Genomische Ansätze zur Untersuchung menschlicher Wirt-Pathogen-Interaktionen im Amazonas-Regenwald (PATHO-NAT)

Der Amazonas-Regenwald ist durch widrige klimatische Bedingungen und eine große Vielfalt pathogener Mikroorganismen gekennzeichnet, die folglich einen selektiven Druck auf die menschliche Immunantwort ausüben würden, der sich stark auf die Sterblichkeit auswirkt. Einige der am besten charakterisierten Beispiele menschlicher genetischer Anpassung stehen im Zusammenhang mit Infektionen; zum Beispiel die Allele, die Sichelzellenanämie, Thalassämie und Malaria verursachen. Darüber hinaus hat die Einführung von Infektionskrankheiten aus der „alten Welt“ während der spanischen Kolonisierung im 15. Jahrhundert und die Urbanisierung der letzten Jahrhunderte im Amazonasgebiet ebenfalls zu einer schnellen Anpassung geführt, die zu einer Variation der Immunantwort führen könnte. Allerdings sind die evolutionären Mechanismen, die zur Anpassung der menschlichen Abwehr gegen die oben genannten Phänomene und Ereignisse in dieser Region beigetragen haben, kaum verstanden. Aus diesem Grund würde die Untersuchung dieser menschlichen genetischen Mechanismen in einheimischen Populationen es uns ermöglichen, neue Gene zu identifizieren, die mit der Resistenz gegen Infektionen verbunden sind, und auch die Anzeichen einer schnellen Anpassung an die Umwelt zu untersuchen, der die Amazonas-Populationen im Laufe ihrer Geschichte ausgesetzt waren .

Wir schlagen vor, die Variation des Immunsystems in Amazonas-Populationen zu untersuchen und dabei gemeinsam den Grad der Diversität mit verschiedenen Ansätzen zu untersuchen: genomisch, epigenomisch und transkriptomisch des Wirts und des viralen Exposoms, unter Berücksichtigung soziodemografischer Merkmale und Komorbiditäten, die das Immunsystem beeinflussen können Immunreaktion. Diese Studie wird neue Einblicke in Varianten im menschlichen Genom liefern, die die Immunantwort beeinflussen, und dadurch unser Verständnis der Ätiologie und Anfälligkeit für immunbedingte Krankheiten, hauptsächlich tropische Infektionskrankheiten, verbessern. Da humangenetische Studien in indianischen Bevölkerungsgruppen unterrepräsentiert sind, würden die gewonnenen Erkenntnisse die bestehende Ungleichheit im Gesundheitswissen zwischen einheimischen und nicht-einheimischen Bevölkerungsgruppen verringern.