Genomiske tilnærminger for å dissekere menneskelige vert-patogen-interaksjoner i Amazonas regnskog (PATHO-NAT)

Regnskogen i Amazonas er preget av ugunstige klimatiske forhold og et stort mangfold av patogene mikroorganismer som følgelig vil generere et selektivt press på den menneskelige immunresponsen med høy innvirkning på dødeligheten. Noen av de best karakteriserte eksemplene på menneskelig genetisk tilpasning har vært relatert til infeksjoner; for eksempel allelene som forårsaker sigdcelleanemi, talassemi og malaria. I tillegg har introduksjonen av smittsomme sykdommer fra «den gamle verden» under spansk kolonisering på 1400-tallet og urbaniseringen av de siste århundrene i Amazonas også generert rask tilpasning som kan drive variasjon i immunrespons. Imidlertid er de evolusjonære mekanismene som bidro til tilpasningen av menneskelig forsvar mot de nevnte fenomenene og hendelsene i denne regionen dårlig forstått. Av denne grunn vil studier av disse menneskelige genetiske mekanismene i innfødte populasjoner tillate oss å identifisere nye gener som vil være assosiert med resistens mot infeksjoner, og også å utforske tegn på rask tilpasning til miljøet som Amazonas populasjoner har vært utsatt for gjennom sin historie. .

Vi foreslår å studere variasjonen av immunsystemet i Amazonas-populasjoner, og studere sammen graden av mangfold med forskjellige tilnærminger: genomisk, epi-genomisk og transkriptomisk av verts- og viruseksposomet, under hensyntagen til sosiodemografiske egenskaper og komorbiditeter, som kan forme immun respons. Denne studien vil gi ny innsikt i varianter i det menneskelige genomet som påvirker immunresponsen, og dermed øke vår forståelse av etiologi og mottakelighet for immunrelaterte sykdommer, hovedsakelig tropiske infeksjonssykdommer. Fordi menneskelige genetiske studier er underrepresentert i indianerpopulasjoner, vil kunnskapen som er oppnådd redusere den eksisterende ulikheten i helsekunnskap mellom innfødte og ikke-innfødte befolkninger.