Genomiset lähestymistavat ihmisen isäntä-patogeenien vuorovaikutusten leikkaamiseen Amazonin sademetsissä (PATHO-NAT)

Amazonin sademetsälle on ominaista epäsuotuisat ilmasto-olosuhteet ja suuri monimuotoisuus patogeenisiä mikro-organismeja, jotka siten aiheuttaisivat selektiivistä painetta ihmisen immuunivasteeseen ja vaikuttaisivat voimakkaasti kuolleisuuteen. Jotkut parhaiten luonnehdituista esimerkeistä ihmisen geneettisestä sopeutumisesta ovat liittyneet infektioihin; esimerkiksi alleelit, jotka aiheuttavat sirppisoluanemiaa, talassemiaa ja malariaa. Lisäksi tartuntatautien leviäminen "vanhasta maailmasta" Espanjan kolonisaation aikana 1400-luvulla ja viime vuosisatojen kaupungistuminen Amazonissa on myös synnyttänyt nopean sopeutumisen, joka saattaa aiheuttaa vaihtelua immuunivasteessa. Evoluutiomekanismit, jotka myötävaikuttivat ihmisen puolustuksen mukautumiseen edellä mainittuja ilmiöitä ja tapahtumia vastaan ​​tällä alueella, ovat kuitenkin huonosti ymmärrettyjä. Tästä syystä näiden ihmisen geneettisten mekanismien tutkiminen alkuperäispopulaatioissa antaisi meille mahdollisuuden tunnistaa uusia geenejä, jotka liittyisivät vastustuskykyyn infektioita vastaan, ja myös tutkia merkkejä nopeasta sopeutumisesta ympäristöön, jolle Amazonin populaatiot ovat olleet alttiina koko historiansa ajan. .

Ehdotamme, että tutkitaan immuunijärjestelmän vaihtelua Amazonin populaatioissa tutkimalla yhdessä monimuotoisuuden astetta eri lähestymistavoilla: isännän genominen, epigenominen ja transkriptominen isännän ja viruksen altistuminen, ottaen huomioon sosiodemografiset ominaisuudet ja liitännäissairaudet, jotka voivat muokata immuunivaste. Tämä tutkimus tarjoaa uusia näkemyksiä ihmisen genomin muunnelmista, jotka vaikuttavat immuunivasteeseen, mikä lisää ymmärrystämme immuunijärjestelmään liittyvien sairauksien, pääasiassa trooppisten infektiotautien, etiologiasta ja herkkyydestä. Koska ihmisten geneettiset tutkimukset ovat aliedustettuja intiaaniväestössä, saatu tieto vähentäisi olemassa olevaa terveystiedon epätasa-arvoa alkuperäiskansojen ja ei-syntyperäisten populaatioiden välillä.