Bakterier og betennelse i tarmen (BIG) studie (BIG)

Nullhypotesen er at den kliniske responsen på eksklusiv enteral ernæring (EEN) og reduksjon av koloninflammatoriske markører ikke er assosiert med en karakteristisk bakteriell taksonomi (sammensetning) og metabolitter (funksjonalitet); og at vedlikehold av eventuelle bakterielle endringer med supplerende enteral ernæring ( SEN), mens du går tilbake til vanlig kosthold, reduserer ikke risikoen for tilbakefall av sykdom.

Studiedesignet vil bygge på tidligere arbeid ved å se på forskjeller i både tarmbakterier (fekal og slimhinne) og bakteriell metabolsk aktivitet på ulike stadier av sykdomsaktivitet. Endringer i bakteriesammensetning mellom sykdomsgrupper vil bli undersøkt, mellom barn med Crohns sykdom på ulike behandlinger og mellom ulike steder i tarmen. Biomarkører for Crohns sykdom i feces og urin vil også bli vurdert ved å analysere bakterielle metabolitter.

Inntil totalt 42 barn med Crohns sykdom skal rekrutteres. 42 friske barn vil også bli rekruttert til å gi en avførings- og urinprøve, for å vise den normale variasjonen av tarmbakterier og metabolitter hos friske barn til sammenligning.

Barn som gjennomgikk koloskopi, men ikke hadde Crohns sykdom, vil bli brukt som en sammenligningsgruppe for å prøve å identifisere Crohns sykdoms bakteriesignaturer fra avføring og urin, og som en ikke-Crohns sykdom kontrollgruppe for sammenligning av slimhinnebiopsier.

Rekruttering Tre grupper barn skal delta i denne studien. A. Barn som gjennomgår endoskopiske undersøkelser (koloskopi) for kolonbetennelse inkludert Crohns sykdom [barn som ikke har Crohns sykdom vil ikke delta i oppfølgingsaspektet (under behandling med EEN) av denne studien].

B. Tidligere diagnostiserte pasienter med Crohns sykdom på grunn av å starte et 8 ukers standard behandlingsforløp med EEN på grunn av sykdomsoppblussing.

C. Friske barn uten slekt med Crohns sykdomspasienter vil bli brukt som kontrollgruppe.

Gruppe A og B: en innledende blod-, urin-, avføringsprøve etterfulgt av 5 ytterligere avførings- og urinprøver over 12 måneder; og kostholdsinformasjon.

[Gruppe A vil også ha 8 slimhinnebiopsier tatt under rutinemessig endoskopi]. Under behandling med EEN (klinisk avgjørelse) vil det bli bedt om en ekstra blodprøve under rutinemessig blodprøvetaking ved start og slutt på behandlingen.

Gruppe C: 1 urin- og avføringsprøve vil bli forespurt.

Alle gruppene vil ha høyde, vekt og grepsstyrke målt ved baseline. Deltaker som mottar EEN vil få dette gjentatt 60 dager etter behandlingsstart og 60 dager etter avsluttet behandling.

Detaljerte metoder Foreløpig helsesjekk ved hjelp av et kort helsespørreskjema - grunnleggende helseinformasjon, alder, eventuell medisinering.

Slimhinneprøver: hos nydiagnostiserte pasienter som har en koloskopi for diagnostiske formål, ytterligere 6 slimhinnebiopsiprøver; 2 fra terminal ileum når det er mulig, 2 fra proksimal colon og 2 fra distale colon vil bli tatt (14-16 samles ved normal koloskopi). Ytterligere 2 biopsiprøver vil også bli tatt fra duodenum under øvre endoskopi.

Kostholdsinformasjon: vanlig diettinntak og spisemønster vurdert ved bruk av validert Food Frequency Questionnaire (FFQ); et 5-trinns multiple pass 24-timers diettgjenkallingsspørreskjema for data om faktisk kosthold på tidspunktet for avførings- og urinprøvetaking.

EEN-samsvar (kun gruppe A&B): utfylling av kort EEN-samsvarsspørreskjema på 28 dager og 56 dager.

Medisinering og sykdomshistorie: informasjon om sykdomsaktivitet, medisinering og sykehistorie samlet fra medisinske notater.

Laboratorieanalyser Bakteriell mangfold: Tarmbakteriemangfoldet og sammensetningen fra avføringsprøver vil bli målt ved hjelp av molekylære teknikker som kvantitativ polymerasekjedereaksjon (PCR) fra bakteriell ribosomalt DNA og neste generasjons sekvensering (metagenomikk). Disse teknikkene vil også bli brukt til å se på sammensetningen av bakterier assosiert med slimhinnevevsbiopsier. Endringer i den totale sammensetningen av tarmbakterier ved bruk av standard numeriske indekser vil bli målt på tvers av de 6 fekale prøvene samlet over 12 måneders perioden, så vel som mellom grupper.

Bakteriemetabolisme: Et stort antall ulike produkter fra bakteriell metabolisme, som kortkjedede fettsyrer, sulfid og ammoniakk vil bli målt ved hjelp av en rekke teknikker, inkludert gasskromatografi og gasskromatografi massespektrometri (GCMS) (metabolomikk). Fekal pH, en markør for bakteriell gjæring, vil også bli målt.

Sykdomsmarkører: Andre sykdomsmarkører og metabolitter som fecal calprotectin, vil bli målt fra avføringsprøver.