Genomické přístupy k rozboru interakcí mezi lidským hostitelem a patogenem v amazonském deštném pralese (PATHO-NAT)

Amazonský deštný prales se vyznačuje nepříznivými klimatickými podmínkami a velkou diverzitou patogenních mikroorganismů, které by následně vytvářely selektivní tlak na imunitní odpověď člověka s vysokým dopadem na úmrtnost. Některé z nejlépe charakterizovaných příkladů lidské genetické adaptace souvisí s infekcemi; například alely způsobující srpkovitou anémii, talasémii a malárii. Kromě toho zavlečení infekčních nemocí ze „starého světa“ během španělské kolonizace v 15. století a urbanizace v posledních několika stoletích v Amazonii také vyvolalo rychlou adaptaci, která by mohla vést ke změnám imunitní reakce. Evoluční mechanismy, které přispěly k přizpůsobení lidské obrany proti zmíněným jevům a událostem v této oblasti, jsou však špatně pochopeny. Z tohoto důvodu by nám studium těchto lidských genetických mechanismů v původních populacích umožnilo identifikovat nové geny, které by byly spojeny s odolností vůči infekcím, a také prozkoumat známky rychlé adaptace na prostředí, kterému byly amazonské populace v průběhu své historie vystaveny. .

Navrhujeme studovat variace imunitního systému v amazonských populacích, společně studovat stupeň diverzity s různými přístupy: genomický, epigenomický a transkriptomický hostitele a virového exposomu, s přihlédnutím k sociodemografickým charakteristikám a komorbiditám, které mohou ovlivnit imunitní odpověď. Tato studie poskytne nové poznatky o variantách v lidském genomu, které ovlivňují imunitní odpověď, a tím zvýší naše porozumění etiologii a náchylnosti k onemocněním souvisejícím s imunitou, zejména tropickým infekčním chorobám. Vzhledem k tomu, že lidské genetické studie jsou v populacích původních obyvatel Ameriky nedostatečně zastoupeny, získané znalosti by snížily existující nerovnost ve znalostech zdraví mezi původními a nepůvodními populacemi.