Bakterie a záněty ve střevě (BIG) Studie (BIG)

Nulová hypotéza je, že klinická odpověď na výlučnou enterální výživu (EEN) a snížení markerů zánětu tlustého střeva nejsou spojeny s charakteristickou bakteriální taxonomií (složením) a metabolity (funkčností); a že udržení jakýchkoli bakteriálních změn pomocí doplňkové enterální výživy ( SEN), při návratu k obvyklé stravě nesnižuje riziko relapsu onemocnění.

Návrh studie bude vycházet z předchozí práce tím, že se podívá na rozdíly ve střevních bakteriích (fekálních a slizničních) a bakteriální metabolické aktivitě v různých fázích aktivity onemocnění. Budou zkoumány změny v bakteriálním složení mezi skupinami onemocnění, mezi dětmi s Crohnovou chorobou na různých léčbách a mezi různými místy ve střevě. Biomarkery Crohnovy choroby ve stolici a moči budou také hodnoceny analýzou bakteriálních metabolitů.

Celkem bude přijato až 42 dětí s Crohnovou chorobou. Bude také přijato 42 zdravých dětí, aby poskytly vzorek stolice a moči, aby se pro srovnání ukázala normální rozmanitost střevních bakterií a metabolitů u zdravých dětí.

Děti, které podstoupily kolonoskopii, ale neměly Crohnovu chorobu, budou použity jako srovnávací skupina pro pokus o identifikaci bakteriálních signatur Crohnovy choroby ze stolice a moči a jako kontrolní skupina bez Crohnovy choroby pro srovnání slizničních biopsií.

Nábor Této studie se zúčastní tři skupiny dětí. A. Děti podstupující endoskopické vyšetření (kolonoskopii) na zánět tlustého střeva včetně Crohnovy choroby [děti, u kterých se zjistí, že nemají Crohnovu chorobu, se nebudou účastnit následného aspektu (během léčby EEN) této studie].

B. Dříve diagnostikovaní pacienti s Crohnovou chorobou kvůli zahájení 8týdenní standardní léčby EEN kvůli vzplanutí onemocnění.

C. Jako kontrolní skupina budou použity zdravé děti, které nemají vztah k pacientům s Crohnovou chorobou.

Skupiny A a B: počáteční vzorek krve, moči, stolice následovaný 5 dalšími vzorky stolice a moči během 12 měsíců; a informace o dietě.

[Skupině A bude také odebráno 8 slizničních biopsií během rutinní endoskopie]. Během léčby EEN (klinické rozhodnutí) bude požadován další vzorek krve během rutinního odběru krve na začátku a na konci léčby.

Skupina C: Bude požadován 1 vzorek moči a stolice.

Všechny skupiny budou mít naměřenou výšku, váhu a sílu úchopu na začátku. Účastníkovi, který obdrží EEN, bude toto opakováno 60 dnů po zahájení léčby a 60 dnů po ukončení léčby.

Podrobné metody Předběžná kontrola zdravotního stavu pomocí krátkého zdravotního dotazníku - základní zdravotní údaje, věk, případné léky.

Vzorky sliznice: u nově diagnostikovaných pacientů s kolonoskopií pro diagnostické účely dalších 6 vzorků slizniční biopsie; Pokud je to možné, 2 z terminálního ilea, 2 z proximálního tračníku a 2 z distálního tračníku budou odebrány (14-16 se odebere při normální kolonoskopii). Během horní endoskopie budou také odebrány další 2 bioptické vzorky z duodena.

Informace o stravě: obvyklý dietní příjem a stravovací návyky hodnocené pomocí validovaného dotazníku Food Frequency Questionnaire (FFQ); 5krokový dotazník s vícenásobným průchodem 24 hodinovým dotazníkem pro stažení ze stravy pro údaje o aktuální stravě v době odběru vzorků stolice a moči.

Shoda s EEN (pouze skupiny A&B): vyplnění krátkého dotazníku shody s EEN po 28 dnech a 56 dnech.

Medikace a anamnéza nemocí: informace o aktivitě nemoci, medikaci a anamnéze shromážděné z lékařských poznámek.

Laboratorní testy Bakteriální diverzita: Diverzita a složení střevních bakterií ze vzorků stolice bude měřeno pomocí molekulárních technik, jako je kvantitativní polymerázová řetězová reakce (PCR) z bakteriální ribozomální DNA a sekvenování nové generace (metagenomika). Tyto techniky budou také použity ke zkoumání složení bakterií spojených s biopsiemi slizniční tkáně. Změny v celkovém složení střevních bakterií pomocí standardních numerických indexů budou měřeny u 6 vzorků stolice odebraných během 12 měsíců, stejně jako mezi skupinami.

Bakteriální metabolismus: Velký počet různých produktů bakteriálního metabolismu, jako jsou mastné kyseliny s krátkým řetězcem, sulfid a amoniak, bude měřen pomocí řady technik včetně plynové chromatografie a hmotnostní spektrometrie plynové chromatografie (GCMS) (metabolomika). Bude také měřeno pH stolice, marker bakteriální fermentace.

Markery onemocnění: Jiné markery onemocnění a metabolity, jako je fekální kalprotektin, budou měřeny ze vzorků stolice.