Methylačně specifický PCR test pro časný screening a včasnou diagnostiku karcinomu nosohltanu

Karcinom nosohltanu je jedním z nejčastějších maligních nádorů v Číně, s pokrokem radiochemické komplexní léčby, rané stadium Pětileté přežití u karcinomu nosohltanu je více než 95 %. Vzhledem ke skryté lokalizaci karcinomu nosohltanu a nedostatku zjevných časných klinických příznaků však více než 70 % z 87 000 nově diagnostikovaných případů každý rok patří do pokročilého stadia karcinomu nosohltanu a 5letá míra přežití pokročilého nazofaryngeálního karcinomu karcinom je jen asi 70 %. Včasný screening a diagnostika a včasná léčba jsou proto klíčem ke zlepšení přežití pacientů s karcinomem nosohltanu. Výběr citlivého a přesného biomarkeru pro rakovinu nosohltanu a spoléhání se na jednoduchou a proveditelnou vyšetřovací metodu pro detekci odběru vzorků výrazně zlepší rychlost časné diagnózy rakoviny nosohltanu.

Metylace DNA je formou chemické modifikace DNA, kterou lze provést bez změny změn sekvence DNA v genetické expresi. Hlavní úlohou methylace DNA je regulace genové exprese. Nádorové supresorové geny hrají funkce regulace buněčné diferenciace, zrání a programované smrti. Pokud však dojde k methylaci promotorové oblasti, dojde k inhibici exprese tumor supresorových genů a ztrátě funkce, což má za následek, že buňky zůstávají ve stadiu nízké diferenciace a proliferace, inhibice apoptózy, tvorba krevních cév klastrovými buňkami, ztráta adheze buněk a tvorba nádorů. Je vidět, že k methylaci DNA dochází v časném stadiu nádoru a tato biologická vlastnost z ní činí silnou aplikační vyhlídku při časném screeningu nádoru.

Existuje mnoho metod detekce methylace DNA, mezi nimi methylačně specifická PCR (MSP) může snadno a rychle určit metylační stav konkrétního genu, splňující dostupné, pohodlné a snadno zobecňující charakteristiky požadované pro screeningové testy. V kombinaci s předchozími experimenty MSP a předchozími zprávami jsme zjistili, že hladiny methylace promotorových fragmentů genů H4C6, Septin9 a RASSF1A v tkáních nasofaryngeálního karcinomu byly významně vyšší než ve zdravých lidských tkáních nosohltanu. To naznačuje, že methylace těchto tří genů může být použita jako biomarkery pro časný screening a diagnostiku nazofaryngeálního karcinomu.

Cílem této studie je proto detekovat metylační stav genů H4C6, Septin9 a RASSF1A na základě metody MSP s jednoduchou obsluhou a nízkou cenou. S využitím klinickopatologické diagnostiky jako zlatého standardu byla ověřena hodnota tohoto genového metylačního indexu v časném screeningu a časné diagnostice karcinomu nosohltanu, což poskytuje nový detekční index a metodu pro zlepšení časné diagnostiky karcinomu nosohltanu.