Genetische Regulatoren der Knochengesundheit, die nur für Wirbelknochen gelten
Identifizierung und Charakterisierung genetischer Regulatoren der Knochengesundheit, die nur für Wirbelknochen gelten.
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
- Telefonnummer: 3037246623
- E-Mail: CHERYL.ACKERT-BICKNELL@CUANSCHUTZ.EDU
Studienorte
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Colorado
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Aurora, Colorado, Vereinigte Staaten, 80045
- Rekrutierung
- Univeristy of Colorado Denver
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Kontakt:
- Cheryl L Ackert-Bicknell@cuAnschutz.edu, PhD
- Telefonnummer: 303-724-6623
- E-Mail: cheryl.ackert-bicknell@cuanschutz.edu
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Kontakt:
- Reed A Ayers, PhD
- Telefonnummer: 303-724-1158
- E-Mail: reed.ayers@cuanschutz.edu
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Hauptermittler:
- Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
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Hauptermittler:
- David Ou Yang, MD
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Männer und Frauen im Alter zwischen 18 und 85 Jahren, die sich einer mehrstufigen Wirbelsäulenversteifung (d. h. einer T10-Fusion (oder höher) am Becken) – ODER – einer 3-Säulen-Osteotomie mit einer Korpektomie aus einem kurzen Segmentoperationen – ODER – einer Wirbelkörperversteifung unterziehen Säulenresektion (VCR) mit Korpektomie – ODER – jede Deformitätskorrekturoperation, bei der der behandelnde Chirurg feststellt, dass eine große Menge Knochen mit trabekulären Elementen entfernt und verworfen wird.
- Bereit und in der Lage, eine Einverständniserklärung abzugeben
Ausschlusskriterien:
- Nierenerkrankung im Endstadium.
- Irgendeine Krebsgeschichte.
- Sie sind länger als 12 Monate zu 70 % oder mehr ihrer Mobilität auf einen Rollstuhl angewiesen.
- Quadra oder Querschnittslähmung aufgrund einer Rückenmarksverletzung.
- Aktueller Einsatz von Epilepsiemedikamenten.
- Bestätigtes Marfan-Syndrom, Osteogenesis imperfecta oder ein anderes genetisches Syndrom, von dem bekannt ist, dass es die Knochenbildung beeinträchtigt (Guacher-Syndrom, Vit-D-unabhängige Rachitis usw.).
- Aktueller Glukokortikoidkonsum, der länger als 3 Monate dauert, oder länger als 6 Monate lebenslange Einnahme.
- Aktuelle oder vermutete aktuelle Infektion im Zusammenhang mit orthopädischer Hardware.
- HIV- oder Hep-C-positiv und/oder derzeit antivirale Medikamente einnehmen.
- Vorgeschichte einer Magenbypass-Operation und/oder Gewichtsverlust von mehr als 100 Pfund.
- Primärer oder sekundärer Hyperparathyreoidismus.
- Morbus Paget
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
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Patienten, die sich einer Deformitätskorrekturoperation unterziehen
Patienten, die sich einer Deformitätskorrekturoperation unterziehen, die sich einer mehrstufigen Wirbelsäulenversteifung (d. h. einer T10-Fusion (oder höher) am Becken) unterziehen – ODER – einer 3-Säulen-Osteotomie mit Korpektomie bei Kurzsegmentoperationen – ODER – einer Wirbelsäulenresektion (VCR) Dies beinhaltet eine Korpektomie – ODER – eine Operation zur Deformitätskorrektur, bei der der behandelnde Chirurg feststellt, dass eine große Menge Knochen mit trabekulären Elementen entfernt und verworfen wird
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Dies ist eine Querschnittsstudie zur Probensammlung.
Bei Patienten, die sich einer Operation zur Korrektur einer Wirbelsäulendeformität unterziehen, wird Wirbelknochengewebe entnommen, das andernfalls weggeworfen würde, und in diesen Geweben wird die Genexpression gemessen.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Quantifizierung von Genen und Transkripten
Zeitfenster: Grundlinie
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Die Häufigkeit (in Transkripten pro Million, TPM) aller bekannten Transkripte wird in jeder Knochenprobe mittels RNA-Sequenzierung der nächsten Generation quantifiziert.
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Grundlinie
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Genotypen
Zeitfenster: Grundlinie
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Von allen Teilnehmern werden Daten zur Gesamtgenomsequenz mit geringer Abdeckung erhoben. Das Ergebnis sind qualitativ hochwertige Genotypen für Millionen von Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs) im gesamten Genom des Patienten.
Da es sich um eine Genotypisierung mit geringer Abdeckung handelt, liegt die Abdeckungsrate für jeden Punkt im Genom pro Patient bei der 1- bis 0,4-fachen Darstellung. Daher werden die Daten imputiert, um eine 1-fache Abdeckung für alle Patienten sicherzustellen.
Jeder Patient wird genotypisiert und daher werden Daten pro Teilnehmer erhoben.
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Grundlinie
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Sekundäre Ergebnismessungen
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Expression quantitativer Merkmalsorte (eQTL)
Zeitfenster: Grundlinie
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Mithilfe der unterstellten Genotypisierungsdaten und der Genexpressionsdaten werden Regionen des Genoms identifiziert, in denen für jedes im Knochen exprimierte Gen eine lokale Kontrolle (sogenannte cis-regulatorische Elemente) besteht.
Das zu liefernde Ergebnis wird eine Liste von Genen sein, für die es eine lokale genetische Kontrolle über die Expression dieses Gens und die wahrscheinlich beteiligten Einzelnukleotidpolymorphismen gibt.
Jeder Eintrag in dieser Liste ist ein Expression Quantitative Trait Loci (eQTL).
Bei dieser Analyse werden alle Daten aller Teilnehmer aggregiert und die erzielten Ergebnisse entsprechen den Durchschnittswerten der Kohorte und nicht der Ebene der einzelnen Teilnehmer.
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Grundlinie
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Co-Lokalisierung
Zeitfenster: Grundlinie
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Es werden Loci für quantitative Expressionsmerkmale identifiziert, die mit zuvor veröffentlichten genomweiten Assoziationsstudien zur Knochenmineraldichte kolokalisiert sind.
Co-lokalisierende Gene werden für zusätzliche Analysen priorisiert.
Bei dieser Analyse werden alle Daten aller Teilnehmer aggregiert und die erzielten Ergebnisse entsprechen den Durchschnittswerten der Kohorte und nicht der Ebene der einzelnen Teilnehmer.
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Grundlinie
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Expression-Phänotyp-Korrelation
Zeitfenster: Grundlinie
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Für die Gene, für die ein priorisierter quantitativer Expressionsmerkmalsort aus der Co-Lokalisierungsanalyse identifiziert wurde, werden die Knochenmineraldichte und andere Maße der Knochenmasse und -qualität auf Korrelation mit den Genexpressionsmaßen getestet.
Bei dieser Analyse werden alle Daten aller Teilnehmer aggregiert und die erzielten Ergebnisse entsprechen den Durchschnittswerten der Kohorte und nicht der Ebene der einzelnen Teilnehmer.
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Grundlinie
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Co-Expression-Netzwerk
Zeitfenster: Grundlinie
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Die aus Knochenproben gesammelten Genexpressionsdaten auf Teilnehmerebene werden zum Aufbau von Netzwerken der Gen-Gen-Interaktion verwendet.
Dadurch werden Module mit hochkorrelierter Genexpression entstehen.
Daten zur Knochenmineraldichte aus der elektronischen Krankenakte des Patienten werden verwendet, um Module zu identifizieren, die mit der Knochenmineraldichte korrelieren. Bei dieser Analyse werden alle Daten aller Teilnehmer zusammengefasst und die erzielten Ergebnisse entsprechen nicht den Durchschnittswerten der Kohorte auf der Ebene der einzelnen Teilnehmer.
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Grundlinie
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Mitarbeiter
Mitarbeiter
Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD, University of Colorado, Denver
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Geschätzt)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- 23-0602
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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