Genomiske tilgange til at dissekere menneskelige vært-patogen-interaktioner i Amazonas regnskov (PATHO-NAT)

Amazonas regnskoven er kendetegnet ved ugunstige klimatiske forhold og en stor mangfoldighed af patogene mikroorganismer, der som følge heraf vil generere et selektivt pres på det menneskelige immunrespons med stor indvirkning på dødeligheden. Nogle af de bedst karakteriserede eksempler på menneskelig genetisk tilpasning har været relateret til infektioner; for eksempel allelerne, der forårsager seglcelleanæmi, thalassæmi og malaria. Derudover har introduktionen af ​​infektionssygdomme fra den "gamle verden" under spansk kolonisering i det 15. århundrede og urbaniseringen af ​​de sidste par århundreder i Amazonas også genereret hurtig tilpasning, der kunne drive variation i immunrespons. Imidlertid er de evolutionære mekanismer, der bidrog til tilpasningen af ​​menneskets forsvar mod de førnævnte fænomener og begivenheder i denne region, dårligt forstået. Af denne grund ville undersøgelse af disse menneskelige genetiske mekanismer i indfødte populationer give os mulighed for at identificere nye gener, der ville være forbundet med resistens over for infektioner, og også at udforske tegnene på hurtig tilpasning til det miljø, som Amazonas befolkninger har været udsat for gennem deres historie. .

Vi foreslår at studere variationen af ​​immunsystemet i Amazonas populationer, hvor vi sammen studerer graden af ​​diversitet med forskellige tilgange: genomisk, epigenomisk og transkriptomisk af værts- og viruseksposomet, under hensyntagen til sociodemografiske karakteristika og komorbiditeter, som kan forme immunrespons. Denne undersøgelse vil give ny indsigt i varianter i det menneskelige genom, der påvirker immunresponset, og derved øge vores forståelse af ætiologien og modtageligheden over for immunrelaterede sygdomme, hovedsageligt tropiske infektionssygdomme. Fordi menneskelige genetiske undersøgelser er underrepræsenteret i indianske befolkninger, ville den opnåede viden reducere den eksisterende ulighed i sundhedsviden mellem indfødte og ikke-indfødte befolkninger.