Decifrar a arquitetura genética de doenças autoimunes

RESUMO:

O objetivo desta proposta é investigar as origens genômicas da heterogeneidade em risco e fenótipo específico de doenças autoimunes, com uma ênfase particular na compreensão e abordagem das disparidades de saúde dessas doenças. As doenças auto-imunes, especialmente o lúpus eritematoso sistêmico (LES), manifestam em uma idade anterior e têm piores resultados clínicos em indivíduos de ancestralidade não europeia. Da mesma forma, variantes genéticas imunológicas mostram uma evolução diferencial baseada na pressão patogênica geográfica; Quase 13 % dos locos do LES, não incluindo antígenos leucócitos humanos (HLA), mostram sinais de seleção natural. Portanto, investigar a genômica da autoimunidade globalmente e em populações não européias é crucial para entender essas observações.

A prevalência de doenças autoimunes no Peru é difícil de estimar, uma vez que os diagnósticos requerem sorologias que não são acessíveis, mas estima -se que exista uma grande proporção de casos não diagnosticados ou não tratados no país. Alguns estudos realizados na América Latina e nos Estados Unidos relatam que a população de mestiços apresenta LES em uma idade anterior, com mais envolvimento sistêmico do que as populações européias. É necessário reconhecer que há uma lacuna significativa nos estudos genômicos realizados no campo de doenças autoimunes, revelando uma sub -representação grave nas populações indígenas da América do Norte e do Sul. Em resposta a essa necessidade crítica, foram estabelecidas colaborações entre médicos em diferentes áreas do Peru e da América Latina para estudar a arquitetura genômica da autoimunidade em povos indígenas na América do Sul, realizando estudos genômicos de ponta nessa população subexplorada e de alto risco e avaliando as variantes genéticas geneticas que podem ser contribuintes para a população genética de alto risco à população. incluindo alterações de codificação ou estruturais. Propomos realizar estudos genômicos de última geração em populações de diferentes áreas do Peru (Amazon, Andes, Coast) para descrever a arquitetura genômica nessa população anteriormente não estudada.

Objetivo Geral:

O objetivo geral deste projeto é usar estratégias genômicas para avaliar a base molecular de doenças autoimunes humanas, representativas das populações peruanas. A diversificação em estudos genômicos é necessária para alcançar a medicina personalizada e a colaboração com líderes comunitários e pesquisadores locais garantirão a participação da comunidade e o envolvimento individual, além de atividades de treinamento e educação.

Objetivos específicos:

Objetivo específico 1: identificar marcadores genéticos associados ao risco genético de doenças autoimunes na população indígena do Peru.

Objetivo específico 2: Avaliar a multiômica integrativa (genômica, epigenômica e exposome) do contexto ambiental associado à autoimunidade no Peru.

Objetivo específico 3: caracterizar o microbioma em pacientes com autoimunidade no Peru.

Endpoint primário:

O recrutamento bem-sucedido e o sequenciamento de todo o genoma de pelo menos 20 famílias multiplex com alta carga familiar de autoimunidade, permitindo a identificação e a anotação preliminar de variantes genéticas raras ou novas potencialmente ligadas à suscetibilidade de doenças autoimunes.