžkým astmatem v dospělosti.
|
|
Zdravé kontroly
Zdraví účastníci, kteří nemají astma.
|
|
Účastníci astmatu necitliví na aspirin
Účastníci s astmatem, kteří však nemají citlivost na aspirin.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Hodnocení genové exprese související s EGR v AERD
Časové okno: Po ukončení studia 3 roky
|
Výzkumníci získají globální genovou expresi čerstvě vyčištěných epiteliálních buněk nosních dýchacích cest pacientů s AERD, pacientů s astmatem necitlivých na aspirin a zdravých pacientů pomocí vzorků nosních výtěrů a aplikací RNAseq na odebrané buňky.
Výzkumníci porovnají profily genů AERD s pacienty s astmatem a zdravými pacienty necitlivými na aspirin a určí, zda je u AERD zjištěna down-regulace genů EGR.
|
Po ukončení studia 3 roky
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Vztah exprese genu EGR k epigenetické genové methylaci
Časové okno: Po ukončení studia 3 roky
|
Určit, zda je profilování metylace celého genomu změněno ve spojení s down-regulovanými geny EGR.
Výzkumníci získají komplementární profily metylace celého genomu účastníků studie a vyhodnotí, zda jsou down-regulované geny EGR u pacientů s AERD spojeny s methylačními rozdíly, pomocí kompozitní analýzy integrující expresi a epigenetická data.
Softwarový program MethylMix R bude použit k identifikaci metylačních změn spojených se změnami genové exprese.
MethylMix integruje metylaci DNA z normálních a nemocných vzorků s odpovídající genovou expresí.
Stručně řečeno, MethylMix definuje hyper a hypomethylované geny porovnáním hodnot metylace nemocné tkáně vs. normální.
|
Po ukončení studia 3 roky
|
|
Vliv genetické variace na genovou expresi související s EGR
Časové okno: Po ukončení studia 3 roky
|
Zjistit, zda genetické mutace souvisí s down-regulovanou expresí genu EGR u pacientů s AERD.
Získáme genotypy na těchto stejných účastnících studie a vyhodnotíme, zda jsou down-regulované geny EGR asociovány s mutacemi pomocí kompozitní analýzy integrující expresi a genotypy.
Pracovní postup genotypizace Affymetrix se skládá ze 4 kroků; první 3 kroky používají sadu samostatných softwarových balíčků a 4. krok používají R balíček SNPolisher.
Kontrola kvality vzorků bude vyhodnocena statistikou Dish-QC, přičemž budou zachovány vzorky s výchozí hodnotou Dish-QC > 82 %.
Genotypované vzorky s četností hovorů nižší než výchozí hodnota 97 % budou vyloučeny.
Platewise QC bude vyhodnocena ručním výpočtem statistik 'Plate Pass Rate' a 'Average Plate Call Rate', s výchozími limitními hodnotami 95 a 99 %.
Krok genotypizace bude opakován pro vzorky splňující kritéria kvality.
SNPolisher vyhodnotí kvalitu signálu a klasifikuje každou SNP sondu.
|
Po ukončení studia 3 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Spolupracovníci
Spolupracovníci
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Očekávaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Očekávaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- HS-3200sIRB
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .