Genetické regulátory zdraví kostí, které jsou jedinečné pro vertebrální kost
Identifikace a charakterizace genetických regulátorů zdraví kostí, které jsou jedinečné pro vertebrální kost.
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Typ studie
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
- Telefonní číslo: 3037246623
- E-mail: CHERYL.ACKERT-BICKNELL@CUANSCHUTZ.EDU
Studijní místa
-
-
Colorado
-
Aurora, Colorado, Spojené státy, 80045
- Nábor
- Univeristy of Colorado Denver
-
Kontakt:
- Cheryl L Ackert-Bicknell@cuAnschutz.edu, PhD
- Telefonní číslo: 303-724-6623
- E-mail: cheryl.ackert-bicknell@cuanschutz.edu
-
Kontakt:
- Reed A Ayers, PhD
- Telefonní číslo: 303-724-1158
- E-mail: reed.ayers@cuanschutz.edu
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
-
Vrchní vyšetřovatel:
- David Ou Yang, MD
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Muži a ženy ve věku 18 až 85 let podstupující víceúrovňovou fúzi páteře (tj. T10 (nebo vyšší) fúzi s pánví) -NEBO- 3 sloupcová osteotomie s korpektomií z pro operace krátkého segmentu -NEBO- vertebrální sloupcová resekce (VCR) zahrnující korpektomii -NEBO- jakákoli operace korekce deformity, kdy ošetřující chirurg určí, že velké množství kosti obsahující trabekulární elementy bude odstraněno a zlikvidováno.
- Ochotný a schopný poskytnout informovaný souhlas
Kritéria vyloučení:
- Konečné stadium onemocnění ledvin.
- Jakákoli anamnéza rakoviny.
- Spoléhání na invalidní vozík pro 70 % nebo více jejich mobility po dobu delší než 12 měsíců.
- Quadra nebo paraplegie v důsledku poranění míchy.
- Současné užívání léků na epilepsii.
- Potvrzené Marfanovy, osteogenesis imperfecta nebo jiný genetický syndrom, o kterém je známo, že ovlivňuje tvorbu kostí (Guacherova, Vit D nezávislá křivice atd.).
- Současné užívání glukokortikoidů trvající déle než 3 měsíce nebo více než 6 měsíců celoživotního užívání.
- Aktuální nebo suspektní současná infekce spojená s ortopedickým hardwarem.
- HIV nebo Hep C pozitivní a nebo v současné době užíváte antivirové léky.
- Anamnéza operace bypassu žaludku a nebo ztráta hmotnosti přesahující 100 liber.
- Primární nebo sekundární hyperparatyreóza.
- Pagetova nemoc
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Pacienti podstupující operaci korekce deformity
Pacienti podstupující operaci korekce deformity podstupující víceúrovňovou fúzi páteře (tj. fúze T10 (nebo vyšší) s pánví) -NEBO- 3sloupcová osteotomie s korpektomií z pro operace krátkého segmentu -NEBO- resekce páteře (VCR) zahrnující korpektomii -NEBO- jakýkoli chirurgický zákrok pro korekci deformity, kdy ošetřující chirurg určí, že velké množství kosti obsahující trabekulární elementy bude odstraněno a zlikvidováno
|
Toto je průřezová studie sběru vzorků.
Kostní tkáň obratlů, která by byla jinak vyřazena, se odebírá pacientům podstupujícím chirurgický zákrok ke korekci deformace páteře a v těchto tkáních se měří genová exprese.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Kvantifikace genů a transkriptů
Časové okno: Základní linie
|
Množství (v transkriptech na milion, TPM) všech známých transkriptů bude kvantifikováno v každém vzorku kosti pomocí sekvenování RNA další generace.
|
Základní linie
|
|
Genotypy
Časové okno: Základní linie
|
Od všech účastníků budou získána data celé genomové sekvence s nízkým pokrytím a výsledkem budou vysoce kvalitní genotypy pro miliony jednonukleotidového polymorfismu (SNP) napříč genomem pacienta.
Protože se jedná o genotypizaci s nízkým pokrytím, bude míra pokrytí mezi 1 a 0,4 násobným zastoupením pro každou skvrnu v genomu na pacienta, takže data budou imputována, aby bylo zajištěno 1 násobné pokrytí pro všechny pacienty.
Každý pacient bude genotypován, a proto budou získána data na úrovni účastníka.
|
Základní linie
|
Sekundární výstupní opatření
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Expresní kvantitativní lokusy (eQTL)
Časové okno: Základní linie
|
Pomocí údajů o imputované genotypizaci a údajů o genové expresi budou identifikovány oblasti genomů, kde je lokální kontrola (tzv. cis-regulační elementy) pro každý gen exprimovaný v kosti.
Výstupem bude seznam genů, pro které existuje lokální genetická kontrola exprese tohoto genu a jednonukleotidového polymorfismu (polymorfismu), který se pravděpodobně účastní.
Každá položka v tomto seznamu je lokus kvantitativního znaku exprese (eQTL).
Tato analýza využívá všechna data od všech účastníků souhrnně a získané výsledky budou na úrovni průměrů za kohortu, nikoli na úrovni jednotlivých účastníků.
|
Základní linie
|
|
Společná lokalizace
Časové okno: Základní linie
|
Budou identifikovány lokusy kvantitativních znaků exprese, které se lokalizují s dříve publikovanými asociacemi široké asociační studie genomové minerální hustoty.
Pro další analýzy budou upřednostněny společné lokalizace genů.
Tato analýza využívá všechna data od všech účastníků souhrnně a získané výsledky budou na úrovni průměrů za kohortu, nikoli na úrovni jednotlivých účastníků.
|
Základní linie
|
|
Expresně-fenotypová korelace
Časové okno: Základní linie
|
U genů, pro které byly identifikovány prioritní lokusy kvantitativního znaku exprese z analýzy společné lokalizace, bude testována korelace kostní minerální denzity a dalších měření kostní hmoty a kvality s mírami genové exprese.
Tato analýza využívá všechna data od všech účastníků souhrnně a získané výsledky budou na úrovni průměrů za kohortu, nikoli na úrovni jednotlivých účastníků.
|
Základní linie
|
|
Co-expression Network
Časové okno: Základní linie
|
Údaje o genové expresi na úrovni účastníků, jak byly shromážděny ze vzorků kostí, budou použity ke konstrukci sítí interakce gen-gen.
To poskytne moduly vysoce korelované genové exprese.
Údaje o kostní denzitě získané z elektronického lékařského záznamu pacienta budou použity k identifikaci modulů, které korelují s kostní minerální hustotou. Tato analýza využívá všechna data od všech účastníků v souhrnu a získané výsledky budou na úrovni průměrů pro kohortu, nikoli na úrovni jednotlivých účastníků.
|
Základní linie
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Spolupracovníci
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD, University of Colorado, Denver
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Odhadovaný)
Začátek studia
Primární dokončení (Odhadovaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Odhadovaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 23-0602
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .