Užitečnost plazmové cirkulující nádorové DNA (ctDNA) u asymptomatických subjektů pro detekci neoplastického onemocnění (H1000)
4. dubna 2018 aktualizováno: Pathway Genomics
Pathway Genomics Corporation (Pathway Genomics), společnost ze San Diega v Kalifornii, se podílí na vývoji a ověřování nových molekulárně diagnostických testů pro analýzu cirkulující nádorové deoxyribonukleové kyseliny (DNA) (ctDNA) nalezené v DNA pocházející z plazmy (buňka -volná DNA nebo cfDNA) za účelem identifikace specifických variant (mutací) v genech ovlivňujících rakovinu.
Účelem testování mutací v ctDNA je detekovat a monitorovat rakovinu.
Všechny buňky vylučují DNA do krevního řečiště.
Nalezení mutací souvisejících s rakovinou v cfDNA může vést k časné detekci rakoviny u jinak zdánlivě zdravého (tj.
asymptomatické) individuální nebo mohou poskytovateli zdravotní péče umožnit efektivněji monitorovat a léčit známého pacienta s rakovinou.
Analýza se provádí pomocí metodologie založené na polymerázové řetězové reakci (PCR), kde jsou oligonukleotidy navrženy tak, aby cílily na specifické mutace v určených genech, o které je zájem, následované hloubkovým sekvenováním další generace amplifikovaných cílů.
Vyhodnocení účinnosti těchto testů pro screening rakoviny u asymptomatických subjektů je zásadní pro klinické ověření použití těchto testů.
Specifickým cílem tohoto protokolu je získat relevantní vzorky lidské krve od jednotlivých subjektů s vyšším než průměrným rizikem rozvoje rakoviny v důsledku věku, dědičnosti nebo environmentální nebo toxické expozice pro použití při statistické analýze této metody jako doplňkový screening test na možnou přítomnost rakoviny.
Přehled studie
Postavení
Dokončeno
Intervence / Léčba
Detailní popis
Cílem této studie je získat vzorky lidské krve od asymptomatických jedinců, kteří nikdy nebyli diagnostikováni s rakovinou, ale kteří mohou mít zvýšené riziko rakoviny kvůli dědičnosti, expozici, věku nebo rodinné anamnéze, aby bylo možné posoudit platnost screeningu zdravých, ale u pacientů s rizikem rakoviny prostřednictvím analýzy ctDNA.
Konkrétně budou vzorky krve odebírány jednotlivcům, kteří odpověděli na dotazník o zdravotním stavu, který si sami zadali, a který prověřuje vyšší riziko onemocnění rakovinou. Každý účastník bude požádán, aby poskytl vzorek krve o objemu 30 ml, který bude odebrán poskytovatelem primární péče (PCP) nebo licencovaným flebotomem. Vzorky odebrané během studie mohou být také použity při výzkumu a vývoji nových nebo modifikovaných molekulárně genetických testů. Výsledky těchto studií budou použity k dalšímu pochopení využití ctDNA pro detekci a monitorování rakoviny u lidí.
Vzorky krve se odebírají do zkumavek pro odběr krve (BCT) nazývaných Cell-Free DNA BCT® vyrobených společností Streck a určených pro odběr, stabilizaci a transport bezbuněčné plazmatické DNA. Toto zařízení také stabilizuje a uchovává buněčnou genomickou DNA přítomnou v krvinkách s jádry a cirkulujících epiteliálních buňkách (nádorových buňkách) nacházející se v plné krvi. Tento produkt nebyl schválen Úřadem pro potraviny a léčiva USA pro diagnostické použití in vitro a je společností Streck označen pouze pro účely výzkumu. Podle předpisů Clinical Laboratory Improvement Accessories (CLIA) jsou laboratoře oprávněny ověřovat a používat v rámci laboratorně vyvinutého testu (LDT) zařízení, která nebyla schválena nebo schválena FDA. Společnost Pathway Genomics ověřila systém molekulární analýzy CancerInterceptTM Detect se zkumavkami Streck v souladu s CLIA.
Jakmile je vzorek odebrán a odeslán do Pathway lékařem nebo flebotomem, který vzorky odebírá, veškeré další zpracování a testování provádějí pracovníci laboratoře Pathway. Analýza začíná oddělením plazmy od zbytku vzorku krve. cfDNA pak bude izolována z každého vzorku. Změří se množství cfDNA a poté se vzorek amplifikuje pomocí PCR pro sekvenování další generace. Výsledky sekvenování pak budou analyzovány na přítomnost jedné nebo více z 96 mutací analyzovaných v tomto testu. Data jsou poté zkontrolována a bude vygenerována zpráva.
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Aktuální)
1106
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní místa
-
-
California
-
San Diego, California, Spojené státy, 92121
- Pathway Genomics
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
18 let a starší (DOSPĚLÝ, OLDER_ADULT)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ano
Pohlaví způsobilá ke studiu
Všechno
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Jedinci, kteří jsou vystaveni zvýšenému riziku rozvoje rakoviny z důvodu věku nad 50 let, silné rodinné anamnézy rakoviny, známého nositele patogenní varianty v genu indikující zvýšené riziko rakoviny, například dědičný rakovinový syndrom, nebo v důsledku vystavení environmentálním toxinům, karcinogenům nebo mutagenům, včetně tabáku.
Jednotlivci musí mít zákonnou pravomoc poskytnout souhlas, a proto musí být starší 18 let.
Popis
Kritéria pro zařazení:
- silná rodinná anamnéza rakoviny
- známý nosič patogenní varianty v genu indikujícím zvýšené riziko rakoviny, například v genech BRCA1 nebo TP53.
- vystavení environmentálním toxinům, karcinogenům nebo mutagenům, včetně, ale bez omezení, tabáku, záření, azbestu, dlouhodobé průmyslové chemické expozice
- věk rovný nebo vyšší než 50 let
Kritéria vyloučení:
- předchozí diagnóza rakoviny kromě bazaliomu
- žádné rizikové faktory, které jedince vystavují vysokému riziku
- věk do 18 let
- jednotlivci, kteří nejsou ochotni podepsat formulář souhlasu schválený IRB
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Zvýšené riziko rozvoje rakoviny
Skupina má zahrnovat minimálně 1000 jedinců, kteří jsou ve vysokém riziku rozvoje rakoviny.
Riziko se posuzuje prostřednictvím vyplnění dotazníku klinické anamnézy.
Příklady takových subjektů zahrnují osoby se známými patogenními variantami dědičného rakovinového syndromu bez diagnózy rakoviny, s významnou rodinnou anamnézou rakoviny prsu, vaječníků, tlustého střeva nebo plic nebo melanomu nebo jinou silnou anamnézou rakoviny, ale bez předchozí molekulární diagnózy, silní kuřáci nebo osoby vystavené karcinogenům a mutagenům.
Jedinci, kteří splňují kritéria pro zařazení, podstoupí bezbuněčnou izolaci DNA a analýzu DNA cirkulujícího nádoru (ctDNA) pro detekci genetických mutací spojených s možným rozvojem zhoubného nádoru.
|
Bezbuněčná DNA (cfDNA) se izoluje ze vzorku krevní plazmy a testuje se na přítomnost 96 specifických dobře popsaných mutací v 9 genech ovlivňujících rakovinu.
Přítomnost více než 2 kopií mutace může indikovat přítomnost zhoubného nádoru.
Pro vyšetření a jakékoli další testování, které chce lékař provést, aby dále zhodnotil vývoj rakoviny, by bylo zapotřebí následná konzultace s lékařem subjektu.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Počet subjektů nalezených s jednou nebo více z 96 mutací ctDNA
Časové okno: 1 rok
|
Kohorta 1000 nebo více jedinců, kteří jsou ve vysokém riziku rozvoje rakoviny, bude testována na přítomnost 96 dobře popsaných mutací v 9 genech řidičů rakoviny pomocí analýzy ctDNA.
Bude hodnocen počet jedinců s jednou nebo více z 96 testovaných mutací.
|
1 rok
|
|
Počet kopií mutantních alel nalezených u pozitivních subjektů
Časové okno: 1 rok
|
Mezi kohortou subjektů zařazených do studie, u kterých byla detekována jedna nebo více z 96 ctDNA mutací, bude vypočítán počet kopií na analyzovaný vzorek plazmy.
|
1 rok
|
|
Procento ctDNA nalezené v celkovém množství cirkulující volné DNA (cfDNA)
Časové okno: 1 rok
|
U vzorků, u kterých bylo zjištěno, že obsahují jednu nebo více mutací ctDNA, bude vypočteno procento ctDNA v rámci celkového množství cfDNA.
|
1 rok
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Počet subjektů s jednou nebo více z 96 mutací ctDNA, u kterých se rozvine rakovina
Časové okno: 1 až 5 let
|
1000 nebo více jedinců ve studii bude sledováno po dobu 1 až 5 let, aby bylo možné posoudit vývoj zhoubného nádoru.
Zvláštní pozornost bude věnována kohortě, která má počáteční testy indikující přítomnost ctDNA.
Subjekty mohou být v průběhu času znovu testovány, aby se projevily měnící se hladiny ctDNA.
Jejich vlastní lékaři vedou jakékoli následné studie, jako je zobrazování nebo jiné laboratorní testování.
Test je navržen jako prostředek pro zjištění případů rakoviny u jedinců s vysokým rizikem rozvoje rakoviny.
|
1 až 5 let
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Glenn Braunstein, MD, Pathway Genomics
- Ředitel studie: Anja Kammesheidt, PhD, Pathway Genomics
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ, Kinde I, Wang Y, Agrawal N, Bartlett BR, Wang H, Luber B, Alani RM, Antonarakis ES, Azad NS, Bardelli A, Brem H, Cameron JL, Lee CC, Fecher LA, Gallia GL, Gibbs P, Le D, Giuntoli RL, Goggins M, Hogarty MD, Holdhoff M, Hong SM, Jiao Y, Juhl HH, Kim JJ, Siravegna G, Laheru DA, Lauricella C, Lim M, Lipson EJ, Marie SK, Netto GJ, Oliner KS, Olivi A, Olsson L, Riggins GJ, Sartore-Bianchi A, Schmidt K, Shih lM, Oba-Shinjo SM, Siena S, Theodorescu D, Tie J, Harkins TT, Veronese S, Wang TL, Weingart JD, Wolfgang CL, Wood LD, Xing D, Hruban RH, Wu J, Allen PJ, Schmidt CM, Choti MA, Velculescu VE, Kinzler KW, Vogelstein B, Papadopoulos N, Diaz LA Jr. Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies. Sci Transl Med. 2014 Feb 19;6(224):224ra24. doi: 10.1126/scitranslmed.3007094.
- Freidin MB, Freydina DV, Leung M, Montero Fernandez A, Nicholson AG, Lim E. Circulating tumor DNA outperforms circulating tumor cells for KRAS mutation detection in thoracic malignancies. Clin Chem. 2015 Oct;61(10):1299-304. doi: 10.1373/clinchem.2015.242453. Epub 2015 Aug 13.
- Newman AM, Bratman SV, To J, Wynne JF, Eclov NC, Modlin LA, Liu CL, Neal JW, Wakelee HA, Merritt RE, Shrager JB, Loo BW Jr, Alizadeh AA, Diehn M. An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage. Nat Med. 2014 May;20(5):548-54. doi: 10.1038/nm.3519. Epub 2014 Apr 6.
- Kidess E, Heirich K, Wiggin M, Vysotskaia V, Visser BC, Marziali A, Wiedenmann B, Norton JA, Lee M, Jeffrey SS, Poultsides GA. Mutation profiling of tumor DNA from plasma and tumor tissue of colorectal cancer patients with a novel, high-sensitivity multiplexed mutation detection platform. Oncotarget. 2015 Feb 10;6(4):2549-61. doi: 10.18632/oncotarget.3041.
- Perrone F, Lampis A, Bertan C, Verderio P, Ciniselli CM, Pizzamiglio S, Frattini M, Nucifora M, Molinari F, Gallino G, Gariboldi M, Meroni E, Leo E, Pierotti MA, Pilotti S. Circulating free DNA in a screening program for early colorectal cancer detection. Tumori. 2014 Mar-Apr;100(2):115-21. doi: 10.1177/030089161410000201.
- Lin PC, Lin JK, Lin CH, Lin HH, Yang SH, Jiang JK, Chen WS, Chou CC, Tsai SF, Chang SC. Clinical Relevance of Plasma DNA Methylation in Colorectal Cancer Patients Identified by Using a Genome-Wide High-Resolution Array. Ann Surg Oncol. 2015 Dec;22 Suppl 3:S1419-27. doi: 10.1245/s10434-014-4277-2. Epub 2014 Dec 4.
- Spindler KL, Appelt AL, Pallisgaard N, Andersen RF, Brandslund I, Jakobsen A. Cell-free DNA in healthy individuals, noncancerous disease and strong prognostic value in colorectal cancer. Int J Cancer. 2014 Dec 15;135(12):2984-91. doi: 10.1002/ijc.28946. Epub 2014 Jun 17.
- Beaver JA, Jelovac D, Balukrishna S, Cochran R, Croessmann S, Zabransky DJ, Wong HY, Toro PV, Cidado J, Blair BG, Chu D, Burns T, Higgins MJ, Stearns V, Jacobs L, Habibi M, Lange J, Hurley PJ, Lauring J, VanDenBerg D, Kessler J, Jeter S, Samuels ML, Maar D, Cope L, Cimino-Mathews A, Argani P, Wolff AC, Park BH. Detection of cancer DNA in plasma of patients with early-stage breast cancer. Clin Cancer Res. 2014 May 15;20(10):2643-2650. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-13-2933. Epub 2014 Feb 6.
- Oshiro C, Kagara N, Naoi Y, Shimoda M, Shimomura A, Maruyama N, Shimazu K, Kim SJ, Noguchi S. PIK3CA mutations in serum DNA are predictive of recurrence in primary breast cancer patients. Breast Cancer Res Treat. 2015 Apr;150(2):299-307. doi: 10.1007/s10549-015-3322-6. Epub 2015 Mar 4.
- Bianchi DW, Chudova D, Sehnert AJ, Bhatt S, Murray K, Prosen TL, Garber JE, Wilkins-Haug L, Vora NL, Warsof S, Goldberg J, Ziainia T, Halks-Miller M. Noninvasive Prenatal Testing and Incidental Detection of Occult Maternal Malignancies. JAMA. 2015 Jul 14;314(2):162-9. doi: 10.1001/jama.2015.7120.
- Kinugasa H, Nouso K, Miyahara K, Morimoto Y, Dohi C, Tsutsumi K, Kato H, Matsubara T, Okada H, Yamamoto K. Detection of K-ras gene mutation by liquid biopsy in patients with pancreatic cancer. Cancer. 2015 Jul 1;121(13):2271-80. doi: 10.1002/cncr.29364. Epub 2015 Mar 30.
- Sanmamed MF, Fernandez-Landazuri S, Rodriguez C, Zarate R, Lozano MD, Zubiri L, Perez-Gracia JL, Martin-Algarra S, Gonzalez A. Quantitative cell-free circulating BRAFV600E mutation analysis by use of droplet digital PCR in the follow-up of patients with melanoma being treated with BRAF inhibitors. Clin Chem. 2015 Jan;61(1):297-304. doi: 10.1373/clinchem.2014.230235. Epub 2014 Nov 19.
- Hosny G, Farahat N, Tayel H, Hainaut P. Ser-249 TP53 and CTNNB1 mutations in circulating free DNA of Egyptian patients with hepatocellular carcinoma versus chronic liver diseases. Cancer Lett. 2008 Jun 18;264(2):201-8. doi: 10.1016/j.canlet.2008.01.031. Epub 2008 Mar 3.
- Izumchenko E, Chang X, Brait M, Fertig E, Kagohara LT, Bedi A, Marchionni L, Agrawal N, Ravi R, Jones S, Hoque MO, Westra WH, Sidransky D. Targeted sequencing reveals clonal genetic changes in the progression of early lung neoplasms and paired circulating DNA. Nat Commun. 2015 Sep 16;6:8258. doi: 10.1038/ncomms9258.
- Hamakawa T, Kukita Y, Kurokawa Y, Miyazaki Y, Takahashi T, Yamasaki M, Miyata H, Nakajima K, Taniguchi K, Takiguchi S, Mori M, Doki Y, Kato K. Monitoring gastric cancer progression with circulating tumour DNA. Br J Cancer. 2015 Jan 20;112(2):352-6. doi: 10.1038/bjc.2014.609. Epub 2014 Dec 9.
- Wang Y, Springer S, Mulvey CL, Silliman N, Schaefer J, Sausen M, James N, Rettig EM, Guo T, Pickering CR, Bishop JA, Chung CH, Califano JA, Eisele DW, Fakhry C, Gourin CG, Ha PK, Kang H, Kiess A, Koch WM, Myers JN, Quon H, Richmon JD, Sidransky D, Tufano RP, Westra WH, Bettegowda C, Diaz LA Jr, Papadopoulos N, Kinzler KW, Vogelstein B, Agrawal N. Detection of somatic mutations and HPV in the saliva and plasma of patients with head and neck squamous cell carcinomas. Sci Transl Med. 2015 Jun 24;7(293):293ra104. doi: 10.1126/scitranslmed.aaa8507.
- Reinert T, Scholer LV, Thomsen R, Tobiasen H, Vang S, Nordentoft I, Lamy P, Kannerup AS, Mortensen FV, Stribolt K, Hamilton-Dutoit S, Nielsen HJ, Laurberg S, Pallisgaard N, Pedersen JS, Orntoft TF, Andersen CL. Analysis of circulating tumour DNA to monitor disease burden following colorectal cancer surgery. Gut. 2016 Apr;65(4):625-34. doi: 10.1136/gutjnl-2014-308859. Epub 2015 Feb 4.
Užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia
1. listopadu 2015
Primární dokončení (AKTUÁLNÍ)
1. srpna 2017
Dokončení studie (AKTUÁLNÍ)
1. srpna 2017
Termíny zápisu do studia
První předloženo
13. listopadu 2015
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
19. listopadu 2015
První zveřejněno (ODHAD)
23. listopadu 2015
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (AKTUÁLNÍ)
6. dubna 2018
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
4. dubna 2018
Naposledy ověřeno
1. dubna 2018
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- Pathway Gennomics 004
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
NE
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .