Vzorky kožní biopsie jako biomarkery systémové sklerózy a reakce na mykofenolát mofetil

Systémová skleróza (SSc) je autoimunitní onemocnění pojivové tkáně postihující především ženy v mladém až středním věku. Patogeneze SSc je komplexní a zahrnuje souhru tří zdánlivě odlišných procesů: autoimunity, vaskulopatie a fibrózy. Pacienti pociťují různé stupně invalidizujícího ztluštění kůže a potenciálně život ohrožující fibrózu vnitřních orgánů a vaskulopatii, ale neexistuje způsob, jak přesně předpovědět podtyp onemocnění a riziko závažnosti a progrese. Současná experimentální léčba SSc zahrnuje perorální a intravenózní cyklofosfamid a mykofenolát mofetil, které otupují imunitní odpověď, transplantaci autologních kmenových buněk, která může resetovat imunitní systém, a imatinib mesylát, který může snížit fibrózu.

Nedávný vzrušující výzkum genomiky z naší laboratoře a našeho spolupracovníka naznačuje, že vzorky kožní biopsie získané od pacientů s SSc mají ve srovnání s kontrolami výrazné změny v profilech genové exprese. Výrazné byly změny v expresi genů, o kterých je známo, že se podílejí na profibrotických drahách. Tento návrh popisuje nové experimenty k vyhodnocení genomických přístupů ve spojení s klinickými daty k identifikaci podskupin pacientů, predikci odpovědi na léčbu a k lepšímu pochopení molekulárního základu patogeneze onemocnění a odpovědi na léčbu.

Northwestern Scleroderma Program (NSP) je nový multidisciplinární program, který urychluje výzkum SSc a poskytuje komplexní péči > 400 pacientům se SSc. Standardizované klinické informace včetně demografických, laboratorních a diagnostických dat (echokardiografie, počítačová tomografie hrudníku s vysokým rozlišením a testování plicních funkcí) a také DNA jsou v současné době shromažďovány u všech pacientů a vkládány do klinické databáze. Pacientům s NSP bude nabídnuta možnost darovat dermální tkáň pro genomickou analýzu pomocí dříve zavedeného, ​​optimalizovaného přístupu k extrakci RNA ze vzorků tkáně.

Předpokládáme, že naše technika DNA microarray umožní analýzu změn v genové expresi z kůže pacientů podstupujících dermální biopsie před a po léčbě a kromě poskytnutí nových důležitých informací o známých fibrotických drahách identifikuje nerozpoznané profibrotické dráhy. Získané znalosti nejen prohloubí naše chápání molekulárních drah účastnících se fibrózy, ale také nám poskytnou způsob, jak spolehlivě předpovědět, kteří pacienti budou pravděpodobně reagovat na různé druhy léčby.

Relevantnost:

SSc je devastující osiřelé onemocnění pojivové tkáně, u kterého není známa léčba. V současnosti neexistují žádné biomarkery onemocnění, které by mohly přesně předpovědět podtyp onemocnění nebo riziko postižení a progrese vnitřních orgánů. Pomocí dobře zavedených genomických technik bude současný návrh zkoumat, zda změny v genové expresi profibrotických drah v dermálních biopsiích před a po různých ošetřeních korelují s klinickou odpovědí. Pokud ano, genonická analýza dermální tkáně může být užitečná pro lepší pochopení molekulární patogeneze SSc a jako biomarkeru onemocnění.