Dechiffrere den genetiske arkitekturen av autoimmune sykdommer

SAMMENDRAG:

Målet med dette forslaget er å undersøke den genomiske opprinnelsen til heterogenitet i både risiko og spesifikk fenotype av autoimmune sykdommer, med en spesiell vekt på å forstå og adressere helsemessige forskjeller for disse sykdommene. Autoimmune sykdommer, spesielt systemisk lupus erythematosus (SLE), manifesterer seg i en tidligere alder og har verre kliniske utfall hos individer av ikke-europeisk aner. På samme måte viser immunologiske genetiske varianter en differensiell evolusjon basert på geografisk patogent trykk; Nesten 13 prosent av loci for SLE, ikke inkludert humane leukocyttantigener (HLA), viser tegn til naturlig seleksjon. Derfor er det avgjørende for å forstå disse observasjonene.

Utbredelsen av autoimmune sykdommer i Peru er vanskelig å estimere, siden diagnoser krever serologier som ikke er tilgjengelige, men det anslås at det er en stor andel udiagnostiserte eller ubehandlede tilfeller i landet. Noen studier utført i Latin -Amerika og USA rapporterer at Mestizo -befolkningen presenterer SLE i en tidligere alder, med mer systemisk involvering enn europeiske populasjoner. Det er nødvendig å erkjenne at det er et betydelig gap i genomiske studier utført innen autoimmune sykdommer, og avslører en alvorlig underrepresentasjon i urbefolkningen i Nord- og Sør -Amerika. Som svar på dette kritiske behovet er det etablert samarbeid mellom leger i forskjellige områder i Peru og Latin-Amerika for å studere den genomiske arkitekturen av autoimmunitet hos urfolk i Sør-Amerika, og utførte nyskapende genomiske studier i denne underutforskede og høye risikopopulasjonen og evaluering av populasjonsspesifikk genetisk varianter som kan trives til den høyrisiko-populasjonen og evaluering av populasjonsspesifikke genetiske varianter som kan ha kontakt og høyrisiko populasjon og evaluerende populasjonsspesifikk genetisk genetisk varianter som kan utskelige og høy risikopopulasjon og evaluerende populasjonsspesifikk genomiske studier i denne underutforskningen og høyrisikopopulasjonen og evaluerende populasjonen. inkludert koding eller strukturelle endringer. Vi foreslår å utføre topp moderne genomiske studier i populasjoner fra forskjellige områder av Peru (Amazon, Andes, Coast) for å beskrive den genomiske arkitekturen i denne tidligere ustudierte befolkningen.

Generelt mål:

Det generelle målet med dette prosjektet er å bruke genomiske strategier for å evaluere det molekylære grunnlaget for menneskelige autoimmune sykdommer, representative for peruanske populasjoner. Diversifisering i genomiske studier er nødvendig for å nå personlig medisin og samarbeid med samfunnsledere og lokale forskere vil sikre samfunnsdeltakelse og individuelt engasjement, samt opplærings- og utdanningsaktiviteter.

Spesifikke mål:

Spesielt mål 1: Å identifisere genetiske markører assosiert med genetisk risiko for autoimmune sykdommer i den urfolk i Peru.

Spesielt mål 2: Å evaluere integrerende multiomikk (genomikk, epigenomikk og eksponering) i miljøkonteksten assosiert med autoimmunitet i Peru.

Spesielt mål 3: Å karakterisere mikrobiomet hos pasienter med autoimmunitet i Peru.

Primært endepunkt:

Vellykket rekruttering og hel-genom-sekvensering av minst 20 multiplexfamilier med høy familiær autoimmunitetsbyrde, noe som muliggjør identifikasjon og foreløpig merknad av sjeldne eller nye genetiske varianter potensielt knyttet til mottakelighet av autoimmun sykdom.