血浆循环肿瘤 DNA (ctDNA) 在无症状受试者中检测肿瘤疾病的效用 (H1000)
研究概览
详细说明
本研究的目的是从从未被诊断出患有癌症但可能因遗传、暴露、年龄或家族史而可能增加癌症风险的无症状受试者获取人类血液样本,以评估筛查健康但不健康的有效性。通过 ctDNA 分析的癌症风险患者。
具体来说,血液样本将从对自我管理的健康调查问卷做出回应的个人那里收集,该调查问卷用于筛查患癌症的高风险。 每个参与者将被要求提供 30 毫升的血样,由初级保健提供者 (PCP) 或有执照的抽血师抽取。 研究期间收集的标本也可用于研究和开发新的或改进的分子遗传学分析。 这些研究的结果将用于进一步了解使用 ctDNA 检测和监测人类癌症。
血液样本收集在由 Streck 制造的名为 Cell-Free DNA BCT® 的血液收集管 (BCT) 中,用于收集、稳定和运输无细胞血浆 DNA。 该装置还可以稳定和保存全血中有核血细胞和循环上皮细胞(肿瘤细胞)中存在的细胞基因组 DNA。 该产品尚未获得美国食品和药物管理局的体外诊断批准,Streck 仅将其标记为仅供研究使用。 根据临床实验室改进修正案 (CLIA) 法规,实验室有权验证和使用未经 FDA 批准或批准的设备,作为实验室开发测试 (LDT) 的一部分。 根据 CLIA,Pathway Genomics 使用 Streck 管验证了 CancerInterceptTM Detect 分子分析系统。
一旦样本被医生或采集样本的抽血师收集并发送至 Pathway,所有其他处理和测试均由 Pathway 实验室人员进行。 分析从血浆与血液样本的其余部分分离开始。 然后将从每个样本中分离出 cfDNA。 测量 cfDNA 的数量,然后通过 PCR 扩增样品以进行下一代测序。 然后将分析测序结果,以确定是否存在该测定中分析的 96 种突变中的一种或多种。 然后审查数据并生成报告。
研究类型
注册 (实际的)
联系人和位置
学习地点
-
-
California
-
San Diego、California、美国、92121
- Pathway Genomics
-
-
参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 强烈的癌症家族史
- 已知基因致病性变异的携带者表明患癌症的风险增加,例如 BRCA1 或 TP53 基因。
- 接触环境毒素、致癌物或诱变剂,包括但不限于烟草、辐射、石棉、长期接触工业化学品
- 年龄等于或超过 50 岁
排除标准:
- 除基底细胞癌外的其他癌症的先前诊断
- 没有使个人处于高风险的风险因素
- 18岁以下
- 不愿签署 IRB 批准的同意书的个人
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
---|---|
增加患癌症的风险
该小组将包括至少 1000 名患癌症的高危人群。
通过完成临床病史问卷评估风险。
此类受试者的例子包括那些具有已知的遗传性癌症综合征致病性变异但未被诊断为癌症,具有显着的乳腺癌、卵巢癌、结肠癌或肺癌或黑色素瘤家族史,或其他明显的癌症病史但之前没有分子诊断的人,重度吸烟者或接触致癌物和诱变剂的人。
符合纳入标准的个体将接受无细胞 DNA 分离和循环肿瘤 DNA (ctDNA) 分析,以检测与可能发生恶性肿瘤相关的基因突变。
|
从血浆样本中分离出游离 DNA (cfDNA),并测试 9 种癌症驱动基因中是否存在 96 种明确描述的特定突变。
存在超过 2 个突变拷贝可能表明存在恶性肿瘤。
需要跟进受试者的医生进行检查和医生想要执行的任何额外测试以进一步评估癌症的发展。
|
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
---|---|---|
发现具有 96 个 ctDNA 突变中的一个或多个的受试者数量
大体时间:1年
|
将通过 ctDNA 分析对 1000 名或更多处于癌症发展高风险的个体进行测试,以确定 9 个癌症驱动基因中是否存在 96 个明确描述的突变。
将评估具有 96 种测定突变中的一种或多种的个体数量。
|
1年
|
在阳性受试者中发现的突变等位基因的拷贝数
大体时间:1年
|
在检测到 96 个 ctDNA 突变中的一个或多个突变的参与研究的受试者队列中,将计算每个分析血浆样本的拷贝数。
|
1年
|
在循环游离 DNA (cfDNA) 总量中发现的 ctDNA 百分比
大体时间:1年
|
在发现含有一个或多个ctDNA突变的样本中,将计算ctDNA占cfDNA总量的百分比。
|
1年
|
次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
---|---|---|
发生癌症的 96 种 ctDNA 突变中的一种或多种的受试者人数
大体时间:1至5年
|
研究中的 1000 人或更多人将被跟踪 1 至 5 年,以评估恶性肿瘤的发展。
将特别注意具有初步检测表明存在 ctDNA 的队列。
随着时间的推移,可以对受试者进行重新测试,以显示 ctDNA 水平的变化。
他们自己的医生将指导任何后续研究,例如成像或其他实验室测试。
该测试被设计为在具有高癌症发展风险的个体中发现癌症病例的一种手段。
|
1至5年
|
合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:Glenn Braunstein, MD、Pathway Genomics
- 研究主任:Anja Kammesheidt, PhD、Pathway Genomics
出版物和有用的链接
一般刊物
- Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ, Kinde I, Wang Y, Agrawal N, Bartlett BR, Wang H, Luber B, Alani RM, Antonarakis ES, Azad NS, Bardelli A, Brem H, Cameron JL, Lee CC, Fecher LA, Gallia GL, Gibbs P, Le D, Giuntoli RL, Goggins M, Hogarty MD, Holdhoff M, Hong SM, Jiao Y, Juhl HH, Kim JJ, Siravegna G, Laheru DA, Lauricella C, Lim M, Lipson EJ, Marie SK, Netto GJ, Oliner KS, Olivi A, Olsson L, Riggins GJ, Sartore-Bianchi A, Schmidt K, Shih lM, Oba-Shinjo SM, Siena S, Theodorescu D, Tie J, Harkins TT, Veronese S, Wang TL, Weingart JD, Wolfgang CL, Wood LD, Xing D, Hruban RH, Wu J, Allen PJ, Schmidt CM, Choti MA, Velculescu VE, Kinzler KW, Vogelstein B, Papadopoulos N, Diaz LA Jr. Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies. Sci Transl Med. 2014 Feb 19;6(224):224ra24. doi: 10.1126/scitranslmed.3007094.
- Freidin MB, Freydina DV, Leung M, Montero Fernandez A, Nicholson AG, Lim E. Circulating tumor DNA outperforms circulating tumor cells for KRAS mutation detection in thoracic malignancies. Clin Chem. 2015 Oct;61(10):1299-304. doi: 10.1373/clinchem.2015.242453. Epub 2015 Aug 13.
- Newman AM, Bratman SV, To J, Wynne JF, Eclov NC, Modlin LA, Liu CL, Neal JW, Wakelee HA, Merritt RE, Shrager JB, Loo BW Jr, Alizadeh AA, Diehn M. An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage. Nat Med. 2014 May;20(5):548-54. doi: 10.1038/nm.3519. Epub 2014 Apr 6.
- Kidess E, Heirich K, Wiggin M, Vysotskaia V, Visser BC, Marziali A, Wiedenmann B, Norton JA, Lee M, Jeffrey SS, Poultsides GA. Mutation profiling of tumor DNA from plasma and tumor tissue of colorectal cancer patients with a novel, high-sensitivity multiplexed mutation detection platform. Oncotarget. 2015 Feb 10;6(4):2549-61. doi: 10.18632/oncotarget.3041.
- Perrone F, Lampis A, Bertan C, Verderio P, Ciniselli CM, Pizzamiglio S, Frattini M, Nucifora M, Molinari F, Gallino G, Gariboldi M, Meroni E, Leo E, Pierotti MA, Pilotti S. Circulating free DNA in a screening program for early colorectal cancer detection. Tumori. 2014 Mar-Apr;100(2):115-21. doi: 10.1177/030089161410000201.
- Lin PC, Lin JK, Lin CH, Lin HH, Yang SH, Jiang JK, Chen WS, Chou CC, Tsai SF, Chang SC. Clinical Relevance of Plasma DNA Methylation in Colorectal Cancer Patients Identified by Using a Genome-Wide High-Resolution Array. Ann Surg Oncol. 2015 Dec;22 Suppl 3:S1419-27. doi: 10.1245/s10434-014-4277-2. Epub 2014 Dec 4.
- Spindler KL, Appelt AL, Pallisgaard N, Andersen RF, Brandslund I, Jakobsen A. Cell-free DNA in healthy individuals, noncancerous disease and strong prognostic value in colorectal cancer. Int J Cancer. 2014 Dec 15;135(12):2984-91. doi: 10.1002/ijc.28946. Epub 2014 Jun 17.
- Beaver JA, Jelovac D, Balukrishna S, Cochran R, Croessmann S, Zabransky DJ, Wong HY, Toro PV, Cidado J, Blair BG, Chu D, Burns T, Higgins MJ, Stearns V, Jacobs L, Habibi M, Lange J, Hurley PJ, Lauring J, VanDenBerg D, Kessler J, Jeter S, Samuels ML, Maar D, Cope L, Cimino-Mathews A, Argani P, Wolff AC, Park BH. Detection of cancer DNA in plasma of patients with early-stage breast cancer. Clin Cancer Res. 2014 May 15;20(10):2643-2650. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-13-2933. Epub 2014 Feb 6.
- Oshiro C, Kagara N, Naoi Y, Shimoda M, Shimomura A, Maruyama N, Shimazu K, Kim SJ, Noguchi S. PIK3CA mutations in serum DNA are predictive of recurrence in primary breast cancer patients. Breast Cancer Res Treat. 2015 Apr;150(2):299-307. doi: 10.1007/s10549-015-3322-6. Epub 2015 Mar 4.
- Bianchi DW, Chudova D, Sehnert AJ, Bhatt S, Murray K, Prosen TL, Garber JE, Wilkins-Haug L, Vora NL, Warsof S, Goldberg J, Ziainia T, Halks-Miller M. Noninvasive Prenatal Testing and Incidental Detection of Occult Maternal Malignancies. JAMA. 2015 Jul 14;314(2):162-9. doi: 10.1001/jama.2015.7120.
- Kinugasa H, Nouso K, Miyahara K, Morimoto Y, Dohi C, Tsutsumi K, Kato H, Matsubara T, Okada H, Yamamoto K. Detection of K-ras gene mutation by liquid biopsy in patients with pancreatic cancer. Cancer. 2015 Jul 1;121(13):2271-80. doi: 10.1002/cncr.29364. Epub 2015 Mar 30.
- Sanmamed MF, Fernandez-Landazuri S, Rodriguez C, Zarate R, Lozano MD, Zubiri L, Perez-Gracia JL, Martin-Algarra S, Gonzalez A. Quantitative cell-free circulating BRAFV600E mutation analysis by use of droplet digital PCR in the follow-up of patients with melanoma being treated with BRAF inhibitors. Clin Chem. 2015 Jan;61(1):297-304. doi: 10.1373/clinchem.2014.230235. Epub 2014 Nov 19.
- Hosny G, Farahat N, Tayel H, Hainaut P. Ser-249 TP53 and CTNNB1 mutations in circulating free DNA of Egyptian patients with hepatocellular carcinoma versus chronic liver diseases. Cancer Lett. 2008 Jun 18;264(2):201-8. doi: 10.1016/j.canlet.2008.01.031. Epub 2008 Mar 3.
- Izumchenko E, Chang X, Brait M, Fertig E, Kagohara LT, Bedi A, Marchionni L, Agrawal N, Ravi R, Jones S, Hoque MO, Westra WH, Sidransky D. Targeted sequencing reveals clonal genetic changes in the progression of early lung neoplasms and paired circulating DNA. Nat Commun. 2015 Sep 16;6:8258. doi: 10.1038/ncomms9258.
- Hamakawa T, Kukita Y, Kurokawa Y, Miyazaki Y, Takahashi T, Yamasaki M, Miyata H, Nakajima K, Taniguchi K, Takiguchi S, Mori M, Doki Y, Kato K. Monitoring gastric cancer progression with circulating tumour DNA. Br J Cancer. 2015 Jan 20;112(2):352-6. doi: 10.1038/bjc.2014.609. Epub 2014 Dec 9.
- Wang Y, Springer S, Mulvey CL, Silliman N, Schaefer J, Sausen M, James N, Rettig EM, Guo T, Pickering CR, Bishop JA, Chung CH, Califano JA, Eisele DW, Fakhry C, Gourin CG, Ha PK, Kang H, Kiess A, Koch WM, Myers JN, Quon H, Richmon JD, Sidransky D, Tufano RP, Westra WH, Bettegowda C, Diaz LA Jr, Papadopoulos N, Kinzler KW, Vogelstein B, Agrawal N. Detection of somatic mutations and HPV in the saliva and plasma of patients with head and neck squamous cell carcinomas. Sci Transl Med. 2015 Jun 24;7(293):293ra104. doi: 10.1126/scitranslmed.aaa8507.
- Reinert T, Scholer LV, Thomsen R, Tobiasen H, Vang S, Nordentoft I, Lamy P, Kannerup AS, Mortensen FV, Stribolt K, Hamilton-Dutoit S, Nielsen HJ, Laurberg S, Pallisgaard N, Pedersen JS, Orntoft TF, Andersen CL. Analysis of circulating tumour DNA to monitor disease burden following colorectal cancer surgery. Gut. 2016 Apr;65(4):625-34. doi: 10.1136/gutjnl-2014-308859. Epub 2015 Feb 4.
有用的网址
研究记录日期
研究主要日期
学习开始
初级完成 (实际的)
研究完成 (实际的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索,没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求,请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改,我们的网站上也会自动更新.