Ocena czterech metod przetwarzania stolca w połączeniu z Xpert MTB/RIF Ultra w diagnostyce wewnątrzklatkowej gruźlicy dziecięcej (TB-Speed ​​- Stool Processing)

Jest to badanie diagnostyczne oceniające dokładność diagnostyczną testu Ultra w kale z dwuetapowym sekwencyjnym projektem rozpoczynającym się jako kohorta dzieci z podejrzeniem gruźlicy, wzbogacona w drugim etapie o ultradodatnie przypadki gruźlicy w próbce oddechowej. Jest to zarówno badanie pomocnicze w stosunku do badań TB-Speed ​​HIV (C18-27) i TB-Speed ​​SAM (C18-28), jak i badanie obejmujące dzieci z rutynowych badań, które nie zostały włączone do tych dwóch badań.

Ten projekt został wybrany, aby móc ocenić czułość i swoistość testu Ultra w mniejszej wielkości próbki, która jest zwykle wymagana w „klasycznym” prospektywnym projekcie kohortowym i uniknąć błędu przeszacowania czułości klasycznie związanego z kontrolą przypadku projekt. W celu szybkiego wygenerowania danych na temat odpowiedniej metody przetwarzania kału i przyczynienia się do planowanych zaleceń WHO dotyczących badania ultrasonograficznego kału (przewidywane w drugim półroczu 2020 r.), zastosowany zostanie dwuetapowy schemat sekwencyjny. Rzeczywiście, wiedząc, że średnio tylko 10-15% dzieci z podejrzeniem gruźlicy w środowisku lokalnym zostanie potwierdzonych, aby osiągnąć wielkość próby potwierdzonych przypadków do oceny wrażliwości, 7 do 10 razy więcej dzieci z podejrzeniem gruźlicy TB musiałoby zostać zarejestrowane w prospektywnym projekcie. Z drugiej strony liczba dzieci z podejrzeniem gruźlicy niepotwierdzonej gruźlicą do oszacowania specyficzności zostałaby osiągnięta znacznie wcześniej. Ponadto, na podstawie wyników poprzednich badań wiadomo, że specyficzność testu Xpert MTB/RIF w kale jest wysoka (99% CI:98-99;), co skutkowałoby stosunkowo małą liczebnością próby do oceny swoistości Ultra w kale.

Na pierwszym etapie badacze zaproponują połączenie wszystkich kolejnych domniemanych przypadków gruźlicy prezentowanych w ośrodkach badawczych w celu oszacowania specyficzności z oczekiwaną precyzją i obliczenia wstępnego oszacowania czułości. Podczas drugiego etapu badacze będą nadal rejestrować tylko tych z badań TB Speed ​​i rutynowej opieki, którzy uzyskali pozytywny wynik testu Xpert na próbkach oddechowych, aby oszacować czułość z oczekiwaną precyzją.

Ten dwuetapowy projekt sekwencyjny, w którym najpierw ocenia się specyficzność, a następnie czułość, został opisany przez Wrucka i in. jako skuteczny sposób walidacji testów diagnostycznych, gdy częstość występowania choroby jest niska. Nie byłoby wykonalne kolejne włączenie wszystkich dzieci z podejrzeniem gruźlicy w celu opisania oczekiwanej czułości na poziomie 60% z 10% dokładnością, ponieważ wymagałoby to ponad 900 pacjentów, z których około 800 miałoby ujemny wynik posiewu. W dwuetapowym procesie opisanym przez Wrucka na etapie 2 wybierane są tylko wzorcowe próbki pozytywne z pierwotnej populacji. Badacze dostosowali ten projekt do kontekstu gruźlicy, ponieważ wyniki posiewu będą dostępne dopiero po włączeniu (i jeśli dziecko jest pozytywne , dopiero po rozpoczęciu leczenia dziecka), stąd wybranie do drugiej kohorty tylko tych, którzy uzyskali wynik ultrapozytywny w próbkach z dróg oddechowych, jako sposób na wzbogacenie badanej populacji o subpopulację, która ma większe prawdopodobieństwo występowania gruźlicy, zanim ich prawdziwy status chorobowy zostanie określony Potwierdzony. Inne porównywalne badania diagnostyczne albo wykorzystywały większe zasoby, aby uwzględnić większe rozmiary próbek, albo uciekały się do zgłaszania nieprecyzyjnych szacunków czułości. Według naszej wiedzy jest to stosunkowo unikalne podejście do projektowania badań dla badań dokładności, z kilkoma opublikowanymi przykładami.

Przy takim projekcie nie powinno być żadnych odchyleń w ocenie swoistości, podobnie jak w przypadku klasycznego projektu prospektywnego, ponieważ ta ocena zostanie przeprowadzona tylko wśród kolejno włączanych dzieci z podejrzeniem gruźlicy. Szacunki czułości mogą nie być uogólnione na wszystkie dzieci gruźlicy potwierdzone posiewem ze względu na podejście do pobierania próbek. Dzieci z pozytywnym wynikiem testu Xpert będą bardziej narażone na wyższe obciążenie biologiczne, powodując możliwą inflację wrażliwości. Jednak wyniki dostarczą cennych informacji na temat różnic wrażliwości różnych metod przetwarzania kału w tej populacji.

Analiza tymczasowa zostanie przeprowadzona po zakończeniu prospektywnej kohorty w celu opisania specyfiki i wstępnych wyników wrażliwości i zgodności między metodami przetwarzania. Rekrutacja uczestników nie zostanie wstrzymana na czas analizy pośredniej. Końcowa analiza zostanie przeprowadzona na koniec badania w celu opisania wrażliwości oraz drugorzędowych punktów końcowych.