Dešifrování genetické architektury autoimunitních chorob

SHRNUTÍ:

Cílem tohoto návrhu je prozkoumat genomické původy heterogenity jak u rizika, tak v specifickém fenotypu autoimunitních onemocnění, se zvláštním důrazem na porozumění a řešení zdravotních rozdílů těchto onemocnění. Autoimunitní onemocnění, zejména systémové lupus erythematosus (SLE), se projevují v dřívějším věku a mají horší klinické výsledky u jedinců evropského původu. Podobně imunologické genetické varianty vykazují diferenciální vývoj založený na geografickém patogenním tlaku; Téměř 13 procent lokusů pro SLE, bez nich zahrnuje lidské leukocytové antigeny (HLA), vykazují známky přirozeného výběru. Proto je pro porozumění těmto pozorováním zásadní zkoumání genomiky autoimunity globálně a v neevropských populacích.

Prevalence autoimunitních onemocnění v Peru je obtížné odhadnout, protože diagnózy vyžadují sérologie, které nejsou přístupné, ale odhaduje se, že v zemi existuje velká část nediagnostikovaných nebo neošetřených případů. Některé studie provedené v Latinské Americe a Spojených státech uvádějí, že populace mestizo představuje SLE v dřívějším věku, s více systémovým zapojením než evropské populace. Je nutné si uvědomit, že v genomických studiích prováděných v oblasti autoimunitních onemocnění existuje významná mezera, která odhaluje vážné nedostatečné zastoupení v domorodých populacích Severní a Jižní Ameriky. V reakci na tuto kritickou potřebu bylo mezi lékaři zřízeno spolupráce v různých oblastech Peru a Latinské Ameriky, aby studovala genomickou architekturu autoimunity u domorodých obyvatel v Jižní Americe, provádějící špičkové genomické studie v této nedostatečně zkoušené a vysoce rizikové populaci a hodnocení populační genetické varianty, které mohou přispět k identifikaci příčinných genů. včetně kódování nebo strukturálních změn. Navrhujeme provést nejmodernější genomické studie v populacích z různých oblastí Peru (Amazon, Andes, Coast), aby popsala genomickou architekturu v této dříve neustavené populaci.

Obecný cíl:

Obecným cílem tohoto projektu je použít genomické strategie k vyhodnocení molekulárního základu lidských autoimunitních onemocnění, reprezentativní peruánské populace. Diverzifikace v genomických studiích je nezbytná k dosažení personalizované medicíny a spolupráce s vedoucími komunit a místní vědci zajistí účast komunity a individuální zapojení, jakož i školení a vzdělávání.

Konkrétní cíle:

Specifický cíl 1: identifikovat genetické markery spojené s genetickým rizikem autoimunitních onemocnění v domorodé populaci Peru.

Specifický cíl 2: Vyhodnotit integrativní multiomiku (genomika, epigenomika a expozice) environmentálního kontextu spojeného s autoimunitou v Peru.

Specifický cíl 3: Charakterizovat mikrobiom u pacientů s autoimunitou v Peru.

Primární koncový bod:

Úspěšné náborové a celé genomové sekvenování nejméně 20 multiplexních rodin s vysokou familiární autoimunitní zátěží, což umožňuje identifikaci a předběžnou anotaci vzácných nebo nových genetických variant potenciálně spojených s autoimunitní náchylností onemocnění.