Autoimmuunisairauksien geneettisen arkkitehtuurin purkaminen

YHTEENVETO:

Tämän ehdotuksen tavoitteena on tutkia heterogeenisyyden genomista alkuperää sekä autoimmuunisairauksien riski- että erityisfenotyyppiä painottaen erityistä näiden sairauksien terveyserojen ymmärtämistä ja käsittelemistä. Autoimmuunisairaudet, erityisesti systeeminen lupus erythematosus (SLE), ilmenevät aikaisemmassa iässä ja niillä on huonommat kliiniset tulokset ei-eurooppalaisten esi-isien yksilöissä. Samoin immunologiset geneettiset variantit osoittavat differentiaalisen evoluution, joka perustuu maantieteelliseen patogeeniseen paineeseen; Lähes 13 prosenttia SLE: n lokuksista, lukuun ottamatta ihmisen leukosyytti -antigeenejä (HLA), on merkkejä luonnollisesta valinnasta. Siksi autoimmuniteetin genomiikan tutkiminen maailmanlaajuisesti ja ei-eurooppalaisissa populaatioissa on ratkaisevan tärkeää näiden havaintojen ymmärtämiseksi.

Autoimmuunisairauksien esiintyvyyttä Perussa on vaikea arvioida, koska diagnoosit vaativat serologioita, joihin ei voida käyttää, mutta arvioidaan, että maassa on suuri osa diagnosoimattomista tai käsittelemättömistä tapauksista. Jotkut Latinalaisessa Amerikassa ja Yhdysvalloissa tehdyt tutkimukset kertovat, että mestizo -väestö esittelee SLE: tä aikaisemmassa iässä, ja systeemisempi osallistuminen kuin Euroopan väestöryhmillä. On tarpeen tunnustaa, että autoimmuunisairauksien alalla tehdyssä genomisissa tutkimuksissa on merkittävä aukko, mikä paljastaa vakavan aliedustuksen Pohjois -ja Etelä -Amerikan alkuperäiskansoissa. Vastauksena tähän kriittiseen tarpeeseen on perustettu yhteistyötä Perun ja Latinalaisen Amerikan eri alueilla tutkitaan Etelä-Amerikan alkuperäiskansojen autoimmuniteetin genomista arkkitehtuuria, suorittamalla huippuluokan genomisia tutkimuksia tässä aliarvioituissa ja korkean riskin populaatiossa ja arvioitaessa väestökohtaisia ​​geneettisiä variantteja, jotka voivat myötävaikuttaa syy-geneiden tunnistamiseen. mukaan lukien koodaus tai rakenteelliset muutokset. Ehdotamme suorittaa huipputekniset genomiset tutkimukset populaatioissa Perun eri alueilta (Amazon, And, rannikko) kuvaamaan genomista arkkitehtuuria tässä aiemmin tutkittavassa populaatiossa.

Yleinen tavoite:

Tämän hankkeen yleisen tavoitteena on käyttää genomisia strategioita arvioimaan ihmisen autoimmuunisairauksien molekyylipohjaa, joka edustaa Perun väestöä. Genomisten tutkimusten monipuolistaminen on välttämätöntä henkilökohtaisen lääketieteen saavuttamiseksi, ja yhteistyö yhteisöjohtajien ja paikallisten tutkijoiden kanssa varmistaa yhteisön osallistumisen ja henkilökohtaisen sitoutumisen sekä koulutus- ja koulutustoimet.

Erityiset tavoitteet:

Erityinen tavoite 1: Tunnistaa geneettiset markkerit, jotka liittyvät autoimmuunisairauksien geneettiseen riskiin Perun alkuperäiskansojen populaatiossa.

Erityinen tavoite 2: Arvioida ympäristöympäristön integroiva multomiikka (genomiikka, epigenomiikka ja exposomi), joka liittyy Perun autoimmuniteettiin.

Erityinen tavoite 3: Mikrobiomin karakterisointi potilailla, joilla on autoimmuniteetti Perussa.

Ensisijainen päätepiste:

Ainakin 20 multipleksiperheen onnistunut rekrytointi ja koko genomin sekvensointi, jolla on korkea perheen autoimmuniteettitaakka, mahdollistaen harvinaisten tai uusien geneettisten varianttien tunnistamisen ja alustavan merkintöjen, jotka ovat mahdollisesti yhteydessä autoimmuunisairauksien alttiuteen.