Genetik und Genomik von Aspirin Exacerbated Respiratory Disease (AERD) (AERD)
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Voraussichtlich)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Colorado
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Denver, Colorado, Vereinigte Staaten, 80206
- National Jewish Health
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Ärztliche Diagnose von Asthma
- Ärztliche Diagnose einer chronischen Nasenerkrankung mit Nasenpolypen
- Empfindlichkeit gegenüber Aspirin, bestätigt durch eine provokative Herausforderung mit Aspirin in der Klinik
- Gesunder Kontrollteilnehmer
Ausschlusskriterien:
- Aktives Rauchen
- Schwangerschaft
- Vorgeschichte von mehr als oder gleich 10 Packungsjahren des Rauchens
- Alle signifikanten komorbiden Zustände, die die Studienergebnisse versehentlich beeinträchtigen könnten
- Bedingungen, die orale Kortikosteroide erfordern
- Andere bedeutende Lungenerkrankungen
- Andere Erkrankungen verbieten nach Ansicht des Prüfarztes die Teilnahme an der Studie
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Fallkontrolle
- Zeitperspektiven: Interessent
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
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AERD-Teilnehmer
Teilnehmer mit Aspirin verschlimmerten Atemwegserkrankungen.
Erwachsene mit Aspirin-Allergie, Nasenpolypen und schwerem Asthma im Erwachsenenalter.
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Gesunde Kontrollen
Gesunde Teilnehmer, die kein Asthma haben.
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Nicht-Aspirin-empfindliche Asthma-Teilnehmer
Teilnehmer mit Asthma, die jedoch nicht empfindlich auf Aspirin reagieren.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Bewertung der EGR-bezogenen Genexpression bei AERD
Zeitfenster: Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Die Forscher werden die globale Genexpression von frisch gebürsteten Epithelzellen der nasalen Atemwege von AERD-Patienten, nicht Aspirin-empfindlichen Asthmapatienten und gesunden Patienten erhalten, indem sie Nasenabstrichproben verwenden und RNAseq auf den gesammelten Zellen laufen lassen.
Die Forscher werden AERD-Genprofile mit nicht-Aspirin-empfindlichen Asthmapatienten und gesunden Patienten vergleichen und bestimmen, ob bei AERD eine Herunterregulierung von EGR-Genen gefunden wird.
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Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Sekundäre Ergebnismessungen
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Beziehung der EGR-Genexpression zur epigenetischen Genmethylierung
Zeitfenster: Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Um zu bestimmen, ob das Methylierungsprofil des gesamten Genoms in Verbindung mit herunterregulierten EGR-Genen verändert wird.
Die Forscher werden komplementäre Methylierungsprofile des gesamten Genoms der Studienteilnehmer erhalten und durch eine zusammengesetzte Analyse, die Expressions- und epigenetische Daten integriert, bewerten, ob herunterregulierte EGR-Gene bei AERD-Patienten mit Methylierungsunterschieden assoziiert sind.
Das Softwareprogramm MethylMix R wird verwendet, um Methylierungsänderungen im Zusammenhang mit Änderungen der Genexpression zu identifizieren.
MethylMix integriert DNA-Methylierung aus normalen und Krankheitsproben mit übereinstimmender Genexpression.
Zusammenfassend definiert MethylMix hyper- und hypomethylierte Gene durch den Vergleich der Methylierungswerte von krankem Gewebe mit normalem.
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Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Einfluss der genetischen Variation auf die EGR-bezogene Genexpression
Zeitfenster: Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Um zu bestimmen, ob genetische Mutationen mit einer herunterregulierten EGR-Genexpression bei AERD-Patienten assoziiert sind.
Wir werden Genotypen von denselben Studienteilnehmern erhalten und durch eine zusammengesetzte Analyse, die Expression und Genotypen integriert, auswerten, ob herunterregulierte EGR-Gene mit Mutationen assoziiert sind.
Der Affymetrix-Genotypisierungs-Workflow besteht aus 4 Schritten; Die ersten 3 Schritte verwenden eine Reihe von eigenständigen Softwarepaketen und der 4. Schritt verwendet das R-Paket SNPolisher.
Die Proben-QC wird anhand der Dish-QC-Statistik ausgewertet, wobei Proben mit einer standardmäßigen Dish-QC > 82 % beibehalten werden.
Genotypisierte Proben mit einer Aufrufrate unter dem Standardwert von 97 % werden ausgeschlossen.
Platewise QC wird durch manuelle Berechnung der Statistiken „Plate Pass Rate“ und „Average Plate Call Rate“ mit Standard-Cutoff-Werten von 95 und 99 % ausgewertet.
Der Genotypisierungsschritt wird für Proben wiederholt, die die Qualitätskriterien erfüllen.
SNPolisher bewertet die Qualität des Signals und klassifiziert jede SNP-Sonde.
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Bis Studienabschluss 3 Jahre
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Mitarbeiter
Mitarbeiter
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Voraussichtlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Voraussichtlich)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- HS-3200sIRB
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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