Regolatori genetici della salute delle ossa che sono unici per l'osso vertebrale
Identificazione e caratterizzazione dei regolatori genetici della salute ossea che sono unici per l'osso vertebrale.
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Intervento / Trattamento
Intervento / Trattamento
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Contatto studio
Contatto studio
- Nome: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
- Numero di telefono: 3037246623
- Email: CHERYL.ACKERT-BICKNELL@CUANSCHUTZ.EDU
Luoghi di studio
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Colorado
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Aurora, Colorado, Stati Uniti, 80045
- Reclutamento
- Univeristy of Colorado Denver
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Contatto:
- Cheryl L Ackert-Bicknell@cuAnschutz.edu, PhD
- Numero di telefono: 303-724-6623
- Email: cheryl.ackert-bicknell@cuanschutz.edu
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Contatto:
- Reed A Ayers, PhD
- Numero di telefono: 303-724-1158
- Email: reed.ayers@cuanschutz.edu
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Investigatore principale:
- Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD
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Investigatore principale:
- David Ou Yang, MD
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
- Adulto
- Adulto più anziano
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Uomini e donne di età compresa tra 18 e 85 anni sottoposti a fusione spinale multilivello (ossia fusione T10 (o superiore) al bacino) -OPPURE- osteotomia a 3 colonne con corpectomia per interventi chirurgici su segmenti corti -OPPURE- chirurgia vertebrale resezione della colonna (VCR) che comporta una corpectomia -OPPURE- qualsiasi intervento chirurgico di correzione della deformità in cui il chirurgo curante determina che una grande quantità di osso contenente elementi trabecolari verrà rimossa e scartata.
- Disposto e in grado di fornire il consenso informato
Criteri di esclusione:
- Malattia renale allo stadio terminale.
- Qualsiasi storia di cancro.
- Dipendenza da una sedia a rotelle per il 70% o più della propria mobilità per più di 12 mesi.
- Quadra o paraplegia dovuta a lesione del midollo spinale.
- Uso corrente di farmaci per l'epilessia.
- Marfan confermati, osteogenesi imperfetta o altra sindrome genetica nota per avere un impatto sulla formazione ossea (Guacher, rachitismo indipendente dalla vitamina D, ecc.).
- Uso attuale di glucocorticoidi che dura più di 3 mesi o più di 6 mesi di uso una tantum.
- Infezione attuale o sospetta in corso associata a hardware ortopedico.
- HIV o Hep C positivo e/o attualmente in trattamento con farmaci antivirali.
- Storia di intervento chirurgico di bypass gastrico e/o perdita di peso superiore a 100 libbre.
- Iperparatiroidismo primario o secondario.
- Malattia di Paget
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
Intervento / TrattamentoIntervento / Trattamento |
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Pazienti sottoposti a chirurgia per la correzione della deformità
Pazienti sottoposti a intervento chirurgico di correzione della deformità sottoposti a fusione spinale multilivello (ovvero fusione T10 (o superiore) al bacino) -OPPURE- osteotomia a 3 colonne con corpectomia per interventi chirurgici a segmenti corti -OPPURE- resezione della colonna vertebrale (VCR) che coinvolge una corpectomia -O- qualsiasi intervento chirurgico di correzione della deformità in cui il chirurgo curante determina che una grande quantità di osso contenente elementi trabecolari verrà rimossa e scartata
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Questo è uno studio trasversale sulla raccolta di campioni.
Il tessuto osseo vertebrale che altrimenti verrebbe scartato viene raccolto da pazienti sottoposti a intervento chirurgico per correggere una deformità della colonna vertebrale e l'espressione genica viene misurata in questi tessuti.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Quantificazione di geni e trascritti
Lasso di tempo: Linea di base
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Le abbondanze (in trascritti per milione, TPM) di tutti i trascritti conosciuti saranno quantificate in ciascun campione osseo tramite sequenziamento di RNA di nuova generazione.
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Linea di base
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Genotipi
Lasso di tempo: Linea di base
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I dati sulla sequenza dell'intero genoma a bassa copertura saranno ottenuti da tutti i partecipanti e il risultato prodotto saranno genotipi di alta qualità per milioni di polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) attraverso il genoma del paziente.
Poiché si tratta di una genotipizzazione a bassa copertura, il tasso di copertura sarà compreso tra 1 e 0,4 volte la rappresentazione per ogni punto del genoma per paziente, quindi i dati verranno imputati per garantire la copertura a 1 volta per tutti i pazienti.
Ogni paziente sarà genotipizzato e, pertanto, verranno forniti i dati a livello di partecipante.
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Linea di base
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Loci del tratto quantitativo dell'espressione (eQTL)
Lasso di tempo: Linea di base
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Utilizzando i dati di genotipizzazione imputati ei dati di espressione genica, verranno identificate le regioni dei genomi in cui esiste il controllo locale (i cosiddetti elementi cis-regolatori) per ciascun gene espresso nell'osso.
Il risultato finale sarà un elenco di geni per i quali esiste un controllo genetico locale dell'espressione di quel gene e del/i polimorfismo/i a singolo nucleotide che potrebbero essere coinvolti.
Ogni voce in questo elenco è un loci tratto quantitativo di espressione (eQTL).
Questa analisi utilizza tutti i dati di tutti i partecipanti in forma aggregata e i risultati ottenuti saranno a livello di medie per la coorte, non a livello di singolo partecipante.
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Linea di base
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Co-localizzazione
Lasso di tempo: Linea di base
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Saranno identificati i loci dei tratti quantitativi di espressione che co-localizzano con le associazioni di studi di associazione ampia del genoma della densità minerale ossea precedentemente pubblicate.
I geni co-localizzanti avranno la priorità per ulteriori analisi.
Questa analisi utilizza tutti i dati di tutti i partecipanti in forma aggregata e i risultati ottenuti saranno a livello di medie per la coorte, non a livello di singolo partecipante.
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Linea di base
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Correlazione espressione-fenotipo
Lasso di tempo: Linea di base
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Per i geni per i quali è stato identificato un loci di tratto quantitativo di espressione prioritario dall'analisi di co-localizzazione, la densità minerale ossea e altre misure di massa e qualità ossea saranno testate per la correlazione con le misure di espressione genica.
Questa analisi utilizza tutti i dati di tutti i partecipanti in forma aggregata e i risultati ottenuti saranno a livello di medie per la coorte, non a livello di singolo partecipante.
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Linea di base
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Rete di coespressione
Lasso di tempo: Linea di base
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I dati di espressione genica a livello di partecipante, raccolti da campioni ossei, saranno utilizzati per costruire reti di interazione gene-gene.
Ciò produrrà moduli di espressione genica altamente correlati.
I dati sulla densità minerale ossea ottenuti dalla cartella clinica elettronica del paziente verranno utilizzati per identificare i moduli correlati alla densità minerale ossea. Questa analisi utilizza tutti i dati di tutti i partecipanti in forma aggregata e i risultati ottenuti saranno a livello di medie per la coorte, non a livello di singolo partecipante.
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Linea di base
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Collaboratori
Collaboratori
Investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Cheryl L Ackert-Bicknell, PhD, University of Colorado, Denver
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Stimato)
Inizio studio
Completamento primario (Stimato)
Completamento primario
Completamento dello studio (Stimato)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- 23-0602
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