Decifrare l'architettura genetica delle malattie autoimmuni

RIEPILOGO:

L'obiettivo di questa proposta è di studiare le origini genomiche dell'eterogeneità sia nel rischio che nel fenotipo specifico delle malattie autoimmuni, con una particolare enfasi sulla comprensione e sull'affrontare le disparità di salute di queste malattie. Le malattie autoimmuni, in particolare il lupus eritematoso sistemico (SLE), si manifestano in età precedente e hanno risultati clinici peggiori in individui di origini non europee. Allo stesso modo, le varianti genetiche immunologiche mostrano un'evoluzione differenziale basata sulla pressione patogena geografica; Quasi il 13 percento dei loci per la LES, esclusi gli antigeni dei leucociti umani (HLA), mostrano segni di selezione naturale. Pertanto, studiare la genomica dell'autoimmunità a livello globale e nelle popolazioni non europee è fondamentale per comprendere queste osservazioni.

La prevalenza di malattie autoimmuni in Perù è difficile da stimare, poiché le diagnosi richiedono sierologie che non sono accessibili, ma si stima che vi sia una grande percentuale di casi non diagnosticati o non trattati nel paese. Alcuni studi condotti in America Latina e negli Stati Uniti riferiscono che la popolazione di meticci presenta SLE in età precedente, con un coinvolgimento più sistemico rispetto alle popolazioni europee. È necessario riconoscere che esiste un divario significativo negli studi genomici condotti nel campo delle malattie autoimmuni, rivelando una grave sottorappresentazione nelle popolazioni indigene del Nord e del Sud America. In risposta a questa necessità critica, sono state stabilite collaborazioni tra medici in diverse aree del Perù e dell'America Latina per studiare l'architettura genomica dell'autoimmunità negli indigeni in Sud America, conducendo studi genomici all'avanguardia in questa popolazione non esplorata e ad alto rischio e valutando le varianti genetiche specifiche della popolazione che possono contribuire all'identificazione dei geni causici. tra cui codifica o cambiamenti strutturali. Proponiamo di condurre studi genomici all'avanguardia in popolazioni provenienti da diverse aree del Perù (Amazon, Ande, Coast) per descrivere l'architettura genomica in questa popolazione precedentemente non studiata.

Obiettivo generale:

L'obiettivo generale di questo progetto è utilizzare strategie genomiche per valutare le basi molecolari delle malattie autoimmuni umane, rappresentative delle popolazioni peruviane. La diversificazione negli studi genomici è necessaria per raggiungere medicine personalizzate e collaborazione con i leader della comunità e i ricercatori locali garantiranno la partecipazione della comunità e l'impegno individuale, nonché le attività di formazione e istruzione.

Obiettivi specifici:

Obiettivo specifico 1: identificare marcatori genetici associati al rischio genetico di malattie autoimmuni nella popolazione indigena del Perù.

Obiettivo specifico 2: valutare la multiomica integrativa (genomica, epigenomica ed esposoma) del contesto ambientale associato all'autoimmunità in Perù.

Obiettivo specifico 3: caratterizzare il microbioma nei pazienti con autoimmunità in Perù.

Endpoint primario:

Il reclutamento di successo e il sequenziamento dell'intero genoma di almeno 20 famiglie multiplex con un elevato carico di autoimmunità familiare, consentendo l'identificazione e l'annotazione preliminare di varianti genetiche rare o nuove potenzialmente legate alla suscettibilità delle malattie autoimmune.