Genetiske regulatorer af knoglesundhed, der er unikke for vertebrale knogler
Identifikation og karakterisering af genetiske regulatorer af knoglesundhed, der er unikke for vertebrale knogler.
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
- Telefonnummer: 3037246623
- E-mail: CHERYL.ACKERT-BICKNELL@CUANSCHUTZ.EDU
Studiesteder
-
-
Colorado
-
Aurora, Colorado, Forenede Stater, 80045
- Rekruttering
- Univeristy of Colorado Denver
-
Kontakt:
- Cheryl L Ackert-Bicknell@cuAnschutz.edu, PhD
- Telefonnummer: 303-724-6623
- E-mail: cheryl.ackert-bicknell@cuanschutz.edu
-
Kontakt:
- Reed A Ayers, PhD
- Telefonnummer: 303-724-1158
- E-mail: reed.ayers@cuanschutz.edu
-
Ledende efterforsker:
- Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
-
Ledende efterforsker:
- David Ou Yang, MD
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Mænd og kvinder mellem 18 og 85 år, der gennemgår en multi-level spinal fusion (dvs. en T10 (eller højere) fusion til bækkenet) -ELLER- en 3-søjlet osteotomi med en corpectomy fra til korte segmentoperationer -ELLER- en vertebral kolonneresektion (VCR), der involverer en corpectomy -ELLER- enhver deformitetskorrektionsoperation, hvor den behandlende kirurg bestemmer, at en stor mængde knogle indeholdende trabekulære elementer vil blive fjernet og kasseret.
- Villig og i stand til at give informeret samtykke
Ekskluderingskriterier:
- Slutstadiet af nyresygdom.
- Enhver historie med kræft.
- At stole på en kørestol for 70 % eller mere af deres mobilitet i mere end 12 måneder.
- Quadra eller paraplegi på grund af rygmarvsskade.
- Nuværende brug af epilepsimedicin.
- Bekræftet Marfans, osteogenesis imperfecta eller andet genetisk syndrom, der vides at påvirke knogledannelsen (Guacher's, Vit D uafhængig rakitis osv.).
- Nuværende brug af glukokortikoid varer længere end 3 måneder eller mere end 6 måneders levetid.
- Aktuel eller formodet aktuel infektion forbundet med ortopædisk hardware.
- HIV eller Hep C positiv og eller i øjeblikket på antiviral medicin.
- Anamnese med gastrisk bypass-operation og eller vægttab på over 100 pounds.
- Primær eller sekundær hyperparathyroidisme.
- Pagets sygdom
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Patienter, der gennemgår deformitetskorrektion
Patienter, der gennemgår en deformitetskorrektionsoperation, der gennemgår en multi-level spinal fusion (dvs. en T10 (eller højere) fusion til bækkenet) -ELLER- en 3-søjlet osteotomi med en corpectomy fra til korte segmentoperationer -ELLER- en vertebral column resection (VCR) involverer en corpectomy -ELLER- enhver deformitetskorrektionskirurgi, hvor den behandlende kirurg bestemmer, at en stor mængde knogle indeholdende trabekulære elementer vil blive fjernet og kasseret
|
Dette er en tværsnitsprøveindsamlingsundersøgelse.
Vertebralt knoglevæv, som ellers ville blive kasseret, indsamles fra patienter, der gennemgår operation for at korrigere en rygsøjledeformitet, og genekspression måles i disse væv.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Kvantificering af gen og transkript
Tidsramme: Baseline
|
Overfloden (i transkriptioner pr. million, TPM) af alle kendte transkripter vil blive kvantificeret i hver knogleprøve via næste generations RNA-sekventering.
|
Baseline
|
|
Genotyper
Tidsramme: Baseline
|
Lavdækkende helgenomsekvensdata vil blive opnået fra alle deltagere, og det resulterende resultat vil være genotyper af høj kvalitet for millioner af enkeltnukleotidpolymorfi (SNP'er) på tværs af patientens genom.
Da dette er genotypebestemmelse med lav dækning, vil dækningsgraden være mellem 1 og 0,4X repræsentation for hver plet i genomet pr. patient, så dataene vil blive imputeret for at sikre dækning til 1X for alle patienter.
Hver patient vil blive genotypet, og derfor vil data på et niveau pr. deltager blive givet.
|
Baseline
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Ekspression kvantitative egenskabs loci (eQTL)
Tidsramme: Baseline
|
Ved at bruge de imputerede genotypedata og genekspressionsdataene, vil områder af genomerne, hvor der er lokal kontrol (såkaldte cis-regulatoriske elementer) af for hvert gen udtrykt i knogle, blive identificeret.
Resultatet vil være en liste over gener, for hvilke der er lokal genetisk kontrol af genets ekspression og den eller de enkelte nukleotidpolymorfier, der sandsynligvis er involveret.
Hver post på denne liste er et udtryks kvantitative træk loci (eQTL).
Denne analyse bruger alle data fra alle deltagere samlet, og de opnåede resultater vil være på niveau med gennemsnit for kohorten, ikke på det individuelle deltagerniveau.
|
Baseline
|
|
Samlokalisering
Tidsramme: Baseline
|
Ekspressions kvantitative egenskabsloci, der co-lokaliserer med tidligere publicerede knoglemineraltæthed genom-dækkende foreninger, vil blive identificeret.
Samlokaliserende gener vil blive prioriteret til yderligere analyser.
Denne analyse bruger alle data fra alle deltagere samlet, og de opnåede resultater vil være på niveau med gennemsnit for kohorten, ikke på det individuelle deltagerniveau.
|
Baseline
|
|
Ekspression-fænotype korrelation
Tidsramme: Baseline
|
For de gener, for hvilke der blev identificeret et prioriteret Ekspression kvantitativt træk loci fra co-lokaliseringsanalysen, vil knoglemineraltæthed og andre mål for knoglemasse og kvalitet blive testet for korrelation med genekspressionsmålene.
Denne analyse bruger alle data fra alle deltagere samlet, og de opnåede resultater vil være på niveau med gennemsnit for kohorten, ikke på det individuelle deltagerniveau.
|
Baseline
|
|
Samekspressionsnetværk
Tidsramme: Baseline
|
Genekspressionsdata på deltagerniveau, som indsamlet fra knogleprøver, vil blive brugt til at konstruere netværk af gen-gen-interaktion.
Dette vil give moduler af stærkt korreleret genekspression.
Knoglemineraltæthedsdata opnået fra patientens elektroniske journal vil blive brugt til at identificere moduler, der korrelerer med knoglemineraltæthed. Denne analyse bruger alle data fra alle deltagere samlet, og de opnåede resultater vil være på niveau med gennemsnit for kohorten, ikke på det individuelle deltagerniveau.
|
Baseline
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD, University of Colorado, Denver
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Anslået)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 23-0602
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .