Расшифровка генетической архитектуры аутоиммунных заболеваний

КРАТКОЕ СОДЕРЖАНИЕ:

Цель этого предложения состоит в том, чтобы исследовать геномное происхождение гетерогенности как при риске, так и в специфическом фенотипе аутоиммунных заболеваний, с особым акцентом на понимание и устранение различий в здоровье этих заболеваний. Аутоиммунные заболевания, особенно системная волчанка эритематозу (SLE), проявляются в более раннем возрасте и имеют худшие клинические результаты у людей невропейского происхождения. Аналогично, иммунологические генетические варианты показывают дифференциальную эволюцию, основанную на географическом патогенном давлении; Почти 13 процентов локусов для СКВ, не считая антигенов лейкоцитов человека (HLA), показывают признаки естественного отбора. Следовательно, исследование геномики аутоиммунитета во всем мире и в невропейских популяциях имеет решающее значение для понимания этих наблюдений.

Распространенность аутоиммунных заболеваний в Перу трудно оценить, поскольку диагностики требуют серологии, которые недоступны, но, по оценкам, в стране существует большая доля недиагностированных или необработанных случаев. В некоторых исследованиях, проведенных в Латинской Америке, и в Соединенных Штатах сообщается, что население Местизо представляет SLE в более раннем возрасте, с большим системным участием, чем европейское население. Необходимо признать, что существует значительный пробел в геномных исследованиях, проведенных в области аутоиммунных заболеваний, что выявляет серьезное недопредставление в популяциях коренных народов Северной и Южной Америки. В ответ на эту критическую потребность была установлена ​​сотрудничество между врачами в различных областях Перу и Латинской Америки для изучения геномной архитектуры аутоиммунитета у коренных народов в Южной Америке, проводя передовые геномные исследования в этом недостаточном эксплуатации и высоком риске популяции и оценивая специфичные для популяции геновые варианты, которые могут вносить вклад в идентификацию в результате причальных генера. включая кодирование или структурные изменения. Мы предлагаем провести современные геномные исследования в популяциях из разных областей Перу (Amazon, Andes, Coast), чтобы описать геномную архитектуру в этой ранее некверной популяции.

Общая цель:

Общая цель этого проекта состоит в том, чтобы использовать геномные стратегии для оценки молекулярной основы аутоиммунных заболеваний человека, представителя перуанских популяций. Диверсификация в геномных исследованиях необходима для достижения персонализированной медицины, и сотрудничество с лидерами сообщества и местными исследователями обеспечит участие в сообществе и индивидуальное участие, а также обучение и обучение.

Конкретные цели:

Специфическая цель 1: для выявления генетических маркеров, связанных с генетическим риском аутоиммунных заболеваний в коренной популяции Перу.

Конкретная цель 2: Оценить интегративную мультиомику (геномика, эпигеномика и экспозиция) экологического контекста, связанного с аутоиммунитетом в Перу.

Специальная цель 3: характеризовать микробиом у пациентов с аутоиммунитетом в Перу.

Первичная конечная точка:

Успешное рекрутирование и секвенирование всего генома не менее 20 мультиплексных семей с высоким семейным бременем аутоиммунитета, обеспечивая идентификацию и предварительную аннотацию редких или новых генетических вариантов, потенциально связанных с аутоиммунной восприимчивостью к заболеваниям.