Исследование бактерий и воспаления в кишечнике (БОЛЬШОЕ) (BIG)

Нулевая гипотеза состоит в том, что клинический ответ на исключительное энтеральное питание (ЭЭП) и снижение маркеров воспаления в толстой кишке не связаны с характерной бактериальной таксономией (состав) и метаболитами (функциональность); и что сохранение любых бактериальных изменений при дополнительном энтеральном питании (см. СЭН), при возвращении к привычному питанию, не снижает риск рецидива заболевания.

Дизайн исследования будет основываться на предыдущей работе, рассматривая различия как в кишечных бактериях (фекальных и слизистых), так и в метаболической активности бактерий на разных стадиях активности заболевания. Будут изучены изменения в бактериальном составе между группами заболеваний, между детьми с болезнью Крона, получающими разное лечение, и между разными участками кишечника. Биомаркеры болезни Крона в фекалиях и моче также будут оцениваться путем анализа бактериальных метаболитов.

Всего будет набрано до 42 детей с болезнью Крона. 42 здоровых ребенка также будут набраны для предоставления образцов кала и мочи, чтобы показать нормальное разнообразие кишечных бактерий и метаболитов у здоровых детей для сравнения.

Дети, перенесшие колоноскопию, но не страдавшие болезнью Крона, будут использоваться в качестве группы сравнения, чтобы попытаться идентифицировать бактериальные сигнатуры болезни Крона в фекалиях и моче, и в качестве контрольной группы без болезни Крона для сравнения биопсий слизистой оболочки.

Набор В этом исследовании примут участие три группы детей. A. Дети, проходящие эндоскопическое исследование (колоноскопию) по поводу воспаления толстой кишки, включая болезнь Крона [дети, у которых не обнаружено болезни Крона, не будут участвовать в последующем аспекте (во время лечения ЭЭН) этого исследования].

B. Пациенты с ранее диагностированной болезнью Крона должны начать 8-недельный стандартный курс лечения ЭЭН из-за обострения заболевания.

C. Здоровые дети, не являющиеся родственниками больных болезнью Крона, будут использоваться в качестве контрольной группы.

Группы A и B: первоначальный образец крови, мочи, кала, затем 5 дополнительных образцов кала и мочи в течение 12 месяцев; и диетическая информация.

[У группы А также будет 8 биопсий слизистой оболочки во время обычной эндоскопии]. Во время лечения EEN (клиническое решение) будет запрошен дополнительный образец крови во время обычного забора крови в начале и в конце лечения.

Группа C: будет запрошен 1 образец мочи и кала.

Все группы будут иметь рост, вес и силу хвата, измеренные на исходном уровне. Участнику, получающему EEN, это повторится через 60 дней после начала лечения и через 60 дней после окончания лечения.

Подробные методы. Предварительная проверка состояния здоровья с помощью короткой анкеты о состоянии здоровья – основная информация о состоянии здоровья, возраст, принимаемые лекарства.

Образцы слизистой оболочки: у вновь диагностированных пациентов, которым проводится колоноскопия в диагностических целях, дополнительно 6 образцов биопсии слизистой оболочки; 2 из терминального отдела подвздошной кишки, если это возможно, 2 из проксимального отдела толстой кишки и 2 из дистального отдела толстой кишки (14-16 собираются при обычной колоноскопии). Дополнительные 2 образца биопсии также будут взяты из двенадцатиперстной кишки во время эндоскопии верхних отделов.

Информация о диете: обычное потребление пищи и схемы питания, оцененные с использованием утвержденного вопросника частоты пищевых продуктов (FFQ); 5-шаговый многопроходный 24-часовой опросный лист о питании для данных о фактическом питании во время отбора проб кала и мочи.

Соответствие EEN (только группы A и B): заполнение короткого вопросника соответствия EEN через 28 дней и 56 дней.

Медикаменты и история болезни: информация об активности болезни, лекарствах и истории болезни, собранная из медицинских записей.

Лабораторные анализы Бактериальное разнообразие. Разнообразие и состав кишечных бактерий из образцов стула будут измеряться с использованием молекулярных методов, таких как количественная полимеразная цепная реакция (ПЦР) из бактериальной рибосомной ДНК и секвенирование следующего поколения (метагеномика). Эти методы также будут использоваться для изучения состава бактерий, ассоциированных с биоптатами слизистой оболочки. Изменения в общем составе кишечных бактерий с использованием стандартных числовых показателей будут измеряться в 6 образцах фекалий, собранных в течение 12-месячного периода, а также между группами.

Метаболизм бактерий. Большое количество различных продуктов бактериального метаболизма, таких как жирные кислоты с короткой цепью, сульфиды и аммиак, будет измеряться с использованием ряда методов, включая газовую хроматографию и масс-спектрометрию с газовой хроматографией (ГХ-МС) (метаболомика). Также будет измеряться рН фекалий, маркер бактериальной ферментации.

Маркеры заболеваний: Другие маркеры заболеваний и метаболиты, такие как фекальный кальпротектин, будут измеряться в образцах фекалий.