Rozszyfrowanie architektury genetycznej chorób autoimmunologicznych

STRESZCZENIE:

Celem tej propozycji jest zbadanie genomowego pochodzenia heterogeniczności zarówno w ryzyku, jak i specyficznym fenotypie chorób autoimmunologicznych, ze szczególnym naciskiem na zrozumienie i rozwiązanie rozbieżności zdrowotnych tych chorób. Choroby autoimmunologiczne, zwłaszcza toczeń rumieniowatego (SLE), objawiają się w wcześniejszym wieku i mają gorsze wyniki kliniczne u osób nieeuropejskich przodków. Podobnie, immunologiczne warianty genetyczne wykazują różnicową ewolucję oparte na geograficznym ciśnieniu patogennym; Prawie 13 procent loci dla SLE, nie uwzględniając ludzkich antygenów leukocytów (HLA), wykazuje oznaki doboru naturalnego. Dlatego badanie genomiki autoimmunizacji na całym świecie i w populacjach nieeuropejskich ma kluczowe znaczenie dla zrozumienia tych obserwacji.

Częstość występowania chorób autoimmunologicznych w Peru jest trudna do oszacowania, ponieważ diagnozy wymagają serologii, które są niedostępne, ale szacuje się, że istnieje duży odsetek przypadków nierozpoznanych lub nietraktowanych w kraju. Niektóre badania przeprowadzone w Ameryce Łacińskiej i Stanach Zjednoczonych podają, że populacja Mestizo przedstawia SLE w wcześniejszym wieku, z większym zaangażowaniem systemowym niż populacje europejskie. Konieczne jest uznanie, że istnieje znaczna luka w badaniach genomowych przeprowadzonych w dziedzinie chorób autoimmunologicznych, ujawniając poważną niedostateczną reprezentację w rdzennych populacjach Ameryki Północnej i Południowej. W odpowiedzi na tę krytyczną potrzebę ustanowiono współpracę między lekarzami w różnych obszarach Peru i Ameryki Łacińskiej w celu zbadania architektury genomowej autoimmunizacji u rdzennych mieszkańców Ameryki Południowej, przeprowadzając najnowocześniejsze badania genomowe w tej niedostatecznie rozpoznawanej i wysokiego ryzyka populacji populacji i oceniając populację specyficzne dla populacji warianty genetyczne. w tym kodowanie lub zmiany strukturalne. Proponujemy przeprowadzenie najnowocześniejszych badań genomowych w populacjach z różnych obszarów Peru (Amazon, Andes, Coast) w celu opisania architektury genomowej w tej wcześniej niekorzystnej populacji.

Ogólny cel:

Ogólnym celem tego projektu jest zastosowanie strategii genomowych w celu oceny molekularnych podstaw ludzkich chorób autoimmunologicznych, reprezentatywnego dla peruwiańskich populacji. Dywersyfikacja w badaniach genomowych jest niezbędna do osiągnięcia spersonalizowanej medycyny i współpracy z liderami społeczności i lokalnymi badaczami zapewni udział społeczności i indywidualne zaangażowanie, a także zajęcia szkoleniowe i edukacyjne.

Konkretne cele:

Specyficzny cel 1: Identyfikacja markerów genetycznych związanych z ryzykiem genetycznym chorób autoimmunologicznych w ludności tubylczej Peru.

Specyficzny cel 2: Ocena integracyjnej multiomiki (genomika, epigenomika i ekspozycja) kontekstu środowiskowego związanego z autoimmunizacją w Peru.

Specyficzny cel 3: Charakteryzowanie mikrobiomu u pacjentów z autoimmunizacją w Peru.

Główny punkt końcowy:

Udana rekrutacja i sekwencjonowanie całego genomu co najmniej 20 rodzin multipleksowych z wysokim rodzinnym obciążeniem autoimmunizmu, umożliwiając identyfikację i wstępną adnotację rzadkich lub nowych wariantów genetycznych potencjalnie związanych z podatnością na choroby autoimmunologiczne.