Valutazione di quattro metodi di elaborazione delle feci combinati con Xpert MTB/RIF Ultra per la diagnosi della tubercolosi intratoracica pediatrica (TB-Speed ​​- Stool Processing)

Si tratta di uno studio diagnostico che valuta l'accuratezza diagnostica del test Ultra nelle feci con un disegno sequenziale a due stadi partendo da una coorte di bambini con presunta tubercolosi arricchita in una seconda fase con casi di tubercolosi ultra positivi su campione respiratorio. È sia un accessorio per gli studi TB-Speed ​​HIV (C18-27) e TB-Speed ​​SAM (C18-28) sia uno studio che arruola bambini dalla routine non arruolati in questi due studi.

Questo disegno è stato scelto per poter valutare la sensibilità e la specificità del saggio Ultra in una dimensione del campione più piccola che è solitamente richiesta da un disegno di coorte prospettico "classico" ed evitando il pregiudizio della sovrastima della sensibilità classicamente associata al caso-controllo progetto. Al fine di generare rapidamente dati sul metodo di elaborazione delle feci appropriato e di contribuire alle raccomandazioni pianificate dell'OMS per l'Ultra test delle feci (previsto nel 2° semestre 2020), verrà utilizzato un disegno sequenziale a due fasi. Infatti, sapendo che in media solo il 10-15% dei bambini con presunta tubercolosi in un contesto comunitario sarà confermato, al fine di raggiungere la dimensione del campione di casi confermati per la valutazione della sensibilità, da 7 a 10 volte più bambini con presunta TB La TB dovrebbe essere inserita in un progetto prospettico. D'altra parte, il numero di bambini con presunta tubercolosi non confermata con tubercolosi per la stima della specificità verrebbe raggiunto molto prima. Inoltre, sulla base dei risultati dello studio precedente, è noto che la specificità del test Xpert MTB/RIF nelle feci è elevata (IC 99%: 98-99;), il che comporterebbe una dimensione del campione relativamente piccola per valutare la specificità dell'Ultra nelle feci.

Durante la prima fase, gli investigatori si offriranno di unire tutti i casi presunti di tubercolosi consecutivi che si presentano nei siti di studio per stimare la specificità con la precisione prevista e calcolare una stima preliminare della sensibilità. Durante la seconda fase, gli investigatori continueranno ad arruolare solo quelli degli studi TB Speed ​​​​e delle cure di routine che sono Xpert positivi su campioni respiratori al fine di stimare la sensibilità con la precisione prevista.

Questo disegno sequenziale a due stadi che stima prima la specificità e poi la sensibilità è stato descritto da Wruck et al. come un modo efficace per convalidare i test diagnostici quando la prevalenza della malattia è bassa. Non sarebbe possibile arruolare consecutivamente tutti i bambini con presunta tubercolosi per descrivere una sensibilità attesa del 60% con una precisione del 10% in quanto ciò richiederebbe oltre 900 pazienti, di cui circa 800 sarebbero negativi alla coltura. Nel processo in due fasi descritto da Wruck, nella fase 2 vengono selezionati solo campioni positivi standard di riferimento dalla popolazione originaria. , solo dopo che il bambino ha iniziato il trattamento), selezionando quindi solo coloro che sono ultra positivi sui campioni respiratori per la seconda coorte come un modo per arricchire la popolazione dello studio con una sottopopolazione che ha una maggiore probabilità di prevalenza della tubercolosi, prima che il loro vero stato di malattia sia confermato. Altri studi diagnostici comparabili hanno utilizzato risorse maggiori per includere campioni di dimensioni maggiori o sono ricorsi a riportare stime di sensibilità imprecise. A nostra conoscenza, questo è un approccio relativamente unico per studiare la progettazione per studi di accuratezza, con pochi esempi pubblicati.

Con tale disegno, non dovrebbero esserci pregiudizi sulla valutazione della specificità in modo simile a un disegno prospettico classico perché questa valutazione verrà effettuata solo tra i bambini iscritti consecutivamente con presunta tubercolosi. Le stime di sensibilità potrebbero non essere generalizzabili a tutti i bambini affetti da tubercolosi con conferma colturale a causa dell'approccio di campionamento. I bambini Xpert positivi avranno maggiori probabilità di avere carichi biologici più elevati, causando una possibile inflazione della sensibilità. Tuttavia, i risultati forniranno preziose informazioni sulle variazioni di sensibilità dei diversi metodi di elaborazione delle feci all'interno di questa popolazione.

Un'analisi ad interim sarà effettuata dopo il completamento della coorte prospettica al fine di descrivere la specificità ei risultati preliminari della sensibilità e l'accordo tra i metodi di elaborazione. Il reclutamento dei partecipanti non sarà sospeso durante l'analisi intermedia. Un'analisi finale sarà condotta alla fine dello studio per descrivere la sensibilità e gli endpoint secondari.