De genetische architectuur van auto -immuunziekten ontcijferen

SAMENVATTING:

Het doel van dit voorstel is het onderzoeken van de genomische oorsprong van heterogeniteit in zowel risico als specifiek fenotype van auto -immuunziekten, met een bijzondere nadruk op het begrijpen en aanpakken van de gezondheidsverschillen van deze ziekten. Auto-immuunziekten, met name systemische lupus erythematosus (SLE), manifesteren op een eerdere leeftijd en hebben slechtere klinische resultaten bij personen van niet-Europese afkomst. Evenzo vertonen immunologische genetische varianten een differentiële evolutie op basis van geografische pathogene druk; Bijna 13 procent van de loci voor SLE, exclusief menselijke leukocytenantigenen (HLA), vertoont tekenen van natuurlijke selectie. Daarom is het onderzoeken van de genomica van auto-immuniteit wereldwijd en in niet-Europese populaties cruciaal om deze waarnemingen te begrijpen.

De prevalentie van auto -immuunziekten in Peru is moeilijk te schatten, omdat diagnoses serologieën vereisen die niet toegankelijk zijn, maar wordt geschat dat er een groot deel van niet -gediagnosticeerde of onbehandelde gevallen in het land is. Sommige studies uitgevoerd in Latijns -Amerika en de Verenigde Staten melden dat de Mestizo -bevolking SLE op eerdere leeftijd presenteert, met meer systemische betrokkenheid dan Europese populaties. Het is noodzakelijk om te erkennen dat er een significante kloof is in genomische studies die zijn uitgevoerd op het gebied van auto -immuunziekten, wat een ernstige ondervertegenwoordiging onthult in de inheemse populaties van Noord- en Zuid -Amerika. In response to this critical need, collaborations have been established between physicians in different areas of Peru and Latin America to study the genomic architecture of autoimmunity in indigenous people in South America, carrying out cutting-edge genomic studies in this under-explored and high-risk population and evaluating population-specific genetic variants that may contribute to the identification of causal genes. inclusief codering of structurele veranderingen. We stellen voor om geavanceerde genomische studies uit te voeren in populaties uit verschillende gebieden van Peru (Amazon, Andes, Coast) om de genomische architectuur in deze eerder niet-onderzochte bevolking te beschrijven.

Algemene doelstelling:

Het algemene doel van dit project is om genomische strategieën te gebruiken om de moleculaire basis van menselijke auto -immuunziekten te evalueren, representatief voor Peruaanse populaties. Diversificatie in genomische studies is noodzakelijk om gepersonaliseerde geneeskunde te bereiken en samenwerking met gemeenschapsleiders en lokale onderzoekers zal zorgen voor gemeenschapsparticipatie en individuele betrokkenheid, evenals opleidings- en opleidingsactiviteiten.

Specifieke doelstellingen:

Specifieke doelstelling 1: om genetische markers te identificeren die geassocieerd zijn met het genetische risico op auto -immuunziekten bij de inheemse populatie van Peru.

Specifiek doel 2: om de integratieve multiomics (genomics, epigenomics en exposome) te evalueren van de omgevingscontext geassocieerd met auto -immuniteit in Peru.

Specifiek doel 3: het microbioom karakteriseren bij patiënten met auto -immuniteit in Peru.

Primair eindpunt:

Succesvolle werving en hele genoomsequencing van ten minste 20 multiplexfamilies met een hoge familiale auto-immuniteitslast, waardoor identificatie en voorlopige annotatie van zeldzame of nieuwe genetische varianten mogelijk gekoppeld is aan de gevoeligheid voor auto-immuunziekten.