Badanie bakterii i stanów zapalnych w jelitach (BIG). (BIG)

Hipotezą zerową jest to, że odpowiedź kliniczna na wyłączne żywienie dojelitowe (EEN) i zmniejszenie markerów stanu zapalnego okrężnicy nie są związane z charakterystyczną taksonomią bakterii (składem) i metabolitami (funkcjonalnością); oraz że utrzymanie wszelkich zmian bakteryjnych dzięki uzupełniającemu żywieniu dojelitowemu ( SEN), przy powrocie do zwykłej diety, nie zmniejsza ryzyka nawrotu choroby.

Projekt badania będzie opierał się na wcześniejszych pracach, analizując różnice zarówno w bakteriach jelitowych (kał i błona śluzowa), jak iw aktywności metabolicznej bakterii na różnych etapach aktywności choroby. Zbadane zostaną zmiany składu bakteryjnego między grupami chorób, między dziećmi z chorobą Leśniowskiego-Crohna stosującymi różne metody leczenia oraz między różnymi miejscami w jelitach. Biomarkery choroby Leśniowskiego-Crohna w kale i moczu zostaną również ocenione poprzez analizę metabolitów bakteryjnych.

Zatrudnionych zostanie łącznie 42 dzieci z chorobą Leśniowskiego-Crohna. 42 zdrowych dzieci zostanie również zrekrutowanych w celu pobrania próbki kału i moczu, aby pokazać normalną różnorodność bakterii jelitowych i metabolitów u zdrowych dzieci w celu porównania.

Dzieci, które przeszły kolonoskopię, ale nie miały choroby Leśniowskiego-Crohna, zostaną wykorzystane jako grupa porównawcza do próby zidentyfikowania sygnatur bakteryjnych choroby Leśniowskiego-Crohna w kale i moczu oraz jako grupa kontrolna bez choroby Leśniowskiego-Crohna do porównania biopsji błony śluzowej.

Rekrutacja W badaniu wezmą udział trzy grupy dzieci. A. Dzieci poddawane badaniom endoskopowym (kolonoskopia) w kierunku zapalenia okrężnicy, w tym choroby Leśniowskiego-Crohna [dzieci, u których nie stwierdzono choroby Leśniowskiego-Crohna, nie będą uczestniczyć w części kontrolnej (podczas leczenia EEN) tego badania].

B. Pacjenci z wcześniej rozpoznaną chorobą Leśniowskiego-Crohna, którzy mają rozpocząć standardową 8-tygodniową kurację EEN z powodu zaostrzenia choroby.

C. Zdrowe dzieci niespokrewnione z pacjentami z chorobą Leśniowskiego-Crohna będą stanowić grupę kontrolną.

Grupy A i B: początkowa próbka krwi, moczu i kału, a następnie 5 kolejnych próbek kału i moczu w ciągu 12 miesięcy; i informacje o diecie.

[Grupa A będzie miała również 8 biopsji błony śluzowej pobranych podczas rutynowej endoskopii]. Podczas leczenia EEN (decyzja kliniczna) wymagane będzie pobranie dodatkowej próbki krwi podczas rutynowego pobierania krwi na początku i na końcu leczenia.

Grupa C: zostanie pobrana 1 próbka moczu i kału.

Wszystkie grupy będą miały mierzony wzrost, wagę i siłę chwytu na linii podstawowej. Uczestnik otrzymujący EEN będzie miał to powtórzone 60 dni po rozpoczęciu leczenia i 60 dni po zakończeniu leczenia.

Metody szczegółowe Wstępne sprawdzenie stanu zdrowia za pomocą krótkiej ankiety dotyczącej stanu zdrowia – podstawowe informacje o stanie zdrowia, wiek, przyjmowane leki.

Próbki błony śluzowej: u nowo zdiagnozowanych pacjentów, u których wykonano kolonoskopię w celach diagnostycznych dodatkowo 6 próbek biopsji błony śluzowej; Jeśli to możliwe, zostaną pobrane 2 z końcowego odcinka jelita krętego, 2 z proksymalnej okrężnicy i 2 z dystalnej okrężnicy (14-16 pobiera się podczas normalnej kolonoskopii). Dodatkowe 2 próbki biopsji zostaną również pobrane z dwunastnicy podczas endoskopii górnego odcinka.

Informacje dietetyczne: nawyki żywieniowe i wzorce żywieniowe oceniane za pomocą zatwierdzonego Kwestionariusza Częstotliwości Żywności (FFQ); 5-etapowy, wielokrotny, 24-godzinny kwestionariusz przypominający o diecie dla danych na temat rzeczywistej diety w czasie pobierania próbek kału i moczu.

Zgodność z EEN (tylko grupy A i B): wypełnienie krótkiego kwestionariusza zgodności z EEN w punktach czasowych 28 dni i 56 dni.

Historia leków i chorób: informacje o aktywności choroby, lekach i historii medycznej zebrane z notatek medycznych.

Testy laboratoryjne Różnorodność bakterii: Różnorodność bakterii jelitowych i skład próbek kału zostaną zmierzone przy użyciu technik molekularnych, takich jak ilościowa reakcja łańcuchowa polimerazy (PCR) z rybosomalnego DNA bakterii i sekwencjonowanie nowej generacji (metagenomika). Techniki te zostaną również wykorzystane do zbadania składu bakterii związanych z biopsjami tkanki śluzówki. Zmiany w ogólnym składzie bakterii jelitowych przy użyciu standardowych wskaźników liczbowych będą mierzone w 6 próbkach kału zebranych w okresie 12 miesięcy, jak również między grupami.

Metabolizm bakterii: Duża liczba różnych produktów metabolizmu bakterii, takich jak krótkołańcuchowe kwasy tłuszczowe, siarczki i amoniak, będzie mierzona przy użyciu szeregu technik, w tym chromatografii gazowej i chromatografii gazowej ze spektrometrią mas (GCMS) (metabolomika). Zmierzone zostanie również pH kału, wskaźnik fermentacji bakteryjnej.

Markery chorób: inne markery chorób i metabolity, takie jak kalprotektyna w kale, będą mierzone w próbkach kału.