Genetica e genomica della malattia respiratoria esacerbata dall'aspirina (AERD) (AERD)
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Luoghi di studio
-
-
Colorado
-
Denver, Colorado, Stati Uniti, 80206
- National Jewish Health
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Diagnosi del medico di asma
- Diagnosi medica di malattia nasale cronica con polipi nasali
- Sensibilità all'aspirina verificata da una sfida provocatoria dell'aspirina in clinica
- Partecipante al controllo sano
Criteri di esclusione:
- Fumo attivo
- Gravidanza
- Storia di fumo superiore o uguale a 10 pacchetti-anno
- Eventuali condizioni comorbide significative che potrebbero inavvertitamente interferire con i risultati dello studio
- Condizioni che richiedono raffiche di corticosteroidi orali
- Altre malattie polmonari significative
- Un'altra malattia, a parere dello sperimentatore, vieta la partecipazione allo studio
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Caso di controllo
- Prospettive temporali: Prospettiva
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
|---|
|
Partecipanti all'AERD
I partecipanti con aspirina hanno esacerbato la malattia respiratoria.
Adulti con allergia all'aspirina, polipi nasali e asma grave ad esordio in età adulta.
|
|
Controlli sani
Partecipanti sani che non hanno l'asma.
|
|
Partecipanti asmatici non sensibili all'aspirina
Partecipanti con asma, ma che non hanno una sensibilità all'aspirina.
|
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
|
Valutazione dell'espressione genica correlata a EGR in AERD
Lasso di tempo: Attraverso il completamento degli studi, 3 anni
|
I ricercatori otterranno l'espressione genica globale delle cellule epiteliali delle vie aeree nasali appena spazzolate di pazienti AERD, pazienti asmatici non sensibili all'aspirina e pazienti sani utilizzando campioni di tamponi nasali ed eseguendo RNAseq sulle cellule raccolte.
I ricercatori metteranno a confronto i profili dei geni AERD rispetto ai pazienti asmatici non sensibili all'aspirina e ai pazienti sani e determineranno se si trova una sottoregolazione dei geni EGR nell'AERD.
|
Attraverso il completamento degli studi, 3 anni
|
Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
|
Relazione dell'espressione del gene EGR con la metilazione del gene epigenetico
Lasso di tempo: Attraverso il completamento degli studi, 3 anni
|
Per determinare se il profilo di metilazione dell'intero genoma è alterato in associazione con geni EGR down-regolati.
I ricercatori otterranno profili di metilazione dell'intero genoma complementari dei partecipanti allo studio e valuteranno se i geni EGR down-regolati nei pazienti con AERD sono associati a differenze di metilazione mediante un'analisi composita che integra l'espressione ei dati epigenetici.
Il programma software MethylMix R verrà utilizzato per identificare i cambiamenti di metilazione associati ai cambiamenti di espressione genica.
MethylMix integra la metilazione del DNA da campioni normali e patologici con espressione genica corrispondente.
In sintesi, MethylMix definisce i geni iper e ipometilati confrontando i valori di metilazione del tessuto patologico con quelli normali.
|
Attraverso il completamento degli studi, 3 anni
|
|
Influenza della variazione genetica sull'espressione genica correlata all'EGR
Lasso di tempo: Attraverso il completamento degli studi, 3 anni
|
Per determinare se le mutazioni genetiche si associano all'espressione del gene EGR sottoregolato nei pazienti con AERD.
Otterremo genotipi su questi stessi partecipanti allo studio e valuteremo se i geni EGR sottoregolati sono associati a mutazioni mediante un'analisi composita che integri espressione e genotipi.
Il flusso di lavoro di genotipizzazione Affymetrix consiste in 4 passaggi; i primi 3 passaggi utilizzano un set di pacchetti software autonomi e il 4° passaggio utilizza il pacchetto R SNPolisher.
Il QC del campione sarà valutato mediante la statistica Dish-QC, conservando i campioni con Dish-QC predefinito > 82%.
Saranno esclusi i campioni genotipizzati con un tasso di identificazione inferiore al valore predefinito del 97%.
Il QC Platewise verrà valutato calcolando manualmente le statistiche "Tasso di passaggio della piastra" e "Tasso medio di identificazione della piastra", con valori di cutoff predefiniti di 95 e 99%.
La fase di genotipizzazione verrà rieseguita per i campioni che superano i criteri di qualità.
SNPolisher valuterà la qualità del segnale e classificherà ogni sonda SNP.
|
Attraverso il completamento degli studi, 3 anni
|
Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Collaboratori
Collaboratori
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Inizio studio
Completamento primario (Anticipato)
Completamento primario
Completamento dello studio (Anticipato)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- HS-3200sIRB
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .