Hodnocení čtyř metod zpracování stolice v kombinaci s Xpert MTB/RIF Ultra pro diagnostiku intrathorakální dětské TBC (TB-Speed ​​- Stool Processing)

Toto je diagnostická studie hodnotící diagnostickou přesnost testu Ultra ve stolici s dvoustupňovým sekvenčním designem začínající jako kohorta dětí s předpokládanou TBC obohacenou ve druhém stádiu o ultra pozitivní případy TBC na respiračním vzorku. Jedná se jak o doplňkovou studii ke studiím TB-Speed ​​HIV (C18-27) a TB-Speed ​​SAM (C18-28), tak o studii zapisující děti z rutiny, které nebyly zařazeny do těchto dvou studií.

Tento návrh byl zvolen tak, aby bylo možné vyhodnotit citlivost a specifičnost testu Ultra v menší velikosti vzorku, která je obvykle vyžadována „klasickým“ prospektivním návrhem kohorty, a aby se zabránilo zkreslení nadhodnocování citlivosti klasicky spojené s případovou kontrolou. design. Aby bylo možné rychle generovat data o vhodné metodě zpracování stolice a přispět k plánovaným doporučením WHO pro testování stolice Ultra (očekává se ve 2. semestru 2020), bude použit dvoustupňový sekvenční návrh. S vědomím, že v průměru pouze 10–15 % dětí s presumptivní TBC v komunitním prostředí bude potvrzeno, aby bylo dosaženo velikosti vzorku potvrzených případů pro hodnocení citlivosti, 7 až 10krát více dětí s presumptivní TB by bylo nutné zapsat do prospektivního návrhu. Na druhou stranu by počet dětí s presumptivní TBC nepotvrzeným TBC pro odhad specificity byl dosažen mnohem dříve. Kromě toho je na základě výsledků předchozí studie známo, že specificita testu Xpert MTB/RIF ve stolici je vysoká (99% CI:98-99;), což by vedlo k relativně malé velikosti vzorku pro vyhodnocení specificity Ultra ve stolici.

Během první fáze vyšetřovatelé nabídnou, že se spojí se všemi po sobě jdoucími předpokládanými případy TBC přítomnými v místech studie, aby odhadli specificitu s očekávanou přesností a vypočítali předběžný odhad citlivosti. Během druhé fáze budou vyšetřovatelé nadále zapisovat pouze ty ze studií rychlosti TB a rutinní péče, kteří jsou Xpert pozitivní na respiračních vzorcích, aby odhadli citlivost s očekávanou přesností.

Tento dvoustupňový sekvenční návrh nejprve odhadující specificitu a poté citlivost popsal Wruck et al. jako účinný způsob ověřování diagnostických testů, když je prevalence onemocnění nízká. Nebylo by možné zařadit postupně všechny děti s předpokládanou TBC, aby bylo možné popsat očekávanou senzitivitu 60 % s přesností 10 %, protože by to vyžadovalo více než 900 pacientů, z nichž přibližně 800 by bylo kultivačně negativních. Ve dvoufázovém procesu popsaném Wruckem jsou ve fázi 2 vybrány pouze referenční standardní pozitivní vzorky z původní populace. Výzkumníci přizpůsobili tento návrh kontextu TBC, protože výsledky kultivace budou k dispozici až po zařazení (a pokud bude dítě pozitivní , pouze poté, co dítě zahájilo léčbu), a proto vybrat pouze ty, kteří jsou ultra pozitivní na respiračních vzorcích pro druhou kohortu, jako způsob, jak obohatit studovanou populaci o subpopulaci, která má vyšší pravděpodobnost prevalence TBC, než bude jejich skutečný stav onemocnění potvrzeno. Jiné srovnatelné diagnostické studie buď použily větší zdroje, aby zahrnovaly větší velikosti vzorků, nebo se uchýlily k podávání nepřesných odhadů citlivosti. Pokud je nám známo, jedná se o relativně unikátní přístup k designu studií pro studie přesnosti s několika publikovanými příklady.

S takovým designem by nemělo docházet k žádnému zkreslení hodnocení specifičnosti podobně jako u klasického prospektivního návrhu, protože toto hodnocení bude provedeno pouze u po sobě jdoucích dětí s předpokládanou TBC. Odhady citlivosti nemusí být zobecnitelné na všechny kultivačně potvrzené děti s TBC kvůli přístupu odběru vzorků. Xpert pozitivní děti budou mít s větší pravděpodobností vyšší biologickou zátěž, což způsobí možné zvýšení citlivosti. Výsledky však poskytnou cenné informace o variacích citlivosti různých metod zpracování stolice v této populaci.

Po dokončení prospektivní kohorty bude provedena průběžná analýza s cílem popsat specifičnost a předběžné výsledky citlivosti a shody mezi metodami zpracování. Během průběžné analýzy nebude nábor účastníků pozastaven. Na konci studie bude provedena závěrečná analýza k popisu citlivosti a také sekundárních koncových bodů.