- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT06367049
Metyleringsspesifikk PCR-test for tidlig screening og tidlig diagnose av nasofaryngealt karsinom
Nasofaryngeal karsinom er en av de vanligste ondartede svulstene i Kina, med fremgang av radiokjemisk omfattende behandling, tidlig stadium. 5-års overlevelsesraten for nasofaryngeal kreft er mer enn 95 %. På grunn av det skjulte stedet for nasofaryngeal karsinom og mangelen på åpenbare tidlige kliniske symptomer, tilhører imidlertid mer enn 70 % av de 87 000 nydiagnostiserte tilfellene hvert år det avanserte stadiet av nasofaryngealt karsinom, og 5-års overlevelsesraten for avansert nasofarynx. karsinom er bare rundt 70%. Derfor er tidlig screening og diagnose og tidlig behandling nøkkelen til å forbedre overlevelsen til pasienter med nasofaryngeal kreft. Å velge en sensitiv og nøyaktig biomarkør for nasofaryngeal kreft og stole på en enkel og gjennomførbar undersøkelsesmetode for prøvetaking vil i stor grad forbedre den tidlige diagnostiseringen av nasofaryngeal kreft.
DNA-metylering er en form for kjemisk modifisering av DNA som kan gjøres uten å endre DNA-sekvensendringene i genetisk uttrykk. Hovedrollen til DNA-metylering er å regulere genuttrykk. Tumorsuppressorgener spiller funksjonene til å regulere celledifferensiering, modning og programmert død. Imidlertid, hvis metylering av promotorregionen skjer, hemmes uttrykket av tumorsuppressorgenene og funksjonen går tapt, noe som resulterer i at celler forblir i stadiet med lav differensiering og spredning, hemming av apoptose, dannelse av blodkar av klyngeceller, tap av celleadhesjon og dannelse av svulster. Det kan sees at DNA-metylering skjer i det tidlige stadiet av svulsten, og denne biologiske egenskapen gjør det til et sterkt brukspotensiale i tidlig tumorscreening.
Det er mange metoder for å oppdage DNA-metylering, blant annet kan metyleringsspesifikk PCR (MSP) enkelt og raskt bestemme metyleringsstatusen til et spesifikt gen, og oppfylle de rimelige, praktiske og enkle å generalisere egenskapene som kreves for screeningtester. I kombinasjon med tidligere MSP-eksperimenter og tidligere rapporter fant vi at metyleringsnivåene til promoterfragmenter av H4C6-, Septin9- og RASSF1A-gener i nasofaryngealt karsinomvev var betydelig høyere enn i friskt humant nasofaryngealt vev. Dette antyder at metylering av disse tre genene kan brukes som biomarkører for tidlig screening og diagnostisering av nasofaryngealt karsinom.
Derfor har denne studien til hensikt å oppdage metyleringsstatusen til H4C6-, Septin9- og RASSF1A-gener basert på MSP-metoden med enkel betjening og lave kostnader. Ved å bruke klinikopatologisk diagnose som gullstandarden, ble verdien av denne genmetyleringsindeksen i tidlig screening og tidlig diagnose av nasofaryngeal kreft bekreftet, noe som ga en ny deteksjonsindeks og metode for å forbedre den tidlige diagnostiseringsraten av nasofaryngeal kreft.
Studieoversikt
Status
Intervensjon / Behandling
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
Guangdong
-
Guangzhou, Guangdong, Kina, 510060
- Sun Yat-sen University Cancer Center
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Kasusgruppe (nasofaryngeal karsinomgruppe): nasofaryngeal karsinom bekreftet av histologi eller cytologi. Kontrollgruppe (ikke-nasofaryngeal karsinomgruppe): ingen pasienter med nasofaryngeal karsinom.
- Alder ≥18 år og ≤70 år.
- Ingen tidligere historie med andre svulster, og ingen nåværende svulster.
Ekskluderingskriterier:
- Karnofsky scorer ≤70 poeng eller Zubrod scorer >2 poeng.
- Det er alvorlige medisinske komplikasjoner, dysfunksjon av viktige organer (hjerte, lunge, lever, nyre) eller nevropsykiatriske lidelser.
- Andre pasienter eller frivillige ansett som uegnet for inkludering av tilsynslegen.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Pasientgruppe
Ta prøver av deres nasofaryngeale vattpinneprøver og perifere blodprøver.
|
Metyleringsspesifikk PCR er den enkleste og raskeste metoden for kvalitativ påvisning av metyleringsstatus. Den umetylerte C-basen omdannes til U ved bisulfittkonvertering, som deretter amplifiseres ved PCR med primere (metyleringsspesifikke og ikke-metyleringsspesifikke primere) og deretter påvises ved agarosegelelektroforese eller en probe. Nøkkelen til MSP er å designe PCR-primere for spesifikke genregioner. Forskerteamet i dette prosjektet har tidligere funnet sekvensstedene for metylering av H4C6-, Septin9- og RASSF1A-gener i nasofaryngealt karsinomvev gjennom metyleringssekvensering, og designet spesifikke MSP-amplifikasjonsprimere og prober i henhold til dette, som kan utføre metyleringsdeteksjon enkelt og raskt. |
|
Ikke-pasientgruppe
Ta prøver av deres nasofaryngeale vattpinneprøver og perifere blodprøver.
|
Metyleringsspesifikk PCR er den enkleste og raskeste metoden for kvalitativ påvisning av metyleringsstatus. Den umetylerte C-basen omdannes til U ved bisulfittkonvertering, som deretter amplifiseres ved PCR med primere (metyleringsspesifikke og ikke-metyleringsspesifikke primere) og deretter påvises ved agarosegelelektroforese eller en probe. Nøkkelen til MSP er å designe PCR-primere for spesifikke genregioner. Forskerteamet i dette prosjektet har tidligere funnet sekvensstedene for metylering av H4C6-, Septin9- og RASSF1A-gener i nasofaryngealt karsinomvev gjennom metyleringssekvensering, og designet spesifikke MSP-amplifikasjonsprimere og prober i henhold til dette, som kan utføre metyleringsdeteksjon enkelt og raskt. |
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Følsomhet
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år
|
Andelen pasienter med patologisk diagnose av nasofaryngealt karsinom med positiv metyleringsindeks.
|
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Spesifisitet
Tidsramme: gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år
|
Andelen ikke-nasofaryngeale karsinompasienter med negativ metyleringsindeks.
|
gjennom studiegjennomføring, gjennomsnittlig 1 år
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Yi-Jun Hua, Phd, Sun Yat-sen University
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Chan KCA, Woo JKS, King A, Zee BCY, Lam WKJ, Chan SL, Chu SWI, Mak C, Tse IOL, Leung SYM, Chan G, Hui EP, Ma BBY, Chiu RWK, Leung SF, van Hasselt AC, Chan ATC, Lo YMD. Analysis of Plasma Epstein-Barr Virus DNA to Screen for Nasopharyngeal Cancer. N Engl J Med. 2017 Aug 10;377(6):513-522. doi: 10.1056/NEJMoa1701717. Erratum In: N Engl J Med. 2018 Mar 8;378(10 ):973.
- Zhang MX, Li J, Shen GP, Zou X, Xu JJ, Jiang R, You R, Hua YJ, Sun Y, Ma J, Hong MH, Chen MY. Intensity-modulated radiotherapy prolongs the survival of patients with nasopharyngeal carcinoma compared with conventional two-dimensional radiotherapy: A 10-year experience with a large cohort and long follow-up. Eur J Cancer. 2015 Nov;51(17):2587-95. doi: 10.1016/j.ejca.2015.08.006. Epub 2015 Aug 26.
- Zeng Y, Zhang LG, Wu YC, Huang YS, Huang NQ, Li JY, Wang YB, Jiang MK, Fang Z, Meng NN. Prospective studies on nasopharyngeal carcinoma in Epstein-Barr virus IgA/VCA antibody-positive persons in Wuzhou City, China. Int J Cancer. 1985 Nov 15;36(5):545-7. doi: 10.1002/ijc.2910360505.
- Ji MF, Sheng W, Cheng WM, Ng MH, Wu BH, Yu X, Wei KR, Li FG, Lian SF, Wang PP, Quan W, Deng L, Li XH, Liu XD, Xie YL, Huang SJ, Ge SX, Huang SL, Liang XJ, He SM, Huang HW, Xia SL, Ng PS, Chen HL, Xie SH, Liu Q, Hong MH, Ma J, Yuan Y, Xia NS, Zhang J, Cao SM. Incidence and mortality of nasopharyngeal carcinoma: interim analysis of a cluster randomized controlled screening trial (PRO-NPC-001) in southern China. Ann Oncol. 2019 Oct 1;30(10):1630-1637. doi: 10.1093/annonc/mdz231.
- Karimi M, Johansson S, Stach D, Corcoran M, Grander D, Schalling M, Bakalkin G, Lyko F, Larsson C, Ekstrom TJ. LUMA (LUminometric Methylation Assay)--a high throughput method to the analysis of genomic DNA methylation. Exp Cell Res. 2006 Jul 1;312(11):1989-95. doi: 10.1016/j.yexcr.2006.03.006. Epub 2006 Apr 19.
- Lyu JY, Chen JY, Zhang XJ, Zhang MW, Yu GS, Zhang L, Wen Z. Septin 9 Methylation in Nasopharyngeal Swabs: A Potential Minimally Invasive Biomarker for the Early Detection of Nasopharyngeal Carcinoma. Dis Markers. 2020 May 5;2020:7253531. doi: 10.1155/2020/7253531. eCollection 2020.
- Chang HW, Chan A, Kwong DL, Wei WI, Sham JS, Yuen AP. Evaluation of hypermethylated tumor suppressor genes as tumor markers in mouth and throat rinsing fluid, nasopharyngeal swab and peripheral blood of nasopharygeal carcinoma patient. Int J Cancer. 2003 Jul 20;105(6):851-5. doi: 10.1002/ijc.11162. Erratum In: Int J Cancer. 2003 Oct 10;106(6):984.
- Wong TS, Kwong DL, Sham JS, Wei WI, Kwong YL, Yuen AP. Quantitative plasma hypermethylated DNA markers of undifferentiated nasopharyngeal carcinoma. Clin Cancer Res. 2004 Apr 1;10(7):2401-6. doi: 10.1158/1078-0432.ccr-03-0139.
- Hutajulu SH, Indrasari SR, Indrawati LP, Harijadi A, Duin S, Haryana SM, Steenbergen RD, Greijer AE, Middeldorp JM. Epigenetic markers for early detection of nasopharyngeal carcinoma in a high risk population. Mol Cancer. 2011 May 2;10:48. doi: 10.1186/1476-4598-10-48.
- Ye M, Huang T, Ni C, Yang P, Chen S. Diagnostic Capacity of RASSF1A Promoter Methylation as a Biomarker in Tissue, Brushing, and Blood Samples of Nasopharyngeal Carcinoma. EBioMedicine. 2017 Apr;18:32-40. doi: 10.1016/j.ebiom.2017.03.038. Epub 2017 Apr 2.
- Li Y, Yang X, Du X, Lei Y, He Q, Hong X, Tang X, Wen X, Zhang P, Sun Y, Zhang J, Wang Y, Ma J, Liu N. RAB37 Hypermethylation Regulates Metastasis and Resistance to Docetaxel-Based Induction Chemotherapy in Nasopharyngeal Carcinoma. Clin Cancer Res. 2018 Dec 15;24(24):6495-6508. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-0532. Epub 2018 Aug 21. Erratum In: Clin Cancer Res. 2022 Jan 15;28(2):430.
- Shi F, Zhou M, Shang L, Du Q, Li Y, Xie L, Liu X, Tang M, Luo X, Fan J, Zhou J, Gao Q, Qiu S, Wu W, Zhang X, Bode AM, Cao Y. EBV(LMP1)-induced metabolic reprogramming inhibits necroptosis through the hypermethylation of the RIP3 promoter. Theranostics. 2019 Apr 13;9(9):2424-2438. doi: 10.7150/thno.30941. eCollection 2019.
- Zhao Y, Hong XH, Li K, Li YQ, Li YQ, He SW, Zhang PP, Li JY, Li Q, Liang YL, Chen Y, Ma J, Liu N, Chen YP. ZNF582 hypermethylation promotes metastasis of nasopharyngeal carcinoma by regulating the transcription of adhesion molecules Nectin-3 and NRXN3. Cancer Commun (Lond). 2020 Dec;40(12):721-737. doi: 10.1002/cac2.12104. Epub 2020 Oct 10. Erratum In: Cancer Commun (Lond). 2022 Mar;42(3):281-283.
- Chen Y, Zhao Y, Yang X, Ren X, Huang S, Gong S, Tan X, Li J, He S, Li Y, Hong X, Li Q, Ding C, Fang X, Ma J, Liu N. USP44 regulates irradiation-induced DNA double-strand break repair and suppresses tumorigenesis in nasopharyngeal carcinoma. Nat Commun. 2022 Jan 25;13(1):501. doi: 10.1038/s41467-022-28158-2.
- Papanicolau-Sengos A, Aldape K. DNA Methylation Profiling: An Emerging Paradigm for Cancer Diagnosis. Annu Rev Pathol. 2022 Jan 24;17:295-321. doi: 10.1146/annurev-pathol-042220-022304. Epub 2021 Nov 4.
- Roy D, Tiirikainen M. Diagnostic Power of DNA Methylation Classifiers for Early Detection of Cancer. Trends Cancer. 2020 Feb;6(2):78-81. doi: 10.1016/j.trecan.2019.12.006. Epub 2020 Feb 3.
- Widschwendter M, Zikan M, Wahl B, Lempiainen H, Paprotka T, Evans I, Jones A, Ghazali S, Reisel D, Eichner J, Rujan T, Yang Z, Teschendorff AE, Ryan A, Cibula D, Menon U, Wittenberger T. The potential of circulating tumor DNA methylation analysis for the early detection and management of ovarian cancer. Genome Med. 2017 Dec 22;9(1):116. doi: 10.1186/s13073-017-0500-7.
- Sung CK, Yim H. CRISPR-mediated promoter de/methylation technologies for gene regulation. Arch Pharm Res. 2020 Jul;43(7):705-713. doi: 10.1007/s12272-020-01257-8. Epub 2020 Jul 28.
- Mattei AL, Bailly N, Meissner A. DNA methylation: a historical perspective. Trends Genet. 2022 Jul;38(7):676-707. doi: 10.1016/j.tig.2022.03.010. Epub 2022 Apr 30.
- Liu YP, Lv X, Zou X, Hua YJ, You R, Yang Q, Xia L, Guo SY, Hu W, Zhang MX, Chen SY, Lin M, Xie YL, Liu LZ, Sun R, Huang PY, Fan W, Guo X, Hong MH, Chen MY. Minimally invasive surgery alone compared with intensity-modulated radiotherapy for primary stage I nasopharyngeal carcinoma. Cancer Commun (Lond). 2019 Nov 15;39(1):75. doi: 10.1186/s40880-019-0415-3.
- Chan KC, Lo YM. Circulating EBV DNA as a tumor marker for nasopharyngeal carcinoma. Semin Cancer Biol. 2002 Dec;12(6):489-96. doi: 10.1016/s1044579x02000913.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
- Patologiske prosesser
- Neoplasmer etter histologisk type
- Neoplasmer
- Neoplasmer etter nettsted
- Neoplasmer, kjertel og epitel
- Faryngeale neoplasmer
- Otorhinolaryngologiske neoplasmer
- Neoplasmer i hode og nakke
- Nasofaryngeale sykdommer
- Faryngeale sykdommer
- Stomatognatiske sykdommer
- Otorhinolaryngologiske sykdommer
- Nasofaryngeale neoplasmer
- Karsinom
- Nasofaryngealt karsinom
- Sykdom
Andre studie-ID-numre
- 2023-FXY-230-NPC
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .