Nut van plasma-circulerend tumor-DNA (ctDNA) bij asymptomatische proefpersonen voor de detectie van neoplastische ziekten (H1000)
4 april 2018 bijgewerkt door: Pathway Genomics
Pathway Genomics Corporation (Pathway Genomics), een bedrijf uit San Diego, Californië, is betrokken bij de ontwikkeling en validatie van nieuwe moleculaire diagnostische assays voor de analyse van circulerend tumor-desoxyribonucleïnezuur (DNA) (ctDNA) dat wordt aangetroffen in het plasma-afgeleide DNA (cel -vrij DNA of cfDNA) om specifieke varianten (mutaties) in kankeraandrijvende genen te identificeren.
Het doel van het testen op mutaties in ctDNA is het opsporen en monitoren van kanker.
Alle cellen werpen DNA af in de bloedbaan.
Het vinden van kanker-geassocieerde mutaties in het cfDNA kan leiden tot vroege detectie van kanker in een verder ogenschijnlijk gezonde (d.w.z.
asymptomatisch) individu of kan de zorgverlener in staat stellen om een bekende kankerpatiënt effectiever te controleren en te behandelen.
De analyse wordt uitgevoerd met behulp van een op polymerasekettingreactie (PCR) gebaseerde methodologie waarbij oligonucleotiden worden ontworpen om zich te richten op specifieke mutaties in aangewezen genen van belang, gevolgd door de volgende generatie diepe sequentiebepaling van de geamplificeerde doelen.
Evaluatie van de prestaties van deze assays voor screening op kanker bij asymptomatische proefpersonen is essentieel voor de klinische validatie van het gebruik van deze assays.
Het specifieke doel van dit protocol is het verkrijgen van relevante menselijke bloedmonsters van individuele proefpersonen met een hoger dan gemiddeld risico op de ontwikkeling van kanker als gevolg van leeftijd, erfelijkheid of omgevings- of toxische blootstelling voor gebruik in de statistische analyse van deze methode als aanvullende screening. testen op de mogelijke aanwezigheid van kanker.
Studie Overzicht
Toestand
Voltooid
Conditie
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
De doelstellingen van deze studie zijn het verkrijgen van menselijke bloedmonsters van asymptomatische proefpersonen bij wie nog nooit kanker is vastgesteld, maar die mogelijk een verhoogd risico lopen op kanker als gevolg van erfelijkheid, blootstelling, leeftijd of familiegeschiedenis om de validiteit te beoordelen van het screenen van gezonde maar risicopatiënten voor kanker via analyse van ctDNA.
In het bijzonder zullen de bloedmonsters worden verzameld van personen die hebben gereageerd op een zelf-toegediende gezondheidsvragenlijst die screent op een hoger risico op kanker. Elke deelnemer wordt gevraagd om een bloedmonster van 30 ml te verstrekken dat moet worden afgenomen door een eerstelijnszorgverlener (PCP) of een gediplomeerde aderlating. De monsters die tijdens het onderzoek worden verzameld, kunnen ook worden gebruikt bij het onderzoek naar en de ontwikkeling van nieuwe of gewijzigde moleculaire genetica-assays. De resultaten van deze onderzoeken zullen worden gebruikt om meer inzicht te krijgen in het gebruik van ctDNA voor de detectie en monitoring van kanker bij mensen.
De bloedmonsters worden verzameld in bloedafnamebuizen (BCT), Cell-Free DNA BCT® genaamd, vervaardigd door Streck en bedoeld voor het verzamelen, stabiliseren en transporteren van celvrij plasma-DNA. Dit apparaat stabiliseert en bewaart ook cellulair genomisch DNA dat aanwezig is in kernhoudende bloedcellen en circulerende epitheelcellen (tumorcellen) die in volbloed worden aangetroffen. Dit product is niet goedgekeurd door de Amerikaanse Food and Drug Administration voor in-vitrodiagnostisch gebruik en is door Streck alleen gelabeld voor gebruik in onderzoek. Volgens de voorschriften van de Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA) zijn laboratoria bevoegd om apparaten te valideren en te gebruiken, als onderdeel van een door een laboratorium ontwikkelde test (LDT), die niet zijn goedgekeurd of goedgekeurd door de FDA. Pathway Genomics valideerde het CancerInterceptTM Detect moleculaire analysesysteem met de Streck-buisjes, in overeenstemming met CLIA.
Nadat het monster is verzameld en naar Pathway is gestuurd door de arts of de bloedonderzoeker die de monsters heeft verzameld, worden alle andere verwerkingen en testen uitgevoerd door Pathway-laboratoriumpersoneel. De analyse begint met de scheiding van het plasma van de rest van het bloedmonster. cfDNA wordt vervolgens uit elk monster geïsoleerd. De hoeveelheid cfDNA wordt gemeten en vervolgens wordt het monster geamplificeerd via PCR voor sequencing van de volgende generatie. De resultaten van de sequentiëring zullen vervolgens worden geanalyseerd op de aanwezigheid van een of meer van de 96 mutaties die in deze assay zijn geanalyseerd. De gegevens worden vervolgens beoordeeld en er wordt een rapport gegenereerd.
Studietype
Observationeel
Inschrijving (Werkelijk)
1106
Contacten en locaties
In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.
Studie Locaties
-
-
California
-
San Diego, California, Verenigde Staten, 92121
- Pathway Genomics
-
-
Deelname Criteria
Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
18 jaar en ouder (VOLWASSEN, OUDER_ADULT)
Accepteert gezonde vrijwilligers
Ja
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Allemaal
Bemonsteringsmethode
Niet-waarschijnlijkheidssteekproef
Studie Bevolking
Personen die een verhoogd risico lopen op het ontwikkelen van kanker vanwege hun leeftijd ouder dan 50 jaar, een sterke familiegeschiedenis van kanker, bekende drager van een pathogene variant in een gen dat wijst op een verhoogd risico op kanker, bijvoorbeeld een erfelijk kankersyndroom, of vanwege blootstelling aan milieutoxines, kankerverwekkende of mutagene stoffen, waaronder tabak.
De personen moeten de wettelijke bevoegdheid hebben om toestemming te geven en moeten daarom 18 jaar of ouder zijn.
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- sterke familiegeschiedenis van kanker
- bekende drager van een pathogene variant in een gen dat wijst op een verhoogd risico op kanker, bijvoorbeeld in de genen BRCA1 of TP53.
- blootstelling aan milieutoxines, kankerverwekkende of mutagene stoffen, inclusief maar niet beperkt tot tabak, straling, asbest, langdurige blootstelling aan industriële chemicaliën
- leeftijd gelijk aan of ouder dan 50 jaar
Uitsluitingscriteria:
- voorafgaande diagnose van kanker behalve basaalcelcarcinoom
- geen risicofactoren waardoor het individu een hoog risico loopt
- leeftijd onder de 18 jaar
- personen die het IRB-goedgekeurde toestemmingsformulier niet willen ondertekenen
Studie plan
Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Verhoogd risico op de ontwikkeling van kanker
De groep moet ten minste 1000 personen omvatten die een hoog risico lopen op het ontwikkelen van kanker.
Het risico wordt beoordeeld door het invullen van een vragenlijst over de klinische geschiedenis.
Voorbeelden van dergelijke personen zijn personen met bekend erfelijk kankersyndroom, pathogene varianten zonder diagnose van kanker, met een significante familiegeschiedenis van borst-, eierstok-, colon- of longkanker of melanoom, of een andere sterke geschiedenis van kanker maar zonder voorafgaande moleculaire diagnose, zware rokers of die zijn blootgesteld aan kankerverwekkende en mutagene agentia.
De personen die aan de criteria voor opname voldoen, ondergaan celvrije DNA-isolatie en circulerend tumor-DNA (ctDNA) voor de detectie van genetische mutaties die verband houden met de mogelijke ontwikkeling van een maligniteit.
|
Celvrij DNA (cfDNA) wordt geïsoleerd uit een bloedplasmamonster en getest op de aanwezigheid van 96 specifieke goed beschreven mutaties in 9 kankeraandrijvende genen.
De aanwezigheid van meer dan 2 kopieën van een mutatie kan wijzen op de aanwezigheid van een maligniteit.
Follow-up met de arts van de proefpersoon zou nodig zijn voor een onderzoek en eventuele aanvullende tests die de arts wil uitvoeren om de ontwikkeling van kanker verder te beoordelen.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Aantal proefpersonen gevonden met een of meer van 96 ctDNA-mutaties
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Een cohort van 1000 of meer personen met een hoog risico op het ontwikkelen van kanker zal worden getest op de aanwezigheid van 96 goed beschreven mutaties in 9 kankeraandrijvende genen via ctDNA-analyse.
Het aantal personen met een of meer van de 96 geteste mutaties zal worden bepaald.
|
1 jaar
|
|
Aantal kopieën van mutante allelen gevonden bij de positieve proefpersonen
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Onder het cohort van proefpersonen die deelnamen aan de studie bij wie een of meer van de 96 ctDNA-mutaties worden gedetecteerd, zal het aantal kopieën per geanalyseerd plasmamonster worden berekend.
|
1 jaar
|
|
Percentage ctDNA gevonden binnen de totale hoeveelheid circulerend vrij DNA (cfDNA)
Tijdsspanne: 1 jaar
|
Binnen de monsters waarvan is vastgesteld dat ze een of meer ctDNA-mutaties bevatten, wordt het percentage ctDNA binnen de totale hoeveelheid cfDNA berekend.
|
1 jaar
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Aantal proefpersonen met een of meer van de 96 ctDNA-mutaties die kanker ontwikkelen
Tijdsspanne: 1 tot 5 jaar
|
De 1000 of meer personen in de studie zullen gedurende 1 tot 5 jaar worden gevolgd om de ontwikkeling van een maligniteit te beoordelen.
Speciale aandacht zal worden besteed aan het cohort met initiële testen die de aanwezigheid van ctDNA aangeven.
De proefpersonen kunnen in de loop van de tijd opnieuw worden getest om veranderende niveaus van ctDNA aan te tonen.
Hun eigen artsen zullen eventuele vervolgonderzoeken begeleiden, zoals beeldvorming of andere laboratoriumtests.
De test is ontworpen als een middel om gevallen van kanker op te sporen bij personen met een hoog risico op de ontwikkeling van kanker.
|
1 tot 5 jaar
|
Medewerkers en onderzoekers
Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Glenn Braunstein, MD, Pathway Genomics
- Studie directeur: Anja Kammesheidt, PhD, Pathway Genomics
Publicaties en nuttige links
De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.
Algemene publicaties
- Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ, Kinde I, Wang Y, Agrawal N, Bartlett BR, Wang H, Luber B, Alani RM, Antonarakis ES, Azad NS, Bardelli A, Brem H, Cameron JL, Lee CC, Fecher LA, Gallia GL, Gibbs P, Le D, Giuntoli RL, Goggins M, Hogarty MD, Holdhoff M, Hong SM, Jiao Y, Juhl HH, Kim JJ, Siravegna G, Laheru DA, Lauricella C, Lim M, Lipson EJ, Marie SK, Netto GJ, Oliner KS, Olivi A, Olsson L, Riggins GJ, Sartore-Bianchi A, Schmidt K, Shih lM, Oba-Shinjo SM, Siena S, Theodorescu D, Tie J, Harkins TT, Veronese S, Wang TL, Weingart JD, Wolfgang CL, Wood LD, Xing D, Hruban RH, Wu J, Allen PJ, Schmidt CM, Choti MA, Velculescu VE, Kinzler KW, Vogelstein B, Papadopoulos N, Diaz LA Jr. Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies. Sci Transl Med. 2014 Feb 19;6(224):224ra24. doi: 10.1126/scitranslmed.3007094.
- Freidin MB, Freydina DV, Leung M, Montero Fernandez A, Nicholson AG, Lim E. Circulating tumor DNA outperforms circulating tumor cells for KRAS mutation detection in thoracic malignancies. Clin Chem. 2015 Oct;61(10):1299-304. doi: 10.1373/clinchem.2015.242453. Epub 2015 Aug 13.
- Newman AM, Bratman SV, To J, Wynne JF, Eclov NC, Modlin LA, Liu CL, Neal JW, Wakelee HA, Merritt RE, Shrager JB, Loo BW Jr, Alizadeh AA, Diehn M. An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage. Nat Med. 2014 May;20(5):548-54. doi: 10.1038/nm.3519. Epub 2014 Apr 6.
- Kidess E, Heirich K, Wiggin M, Vysotskaia V, Visser BC, Marziali A, Wiedenmann B, Norton JA, Lee M, Jeffrey SS, Poultsides GA. Mutation profiling of tumor DNA from plasma and tumor tissue of colorectal cancer patients with a novel, high-sensitivity multiplexed mutation detection platform. Oncotarget. 2015 Feb 10;6(4):2549-61. doi: 10.18632/oncotarget.3041.
- Perrone F, Lampis A, Bertan C, Verderio P, Ciniselli CM, Pizzamiglio S, Frattini M, Nucifora M, Molinari F, Gallino G, Gariboldi M, Meroni E, Leo E, Pierotti MA, Pilotti S. Circulating free DNA in a screening program for early colorectal cancer detection. Tumori. 2014 Mar-Apr;100(2):115-21. doi: 10.1177/030089161410000201.
- Lin PC, Lin JK, Lin CH, Lin HH, Yang SH, Jiang JK, Chen WS, Chou CC, Tsai SF, Chang SC. Clinical Relevance of Plasma DNA Methylation in Colorectal Cancer Patients Identified by Using a Genome-Wide High-Resolution Array. Ann Surg Oncol. 2015 Dec;22 Suppl 3:S1419-27. doi: 10.1245/s10434-014-4277-2. Epub 2014 Dec 4.
- Spindler KL, Appelt AL, Pallisgaard N, Andersen RF, Brandslund I, Jakobsen A. Cell-free DNA in healthy individuals, noncancerous disease and strong prognostic value in colorectal cancer. Int J Cancer. 2014 Dec 15;135(12):2984-91. doi: 10.1002/ijc.28946. Epub 2014 Jun 17.
- Beaver JA, Jelovac D, Balukrishna S, Cochran R, Croessmann S, Zabransky DJ, Wong HY, Toro PV, Cidado J, Blair BG, Chu D, Burns T, Higgins MJ, Stearns V, Jacobs L, Habibi M, Lange J, Hurley PJ, Lauring J, VanDenBerg D, Kessler J, Jeter S, Samuels ML, Maar D, Cope L, Cimino-Mathews A, Argani P, Wolff AC, Park BH. Detection of cancer DNA in plasma of patients with early-stage breast cancer. Clin Cancer Res. 2014 May 15;20(10):2643-2650. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-13-2933. Epub 2014 Feb 6.
- Oshiro C, Kagara N, Naoi Y, Shimoda M, Shimomura A, Maruyama N, Shimazu K, Kim SJ, Noguchi S. PIK3CA mutations in serum DNA are predictive of recurrence in primary breast cancer patients. Breast Cancer Res Treat. 2015 Apr;150(2):299-307. doi: 10.1007/s10549-015-3322-6. Epub 2015 Mar 4.
- Bianchi DW, Chudova D, Sehnert AJ, Bhatt S, Murray K, Prosen TL, Garber JE, Wilkins-Haug L, Vora NL, Warsof S, Goldberg J, Ziainia T, Halks-Miller M. Noninvasive Prenatal Testing and Incidental Detection of Occult Maternal Malignancies. JAMA. 2015 Jul 14;314(2):162-9. doi: 10.1001/jama.2015.7120.
- Kinugasa H, Nouso K, Miyahara K, Morimoto Y, Dohi C, Tsutsumi K, Kato H, Matsubara T, Okada H, Yamamoto K. Detection of K-ras gene mutation by liquid biopsy in patients with pancreatic cancer. Cancer. 2015 Jul 1;121(13):2271-80. doi: 10.1002/cncr.29364. Epub 2015 Mar 30.
- Sanmamed MF, Fernandez-Landazuri S, Rodriguez C, Zarate R, Lozano MD, Zubiri L, Perez-Gracia JL, Martin-Algarra S, Gonzalez A. Quantitative cell-free circulating BRAFV600E mutation analysis by use of droplet digital PCR in the follow-up of patients with melanoma being treated with BRAF inhibitors. Clin Chem. 2015 Jan;61(1):297-304. doi: 10.1373/clinchem.2014.230235. Epub 2014 Nov 19.
- Hosny G, Farahat N, Tayel H, Hainaut P. Ser-249 TP53 and CTNNB1 mutations in circulating free DNA of Egyptian patients with hepatocellular carcinoma versus chronic liver diseases. Cancer Lett. 2008 Jun 18;264(2):201-8. doi: 10.1016/j.canlet.2008.01.031. Epub 2008 Mar 3.
- Izumchenko E, Chang X, Brait M, Fertig E, Kagohara LT, Bedi A, Marchionni L, Agrawal N, Ravi R, Jones S, Hoque MO, Westra WH, Sidransky D. Targeted sequencing reveals clonal genetic changes in the progression of early lung neoplasms and paired circulating DNA. Nat Commun. 2015 Sep 16;6:8258. doi: 10.1038/ncomms9258.
- Hamakawa T, Kukita Y, Kurokawa Y, Miyazaki Y, Takahashi T, Yamasaki M, Miyata H, Nakajima K, Taniguchi K, Takiguchi S, Mori M, Doki Y, Kato K. Monitoring gastric cancer progression with circulating tumour DNA. Br J Cancer. 2015 Jan 20;112(2):352-6. doi: 10.1038/bjc.2014.609. Epub 2014 Dec 9.
- Wang Y, Springer S, Mulvey CL, Silliman N, Schaefer J, Sausen M, James N, Rettig EM, Guo T, Pickering CR, Bishop JA, Chung CH, Califano JA, Eisele DW, Fakhry C, Gourin CG, Ha PK, Kang H, Kiess A, Koch WM, Myers JN, Quon H, Richmon JD, Sidransky D, Tufano RP, Westra WH, Bettegowda C, Diaz LA Jr, Papadopoulos N, Kinzler KW, Vogelstein B, Agrawal N. Detection of somatic mutations and HPV in the saliva and plasma of patients with head and neck squamous cell carcinomas. Sci Transl Med. 2015 Jun 24;7(293):293ra104. doi: 10.1126/scitranslmed.aaa8507.
- Reinert T, Scholer LV, Thomsen R, Tobiasen H, Vang S, Nordentoft I, Lamy P, Kannerup AS, Mortensen FV, Stribolt K, Hamilton-Dutoit S, Nielsen HJ, Laurberg S, Pallisgaard N, Pedersen JS, Orntoft TF, Andersen CL. Analysis of circulating tumour DNA to monitor disease burden following colorectal cancer surgery. Gut. 2016 Apr;65(4):625-34. doi: 10.1136/gutjnl-2014-308859. Epub 2015 Feb 4.
Nuttige links
Studie record data
Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.
Bestudeer belangrijke data
Studie start
1 november 2015
Primaire voltooiing (WERKELIJK)
1 augustus 2017
Studie voltooiing (WERKELIJK)
1 augustus 2017
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
13 november 2015
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
19 november 2015
Eerst geplaatst (SCHATTING)
23 november 2015
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (WERKELIJK)
6 april 2018
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
4 april 2018
Laatst geverifieerd
1 april 2018
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- Pathway Gennomics 004
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
NEE
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .