Genetyczne regulatory zdrowia kości, które są unikalne dla kości kręgów
Identyfikacja i charakterystyka genetycznych regulatorów zdrowia kości, które są unikalne dla kości kręgów.
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
- Numer telefonu: 3037246623
- E-mail: CHERYL.ACKERT-BICKNELL@CUANSCHUTZ.EDU
Lokalizacje studiów
-
-
Colorado
-
Aurora, Colorado, Stany Zjednoczone, 80045
- Rekrutacyjny
- Univeristy of Colorado Denver
-
Kontakt:
- Cheryl L Ackert-Bicknell@cuAnschutz.edu, PhD
- Numer telefonu: 303-724-6623
- E-mail: cheryl.ackert-bicknell@cuanschutz.edu
-
Kontakt:
- Reed A Ayers, PhD
- Numer telefonu: 303-724-1158
- E-mail: reed.ayers@cuanschutz.edu
-
Główny śledczy:
- Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
-
Główny śledczy:
- David Ou Yang, MD
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Mężczyźni i kobiety w wieku od 18 do 85 lat poddawani wielopoziomowemu zespoleniu kręgosłupa (tj. zespoleniu T10 (lub wyższemu) z miednicą) -LUB- 3-kolumnowej osteotomii z korpektomią w przypadku operacji krótkich odcinków -LUB- kręgosłupa resekcja kolumny (VCR) obejmująca korpektomię -LUB- jakakolwiek operacja korekcji deformacji, w której prowadzący chirurg stwierdzi, że duża ilość kości zawierająca elementy beleczkowe zostanie usunięta i odrzucona.
- Chęć i możliwość wyrażenia świadomej zgody
Kryteria wyłączenia:
- Schyłkową niewydolnością nerek.
- Dowolna historia raka.
- Poleganie na wózku inwalidzkim przez co najmniej 70% ich mobilności przez okres dłuższy niż 12 miesięcy.
- Quadra lub paraplegia z powodu urazu rdzenia kręgowego.
- Aktualne stosowanie leków na padaczkę.
- Potwierdzony Marfan, osteogenesis imperfecta lub inny zespół genetyczny, o którym wiadomo, że wpływa na tworzenie kości (krzywica Guachera, niezależna od witaminy D itp.).
- Bieżące stosowanie glikokortykosteroidów trwające dłużej niż 3 miesiące lub ponad 6 miesięcy w ciągu całego życia.
- Obecna lub podejrzewana obecna infekcja związana ze sprzętem ortopedycznym.
- Osoby zakażone wirusem HIV lub Hep C i/lub aktualnie przyjmujące leki przeciwwirusowe.
- Historia operacji pomostowania żołądka i / lub utrata masy ciała przekraczająca 100 funtów.
- Pierwotna lub wtórna nadczynność przytarczyc.
- choroba Pageta
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Pacjenci poddawani operacji korekcji deformacji
Pacjenci poddawani operacji korekcji deformacji poddawani wielopoziomowej fuzji kręgosłupa (tj. fuzji T10 (lub wyższej) z miednicą) -LUB- 3-kolumnowa osteotomia z korpektomią z operacji krótkich segmentów -LUB- resekcja kręgosłupa (VCR) obejmujący korpektomię -LUB- jakakolwiek operacja korekcji deformacji, podczas której prowadzący chirurg stwierdzi, że duża ilość kości zawierająca elementy beleczkowe zostanie usunięta i wyrzucona
|
Jest to przekrojowe badanie pobierania próbek.
Tkanka kostna kręgów, która w przeciwnym razie zostałaby wyrzucona, jest pobierana od pacjentów poddawanych operacji korygowania deformacji kręgosłupa i mierzona jest ekspresja genów w tych tkankach.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Kwantyfikacja genów i transkryptów
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Obfitość (w transkryptach na milion, TPM) wszystkich znanych transkryptów zostanie określona ilościowo w każdej próbce kości za pomocą sekwencjonowania RNA nowej generacji.
|
Linia bazowa
|
|
Genotypy
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Dane o sekwencji całego genomu o niskim zasięgu zostaną uzyskane od wszystkich uczestników, a uzyskanym wynikiem będą wysokiej jakości genotypy dla milionów polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) w całym genomie pacjenta.
Ponieważ jest to genotypowanie o niskim pokryciu, współczynnik pokrycia będzie wynosił od reprezentacji 1 do 0,4X dla każdego miejsca w genomie na pacjenta, więc dane zostaną przypisane, aby zapewnić pokrycie do 1X dla wszystkich pacjentów.
Każdy pacjent zostanie poddany genotypowi, a zatem zostaną uzyskane dane na poziomie każdego uczestnika.
|
Linia bazowa
|
Miary wyników drugorzędnych
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Ekspresyjne loci cech ilościowych (eQTL)
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Korzystając z imputowanych danych genotypowania i danych dotyczących ekspresji genów, zostaną zidentyfikowane regiony genomów, w których występuje lokalna kontrola (tzw. elementy cis-regulatorowe) dla każdego genu ulegającego ekspresji w kości.
Efektem końcowym będzie lista genów, dla których istnieje lokalna kontrola genetyczna ekspresji tego genu oraz polimorfizm(y) pojedynczego nukleotydu, który prawdopodobnie będzie zaangażowany.
Każdy wpis na tej liście jest loci cechy ilościowej ekspresji (eQTL).
Ta analiza wykorzystuje wszystkie dane od wszystkich uczestników łącznie, a otrzymane wyniki będą na poziomie średnich dla kohorty, a nie na poziomie poszczególnych uczestników.
|
Linia bazowa
|
|
Wspólna lokalizacja
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Zidentyfikowane zostaną loci cech ilościowych ekspresji, które współlokalizują się z wcześniej opublikowanymi powiązaniami badania asocjacyjnego całego genomu gęstości mineralnej kości.
Geny kolokalizujące zostaną potraktowane priorytetowo w dodatkowych analizach.
Ta analiza wykorzystuje wszystkie dane od wszystkich uczestników łącznie, a otrzymane wyniki będą na poziomie średnich dla kohorty, a nie na poziomie poszczególnych uczestników.
|
Linia bazowa
|
|
Korelacja ekspresja-fenotyp
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
W przypadku genów, dla których z analizy kolokalizacji zidentyfikowano priorytetowe loci cechy ilościowej ekspresji, gęstość mineralna kości i inne miary masy i jakości kości zostaną przetestowane pod kątem korelacji z miarami ekspresji genów.
Ta analiza wykorzystuje wszystkie dane od wszystkich uczestników łącznie, a otrzymane wyniki będą na poziomie średnich dla kohorty, a nie na poziomie poszczególnych uczestników.
|
Linia bazowa
|
|
Sieć koekspresji
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Dane dotyczące ekspresji genów na poziomie uczestnika, zebrane z próbek kości, zostaną wykorzystane do skonstruowania sieci interakcji gen-gen.
To da moduły wysoce skorelowanej ekspresji genów.
Dane dotyczące gęstości mineralnej kości uzyskane z elektronicznej dokumentacji medycznej pacjenta zostaną wykorzystane do zidentyfikowania modułów, które korelują z gęstością mineralną kości. Ta analiza wykorzystuje wszystkie dane od wszystkich uczestników łącznie, a otrzymane wyniki będą na poziomie średnich dla kohorty, a nie na poziomie uczestnika indywidualnego.
|
Linia bazowa
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Współpracownicy
Współpracownicy
Śledczy
Śledczy
- Główny śledczy: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD, University of Colorado, Denver
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Szacowany)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Szacowany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- 23-0602
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .