Évaluation de quatre méthodes de traitement des selles combinées avec Xpert MTB/RIF Ultra pour le diagnostic de la tuberculose pédiatrique intrathoracique (TB-Speed ​​- Traitement des selles)

Il s'agit d'une étude diagnostique évaluant la précision diagnostique du test Ultra dans les selles avec une conception séquentielle en deux étapes commençant par une cohorte d'enfants atteints de tuberculose présumée enrichie dans une deuxième étape avec des cas de tuberculose ultra positifs sur un échantillon respiratoire. Il s'agit à la fois d'une étude auxiliaire des études TB-Speed ​​HIV (C18-27) et TB-Speed ​​SAM (C18-28) et d'une étude recrutant des enfants de routine non inscrits dans ces deux études.

Ce design a été choisi pour pouvoir évaluer la sensibilité et la spécificité du test Ultra dans une taille d'échantillon plus petite qui est généralement requise par un design de cohorte prospective "classique" et en évitant le biais de surestimation de la sensibilité classiquement associée au cas-témoin motif. Afin de générer rapidement des données sur la méthode de traitement des selles appropriée et de contribuer aux recommandations prévues de l'OMS pour les tests Ultra sur les selles (prévues pour le 2e semestre 2020), une conception séquentielle en deux étapes sera utilisée. En effet, sachant qu'en moyenne seulement 10 à 15 % des enfants avec présomption de TB en milieu communautaire seront confirmés, pour atteindre la taille d'échantillon de cas confirmés pour l'évaluation de la sensibilité, 7 à 10 fois plus d'enfants avec présomption de TB La tuberculose devrait être inscrite dans une conception prospective. En revanche, le nombre d'enfants présumés TB non confirmés TB pour l'estimation de la spécificité serait atteint beaucoup plus tôt. De plus, sur la base des résultats de l'étude précédente, on sait que la spécificité du test Xpert MTB/RIF dans les selles est élevée (IC à 99 % : 98-99 ;), ce qui entraînerait une taille d'échantillon relativement petite pour évaluer la spécificité de l'Ultra dans les selles.

Au cours de la première étape, les enquêteurs proposeront de joindre tous les cas présumés consécutifs de tuberculose se présentant sur les sites d'étude pour estimer la spécificité avec la précision attendue et calculer une estimation préliminaire de la sensibilité. Au cours de la deuxième étape, les enquêteurs continueront à ne recruter que ceux des études TB Speed ​​et des soins de routine qui sont Xpert positifs sur les échantillons respiratoires afin d'estimer la sensibilité avec la précision attendue.

Cette conception séquentielle en deux étapes estimant d'abord la spécificité puis la sensibilité a été décrite par Wruck et al. comme un moyen efficace de valider les tests de diagnostic lorsque la prévalence de la maladie est faible. Il ne serait pas possible d'inscrire consécutivement tous les enfants atteints de tuberculose présumée pour décrire une sensibilité attendue de 60 % avec une précision de 10 %, car cela nécessiterait plus de 900 patients, dont environ 800 seraient négatifs à la culture. Dans le processus en deux étapes décrit par Wruck, seuls les échantillons positifs standard de référence de la population d'origine sont sélectionnés à l'étape 2. Les enquêteurs ont adapté cette conception au contexte de la tuberculose car les résultats de la culture ne seront disponibles qu'après l'inscription (et si l'enfant est positif , seulement après que l'enfant a commencé le traitement), ne sélectionnant donc que ceux qui sont ultra positifs sur les échantillons respiratoires pour la deuxième cohorte afin d'enrichir la population de l'étude avec une sous-population qui a une probabilité de prévalence de la tuberculose plus élevée, avant que leur véritable statut de la maladie ne soit confirmé. D'autres études diagnostiques comparables ont soit utilisé des ressources plus importantes pour inclure des échantillons de plus grande taille, soit ont recouru à la communication d'estimations imprécises de la sensibilité. À notre connaissance, il s'agit d'une approche relativement unique pour étudier la conception des études d'exactitude, avec peu d'exemples publiés.

Avec une telle conception, il ne devrait y avoir aucun biais sur l'évaluation de la spécificité de la même manière qu'une conception prospective classique, car cette évaluation sera effectuée uniquement parmi les enfants enrôlés consécutivement atteints de TB présumée. Les estimations de sensibilité peuvent ne pas être généralisables à tous les enfants TB confirmés par culture en raison de l'approche d'échantillonnage. Les enfants positifs à l'Xpert seront plus susceptibles d'avoir des charges biologiques plus élevées, provoquant une possible inflation de la sensibilité. Cependant, les résultats fourniront des informations précieuses sur les variations de sensibilité des différentes méthodes de traitement des selles au sein de cette population.

Une analyse intermédiaire sera effectuée après l'achèvement de la cohorte prospective afin de décrire la spécificité et les résultats préliminaires de la sensibilité et de l'accord entre les méthodes de traitement. Le recrutement des participants ne sera pas suspendu pendant l'analyse intermédiaire. Une analyse finale sera réalisée à la fin de l'étude pour décrire la sensibilité ainsi que les critères d'évaluation secondaires.