Genetik og genomik af aspirin forværret luftvejssygdom (AERD) (AERD)
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
Colorado
-
Denver, Colorado, Forenede Stater, 80206
- National Jewish Health
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Lægens diagnose af astma
- Lægens diagnose af kronisk næsesygdom med næsepolypper
- Følsomhed over for aspirin verificeret af en aspirin-provokerende udfordring i klinikken
- Sund kontroldeltager
Ekskluderingskriterier:
- Aktiv rygning
- Graviditet
- Historie med mere end eller lig med 10 pakkeår med rygning
- Eventuelle væsentlige komorbide tilstande, der utilsigtet kunne forstyrre undersøgelsesresultaterne
- Tilstande, der kræver udbrud af orale kortikosteroider
- Andre væsentlige lungesygdomme
- Anden sygdom efter investigatorens opfattelse forbyder deltagelse i undersøgelsen
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Case-Control
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
|---|
|
AERD deltagere
Deltagere med aspirin forværrede luftvejssygdomme.
Voksne med aspirinallergi, næsepolypper og svær astma i voksendebut.
|
|
Sund kontrol
Raske deltagere, der ikke har astma.
|
|
Ikke-aspirinfølsomme astmadeltagere
Deltagere med astma, men som ikke har en følsomhed over for aspirin.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Evaluering af EGR-relateret genekspression i AERD
Tidsramme: Gennem studieafslutning, 3 år
|
Forskere vil opnå global genekspression af friskbørstede nasale luftvejsepitelceller fra AERD-patienter, ikke-aspirinfølsomme astmapatienter og raske patienter ved at bruge næsepodningsprøver og køre RNAseq på de indsamlede celler.
Forskere vil sammenligne AERD-genprofiler mod ikke-aspirinfølsomme astmapatienter og raske patienter og afgøre, om nedregulering af EGR-gener findes i AERD.
|
Gennem studieafslutning, 3 år
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Relation mellem EGR-genekspression og epigenetisk genmethylering
Tidsramme: Gennem studieafslutning, 3 år
|
For at bestemme, om hele genomets methyleringsprofilering er ændret i forbindelse med nedregulerede EGR-gener.
Forskere vil opnå komplementære hel-genom-methyleringsprofiler for studiedeltagerne og vil evaluere, om nedregulerede EGR-gener hos AERD-patienter er forbundet med methyleringsforskelle ved en sammensat analyse, der integrerer ekspression og epigenetiske data.
MethylMix R-softwareprogrammet vil blive brugt til at identificere methyleringsændringer forbundet med genekspressionsændringer.
MethylMix integrerer DNA-methylering fra normale prøver og sygdomsprøver med matchet genekspression.
Sammenfattende definerer MethylMix hyper- og hypomethylerede gener ved at sammenligne methyleringsværdier af sygdomsvæv vs. normalt.
|
Gennem studieafslutning, 3 år
|
|
Indflydelse af genetisk variation på EGR-relateret genekspression
Tidsramme: Gennem studieafslutning, 3 år
|
At bestemme, om genetiske mutationer associerer med nedreguleret EGR-genekspression hos AERD-patienter.
Vi vil opnå genotyper på de samme undersøgelsesdeltagere og evaluere, om nedregulerede EGR-gener er forbundet med mutationer ved en sammensat analyse, der integrerer ekspression og genotyper.
Affymetrix-genotype-arbejdsgangen består af 4 trin; de første 3 trin bruger et sæt stand-alone softwarepakker, og det 4. trin bruger R-pakken SNPolisher.
Prøve-QC vil blive evalueret ved hjælp af Dish-QC-statistik, idet prøver med standard Dish-QC > 82 % bevares.
Genotypeprøver med en opkaldsrate, der er lavere end standardværdien på 97 %, vil blive udelukket.
Platewise QC vil blive evalueret ved manuelt at beregne 'Plate Pass Rate' og 'Average Plate Call Rate'-statistikker med standard cutoff-værdier på 95 og 99%.
Genotypetrin vil blive gentaget for prøver, der opfylder kvalitetskriterier.
SNPolisher vil evaluere kvaliteten af signalet og klassificere hver SNP-sonde.
|
Gennem studieafslutning, 3 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Forventet)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Forventet)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- HS-3200sIRB
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .