Bakterier og inflammation i tarmen (BIG) undersøgelse (BIG)

Nulhypotesen er, at den kliniske respons på eksklusiv enteral ernæring (EEN) og reduktion af colon inflammatoriske markører ikke er forbundet med en karakteristisk bakteriel taksonomi (sammensætning) og metabolitter (funktionalitet); og at opretholdelse af eventuelle bakterielle ændringer med supplerende enteral ernæring ( SEN), mens man vender tilbage til sædvanlig kost, reducerer det ikke risikoen for tilbagefald af sygdommen.

Undersøgelsesdesignet vil bygge på tidligere arbejde ved at se på forskelle i både tarmbakterier (fækal og slimhinde) og bakteriel metabolisk aktivitet på forskellige stadier af sygdomsaktivitet. Ændringer i bakteriesammensætning mellem sygdomsgrupper vil blive undersøgt, mellem børn med Crohns sygdom på forskellige behandlinger og mellem forskellige steder i tarmen. Biomarkører for Crohns sygdom i fæces og urin vil også blive vurderet ved at analysere bakterielle metabolitter.

Op til i alt 42 børn med Crohns sygdom vil blive rekrutteret. 42 raske børn vil også blive rekrutteret til at give en fækal- og urinprøve for at vise den normale variation af tarmbakterier og metabolitter hos raske børn til sammenligning.

Børn, der har gennemgået koloskopi, men ikke havde Crohns sygdom, vil blive brugt som en sammenligningsgruppe til at forsøge at identificere Crohns sygdom bakterielle signaturer fra fæces og urin, og som en ikke-Crohns sygdom kontrolgruppe til sammenligning af slimhindebiopsier.

Rekruttering Tre grupper af børn vil deltage i denne undersøgelse. A. Børn, der gennemgår endoskopiske undersøgelser (koloskopi) for colonbetændelse inklusive Crohns sygdom [børn, der ikke har Crohns sygdom, vil ikke deltage i opfølgningsaspektet (under behandling med EEN) af denne undersøgelse].

B. Tidligere diagnosticerede patienter med Crohns sygdom, der skal starte et 8 ugers standardbehandlingsforløb med EEN på grund af sygdomsopblussen.

C. Raske børn uden relation til Crohns sygdomspatienter vil blive brugt som kontrolgruppe.

Gruppe A og B: en indledende blod-, urin-, fæcesprøve efterfulgt af 5 yderligere fæces- og urinprøver over 12 måneder; og kostinformation.

[Gruppe A vil også få taget 8 slimhindebiopsier under rutinemæssig endoskopi]. Under behandling med EEN (klinisk beslutning) vil der blive anmodet om en ekstra blodprøve under rutinemæssig blodprøvetagning ved start og afslutning af behandlingen.

Gruppe C: Der vil blive anmodet om 1 urin- og fæcesprøve.

Alle grupper vil have højde, vægt og grebsstyrke målt ved baseline. Deltager, der modtager EEN, vil få dette gentaget 60 dage efter behandlingsstart og 60 dage efter endt behandling.

Detaljerede metoder Indledende helbredstjek ved hjælp af et kort sundhedsspørgeskema - grundlæggende helbredsoplysninger, alder, enhver medicin.

Slimhindeprøver: hos nydiagnosticerede patienter, der får en koloskopi til diagnostiske formål, yderligere 6 slimhindebiopsiprøver; 2 fra den terminale ileum, når det er muligt, 2 fra den proksimale colon og 2 fra den distale colon (14-16 opsamles ved normal koloskopi). Yderligere 2 biopsiprøver vil også blive indsamlet fra duodenum under øvre endoskopi.

Kostoplysninger: sædvanligt diætindtag og spisemønstre vurderet ved hjælp af valideret Food Frequency Questionnaire (FFQ); et 5-trins multiple pass 24-timers diætindkaldelsesspørgeskema til data om faktisk kost på tidspunktet for fækal- og urinprøvetagning.

EEN-overholdelse (kun gruppe A&B): udfyldelse af kort EEN-overholdelsesspørgeskema på 28 dage og 56 dage.

Medicin og sygdomshistorie: oplysninger om sygdomsaktivitet, medicin og sygehistorie indsamlet fra lægenotater.

Laboratorieanalyser Bakteriel diversitet: Tarmens bakteriediversitet og sammensætning fra afføringsprøver vil blive målt ved hjælp af molekylære teknikker såsom kvantitativ polymerasekædereaktion (PCR) fra bakterielt ribosomalt DNA og næste generations sekventering (metagenomics). Disse teknikker vil også blive brugt til at se på sammensætningen af ​​bakterier forbundet med slimhindevævsbiopsier. Ændringer i den samlede sammensætning af tarmbakterier ved hjælp af standard numeriske indeks vil blive målt på tværs af de 6 fæcesprøver indsamlet over 12 måneders perioden, såvel som mellem grupper.

Bakteriemetabolisme: En lang række forskellige produkter fra bakteriel metabolisme, såsom kortkædede fedtsyrer, sulfid og ammoniak vil blive målt ved hjælp af en række teknikker, herunder gaskromatografi og gaskromatografi massespektrometri (GCMS) (metabolomics). Fæcal pH, en markør for bakteriel fermentering, vil også blive målt.

Sygdomsmarkører: Andre sygdomsmarkører og metabolitter som fækalt calprotectin vil blive målt fra fæcesprøver.