- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT06367049
Test PCR specyficzny dla metylacji do wczesnych badań przesiewowych i wczesnej diagnostyki raka nosogardzieli
Rak nosogardła jest jednym z najczęstszych nowotworów złośliwych w Chinach, wraz z postępem kompleksowego leczenia radiochemicznego we wczesnym stadium. Wskaźnik przeżycia 5-letniego raka nosogardła wynosi ponad 95%. Jednakże ze względu na ukryte umiejscowienie raka nosowo-gardłowego i brak wyraźnych wczesnych objawów klinicznych, ponad 70% z 87 000 nowo diagnozowanych każdego roku przypadków należy do zaawansowanego stadium raka nosowo-gardłowego, a wskaźnik przeżycia 5 lat w przypadku zaawansowanego raka nosowo-gardłowego rak wynosi tylko około 70%. Dlatego wczesne badania przesiewowe, diagnostyka i wczesne leczenie są kluczem do poprawy przeżycia pacjentów z rakiem nosogardzieli. Wybór czułego i dokładnego biomarkera raka nosowo-gardłowego oraz poleganie na prostej i wykonalnej metodzie badawczej do wykrywania raka nosogardzieli znacznie poprawi wskaźnik wczesnej diagnozy raka nosowo-gardłowego.
Metylacja DNA jest formą chemicznej modyfikacji DNA, którą można przeprowadzić bez zmiany zmian sekwencji DNA w ekspresji genetycznej. Główną rolą metylacji DNA jest regulacja ekspresji genów. Geny supresorowe nowotworu pełnią funkcje regulujące różnicowanie, dojrzewanie i programowaną śmierć komórek. Jeśli jednak nastąpi metylacja regionu promotora, ekspresja genów supresorowych nowotworu zostaje zahamowana i funkcja zostaje utracona, w wyniku czego komórki pozostają w fazie niskiego różnicowania i proliferacji, hamują apoptozę, tworzenie naczyń krwionośnych przez komórki klasterowe, utratę adhezja komórek i powstawanie nowotworów. Można zauważyć, że metylacja DNA zachodzi we wczesnym stadium nowotworu, a ta cecha biologiczna sprawia, że jest to silna perspektywa zastosowania we wczesnych badaniach przesiewowych nowotworu.
Istnieje wiele metod wykrywania metylacji DNA, wśród których PCR specyficzna dla metylacji (MSP) pozwala łatwo i szybko określić status metylacji konkretnego genu, spełniając przystępne, wygodne i łatwe do uogólnienia cechy wymagane w testach przesiewowych. W połączeniu z wcześniejszymi eksperymentami MSP i wcześniejszymi raportami odkryliśmy, że poziomy metylacji fragmentów promotorowych genów H4C6, Septin9 i RASSF1A w tkankach raka nosogardła były znacznie wyższe niż w zdrowych ludzkich tkankach nosogardzieli. Sugeruje to, że metylacja tych trzech genów może zostać wykorzystana jako biomarkery do wczesnych badań przesiewowych i diagnostyki raka nosogardzieli.
Dlatego też niniejsze badanie ma na celu wykrycie stanu metylacji genów H4C6, Septin9 i RASSF1A w oparciu o metodę MSP przy prostej obsłudze i niskim koszcie. Wykorzystując diagnostykę kliniczno-patologiczną jako złoty standard, zweryfikowano wartość tego wskaźnika metylacji genu we wczesnych badaniach przesiewowych i wczesnej diagnostyce raka nosogardła, zapewniając nowy wskaźnik wykrywalności i metodę poprawy wskaźnika wczesnej diagnozy raka nosogardzieli.
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
Guangdong
-
Guangzhou, Guangdong, Chiny, 510060
- Sun Yat-sen University Cancer Center
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Grupa przypadków (grupa raka nosowo-gardłowego): rak nosowo-gardłowy potwierdzony histologicznie lub cytologicznie. Grupa kontrolna (grupa z rakiem innym niż nosowo-gardłowa): brak pacjentów z rakiem nosogardzieli.
- Wiek ≥18 lat i ≤70 lat.
- Brak wcześniejszej historii innych nowotworów i brak obecnych nowotworów.
Kryteria wyłączenia:
- Wynik Karnofskiego ≤70 punktów lub wynik Zubroda >2 punkty.
- Występują poważne powikłania medyczne, dysfunkcja ważnych narządów (serce, płuca, wątroba, nerki) czy zaburzenia neuropsychiatryczne.
- Inni pacjenci lub ochotnicy uznani przez lekarza prowadzącego za niekwalifikujących się do włączenia do badania.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Grupa pacjentów
Pobieranie wymazów z nosogardła i krwi obwodowej.
|
PCR specyficzny dla metylacji jest najprostszą i najszybszą metodą jakościowego wykrywania stanu metylacji. Niemetylowaną zasadę C przekształca się w U poprzez konwersję wodorosiarczynem, którą następnie amplifikuje się metodą PCR ze starterami (starterami specyficznymi dla metylacji i nieswoistymi dla metylacji), a następnie wykrywa za pomocą elektroforezy w żelu agarozowym lub sondą. Kluczem do MSP jest zaprojektowanie starterów PCR dla określonych regionów genów. Zespół badawczy uczestniczący w tym projekcie odkrył już miejsca sekwencji metylacji genów H4C6, Septin9 i RASSF1A w tkankach raka nosogardzieli poprzez sekwencjonowanie metylacji i zaprojektował odpowiednio specyficzne startery i sondy do amplifikacji MSP, które mogą łatwo i szybko przeprowadzić detekcję metylacji. |
|
Grupa niebędąca pacjentem
Pobieranie wymazów z nosogardła i krwi obwodowej.
|
PCR specyficzny dla metylacji jest najprostszą i najszybszą metodą jakościowego wykrywania stanu metylacji. Niemetylowaną zasadę C przekształca się w U poprzez konwersję wodorosiarczynem, którą następnie amplifikuje się metodą PCR ze starterami (starterami specyficznymi dla metylacji i nieswoistymi dla metylacji), a następnie wykrywa za pomocą elektroforezy w żelu agarozowym lub sondą. Kluczem do MSP jest zaprojektowanie starterów PCR dla określonych regionów genów. Zespół badawczy uczestniczący w tym projekcie odkrył już miejsca sekwencji metylacji genów H4C6, Septin9 i RASSF1A w tkankach raka nosogardzieli poprzez sekwencjonowanie metylacji i zaprojektował odpowiednio specyficzne startery i sondy do amplifikacji MSP, które mogą łatwo i szybko przeprowadzić detekcję metylacji. |
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Wrażliwość
Ramy czasowe: do ukończenia studiów, średnio 1 rok
|
Odsetek pacjentów z rozpoznaniem patologicznym raka nosogardzieli z dodatnim wskaźnikiem metylacji.
|
do ukończenia studiów, średnio 1 rok
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Specyficzność
Ramy czasowe: do ukończenia studiów, średnio 1 rok
|
Odsetek pacjentów z rakiem innym niż nosowo-gardłowy z ujemnym wskaźnikiem metylacji.
|
do ukończenia studiów, średnio 1 rok
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Yi-Jun Hua, Phd, Sun Yat-sen University
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Chan KCA, Woo JKS, King A, Zee BCY, Lam WKJ, Chan SL, Chu SWI, Mak C, Tse IOL, Leung SYM, Chan G, Hui EP, Ma BBY, Chiu RWK, Leung SF, van Hasselt AC, Chan ATC, Lo YMD. Analysis of Plasma Epstein-Barr Virus DNA to Screen for Nasopharyngeal Cancer. N Engl J Med. 2017 Aug 10;377(6):513-522. doi: 10.1056/NEJMoa1701717. Erratum In: N Engl J Med. 2018 Mar 8;378(10 ):973.
- Zhang MX, Li J, Shen GP, Zou X, Xu JJ, Jiang R, You R, Hua YJ, Sun Y, Ma J, Hong MH, Chen MY. Intensity-modulated radiotherapy prolongs the survival of patients with nasopharyngeal carcinoma compared with conventional two-dimensional radiotherapy: A 10-year experience with a large cohort and long follow-up. Eur J Cancer. 2015 Nov;51(17):2587-95. doi: 10.1016/j.ejca.2015.08.006. Epub 2015 Aug 26.
- Zeng Y, Zhang LG, Wu YC, Huang YS, Huang NQ, Li JY, Wang YB, Jiang MK, Fang Z, Meng NN. Prospective studies on nasopharyngeal carcinoma in Epstein-Barr virus IgA/VCA antibody-positive persons in Wuzhou City, China. Int J Cancer. 1985 Nov 15;36(5):545-7. doi: 10.1002/ijc.2910360505.
- Ji MF, Sheng W, Cheng WM, Ng MH, Wu BH, Yu X, Wei KR, Li FG, Lian SF, Wang PP, Quan W, Deng L, Li XH, Liu XD, Xie YL, Huang SJ, Ge SX, Huang SL, Liang XJ, He SM, Huang HW, Xia SL, Ng PS, Chen HL, Xie SH, Liu Q, Hong MH, Ma J, Yuan Y, Xia NS, Zhang J, Cao SM. Incidence and mortality of nasopharyngeal carcinoma: interim analysis of a cluster randomized controlled screening trial (PRO-NPC-001) in southern China. Ann Oncol. 2019 Oct 1;30(10):1630-1637. doi: 10.1093/annonc/mdz231.
- Karimi M, Johansson S, Stach D, Corcoran M, Grander D, Schalling M, Bakalkin G, Lyko F, Larsson C, Ekstrom TJ. LUMA (LUminometric Methylation Assay)--a high throughput method to the analysis of genomic DNA methylation. Exp Cell Res. 2006 Jul 1;312(11):1989-95. doi: 10.1016/j.yexcr.2006.03.006. Epub 2006 Apr 19.
- Lyu JY, Chen JY, Zhang XJ, Zhang MW, Yu GS, Zhang L, Wen Z. Septin 9 Methylation in Nasopharyngeal Swabs: A Potential Minimally Invasive Biomarker for the Early Detection of Nasopharyngeal Carcinoma. Dis Markers. 2020 May 5;2020:7253531. doi: 10.1155/2020/7253531. eCollection 2020.
- Chang HW, Chan A, Kwong DL, Wei WI, Sham JS, Yuen AP. Evaluation of hypermethylated tumor suppressor genes as tumor markers in mouth and throat rinsing fluid, nasopharyngeal swab and peripheral blood of nasopharygeal carcinoma patient. Int J Cancer. 2003 Jul 20;105(6):851-5. doi: 10.1002/ijc.11162. Erratum In: Int J Cancer. 2003 Oct 10;106(6):984.
- Wong TS, Kwong DL, Sham JS, Wei WI, Kwong YL, Yuen AP. Quantitative plasma hypermethylated DNA markers of undifferentiated nasopharyngeal carcinoma. Clin Cancer Res. 2004 Apr 1;10(7):2401-6. doi: 10.1158/1078-0432.ccr-03-0139.
- Hutajulu SH, Indrasari SR, Indrawati LP, Harijadi A, Duin S, Haryana SM, Steenbergen RD, Greijer AE, Middeldorp JM. Epigenetic markers for early detection of nasopharyngeal carcinoma in a high risk population. Mol Cancer. 2011 May 2;10:48. doi: 10.1186/1476-4598-10-48.
- Ye M, Huang T, Ni C, Yang P, Chen S. Diagnostic Capacity of RASSF1A Promoter Methylation as a Biomarker in Tissue, Brushing, and Blood Samples of Nasopharyngeal Carcinoma. EBioMedicine. 2017 Apr;18:32-40. doi: 10.1016/j.ebiom.2017.03.038. Epub 2017 Apr 2.
- Li Y, Yang X, Du X, Lei Y, He Q, Hong X, Tang X, Wen X, Zhang P, Sun Y, Zhang J, Wang Y, Ma J, Liu N. RAB37 Hypermethylation Regulates Metastasis and Resistance to Docetaxel-Based Induction Chemotherapy in Nasopharyngeal Carcinoma. Clin Cancer Res. 2018 Dec 15;24(24):6495-6508. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-0532. Epub 2018 Aug 21. Erratum In: Clin Cancer Res. 2022 Jan 15;28(2):430.
- Shi F, Zhou M, Shang L, Du Q, Li Y, Xie L, Liu X, Tang M, Luo X, Fan J, Zhou J, Gao Q, Qiu S, Wu W, Zhang X, Bode AM, Cao Y. EBV(LMP1)-induced metabolic reprogramming inhibits necroptosis through the hypermethylation of the RIP3 promoter. Theranostics. 2019 Apr 13;9(9):2424-2438. doi: 10.7150/thno.30941. eCollection 2019.
- Zhao Y, Hong XH, Li K, Li YQ, Li YQ, He SW, Zhang PP, Li JY, Li Q, Liang YL, Chen Y, Ma J, Liu N, Chen YP. ZNF582 hypermethylation promotes metastasis of nasopharyngeal carcinoma by regulating the transcription of adhesion molecules Nectin-3 and NRXN3. Cancer Commun (Lond). 2020 Dec;40(12):721-737. doi: 10.1002/cac2.12104. Epub 2020 Oct 10. Erratum In: Cancer Commun (Lond). 2022 Mar;42(3):281-283.
- Chen Y, Zhao Y, Yang X, Ren X, Huang S, Gong S, Tan X, Li J, He S, Li Y, Hong X, Li Q, Ding C, Fang X, Ma J, Liu N. USP44 regulates irradiation-induced DNA double-strand break repair and suppresses tumorigenesis in nasopharyngeal carcinoma. Nat Commun. 2022 Jan 25;13(1):501. doi: 10.1038/s41467-022-28158-2.
- Papanicolau-Sengos A, Aldape K. DNA Methylation Profiling: An Emerging Paradigm for Cancer Diagnosis. Annu Rev Pathol. 2022 Jan 24;17:295-321. doi: 10.1146/annurev-pathol-042220-022304. Epub 2021 Nov 4.
- Roy D, Tiirikainen M. Diagnostic Power of DNA Methylation Classifiers for Early Detection of Cancer. Trends Cancer. 2020 Feb;6(2):78-81. doi: 10.1016/j.trecan.2019.12.006. Epub 2020 Feb 3.
- Widschwendter M, Zikan M, Wahl B, Lempiainen H, Paprotka T, Evans I, Jones A, Ghazali S, Reisel D, Eichner J, Rujan T, Yang Z, Teschendorff AE, Ryan A, Cibula D, Menon U, Wittenberger T. The potential of circulating tumor DNA methylation analysis for the early detection and management of ovarian cancer. Genome Med. 2017 Dec 22;9(1):116. doi: 10.1186/s13073-017-0500-7.
- Sung CK, Yim H. CRISPR-mediated promoter de/methylation technologies for gene regulation. Arch Pharm Res. 2020 Jul;43(7):705-713. doi: 10.1007/s12272-020-01257-8. Epub 2020 Jul 28.
- Mattei AL, Bailly N, Meissner A. DNA methylation: a historical perspective. Trends Genet. 2022 Jul;38(7):676-707. doi: 10.1016/j.tig.2022.03.010. Epub 2022 Apr 30.
- Liu YP, Lv X, Zou X, Hua YJ, You R, Yang Q, Xia L, Guo SY, Hu W, Zhang MX, Chen SY, Lin M, Xie YL, Liu LZ, Sun R, Huang PY, Fan W, Guo X, Hong MH, Chen MY. Minimally invasive surgery alone compared with intensity-modulated radiotherapy for primary stage I nasopharyngeal carcinoma. Cancer Commun (Lond). 2019 Nov 15;39(1):75. doi: 10.1186/s40880-019-0415-3.
- Chan KC, Lo YM. Circulating EBV DNA as a tumor marker for nasopharyngeal carcinoma. Semin Cancer Biol. 2002 Dec;12(6):489-96. doi: 10.1016/s1044579x02000913.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
- Procesy patologiczne
- Nowotwory według typu histologicznego
- Nowotwory
- Nowotwory według lokalizacji
- Nowotwory gruczołowe i nabłonkowe
- Nowotwory gardła
- Nowotwory otorynolaryngologiczne
- Nowotwory głowy i szyi
- Choroby jamy nosowo-gardłowej
- Choroby gardła
- Choroby Stomatognatyczne
- Choroby otorynolaryngologiczne
- Nowotwory jamy nosowo-gardłowej
- Rak
- Rak jamy nosowo-gardłowej
- Choroba
Inne numery identyfikacyjne badania
- 2023-FXY-230-NPC
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .